Pentacyclic adenine: a versatile and exceptionally bright fluorescent DNA base analogue

Bood, MattiasGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology,University of Gothenburg (författare)

Emissive base analogs are powerful tools for probing nucleic acids at the molecular level. Herein we describe the development and thorough characterization of pentacyclic adenine (pA), a versatile base analog with exceptional fluorescence properties. When incorporated into DNA, pA pairs selectively with thymine without perturbing the B-form structure and is among the brightest nucleobase analogs reported so far. Together with the recently established base analog acceptor qAnitro, pA allows accurate distance and orientation determination via Forster resonance energy transfer (FRET) measurements. The high brightness at emission wavelengths above 400 nm also makes it suitable for fluorescence microscopy, as demonstrated by imaging of single liposomal constructs coated with cholesterolanchored pA-dsDNA, using total internal reflection fluorescence microscopy. Finally, pA is also highly promising for two-photon excitation at 780 nm, with a brightness (5.3 GM) that is unprecedented for a base analog.

Füchtbauer, Anders Foller,1984Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)foller (författare)
Sandberg Wranne, Moa,1986Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)moasan (författare)
Ro, J. J.Pohang University of Science and Technology (författare)
Sarangamath, Sangamesh,1992Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,University of Edinburgh(Swepub:cth)sansar (författare)
El-Sagheer, A. H.Suez University (författare)
Rupert, Deborah,1986Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)rupert (författare)
Fisher, R. S. (författare)
Magennis, S. W.University of Glasgow (författare)
Jones, A. C.University of Edinburgh (författare)
Höök, Fredrik,1966Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)fredrikh (författare)
Brown, T.University Of Oxford (författare)
Kim, B. H.Pohang University of Science and Technology (författare)
Dahlen, A.AstraZeneca AB (författare)
Wilhelmsson, Marcus,1974Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)mawi (författare)
Grötli, MortenGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology,University of Gothenburg(Swepub:cth)grotli (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för kemi och molekylärbiologi (creator_code:org_t)

Ingår i:Chemical Science: Royal Society of Chemistry (RSC)9:14, s. 3494-35022041-65202041-6539

Av författaren/redakt...: Bood, Mattias; Füchtbauer, Ande ...; Sandberg Wranne, ...; Ro, J. J.; Sarangamath, San ...; El-Sagheer, A. H ...; visa fler...; Rupert, Deborah, ...; Fisher, R. S.; Magennis, S. W.; Jones, A. C.; Höök, Fredrik, 1 ...; Brown, T.; Kim, B. H.; Dahlen, A.; Wilhelmsson, Mar ...; Grötli, Morten; visa färre...

Om ämnet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.