Mycobiome diversity: high-throughput sequencing and identification of fungi.

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: AMNE:(TEKNIK OCH TEKNOLOGIER) > Mycobiome diversity...

Nilsson, R. Henrik,1976Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences (författare)

Mycobiome diversity: high-throughput sequencing and identification of fungi.

Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2018-11-15
Springer Science and Business Media LLC,2019

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/272938
https://gup.ub.gu.se/publication/272938URI
https://doi.org/10.1038/s41579-018-0116-yDOI
https://res.slu.se/id/publ/98104URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:for swepub-publicationtype

Anmärkningar

Fungi are major ecological players in both terrestrial and aquatic environments by cycling organic matter and channelling nutrients across trophic levels. High-throughput sequencing (HTS) studies of fungal communities are redrawing the map of the fungal kingdom by hinting at its enormous - and largely uncharted - taxonomic and functional diversity. However, HTS approaches come with a range of pitfalls and potential biases, cautioning against unwary application and interpretation of HTS technologies and results. In this Review, we provide an overview and practical recommendations for aspects of HTS studies ranging from sampling and laboratory practices to data processing and analysis. We also discuss upcoming trends and techniques in the field and summarize recent and noteworthy results from HTS studies targeting fungal communities and guilds. Our Review highlights the need for reproducibility and public data availability in the study of fungal communities. If the associated challenges and conceptual barriers are overcome, HTS offers immense possibilities in mycology and elsewhere.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Data- och informationsvetenskap Bioinformatik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Computer and Information Sciences Bioinformatics hsv//eng
NATURVETENSKAP Geovetenskap och miljövetenskap Klimatforskning hsv//swe
NATURAL SCIENCES Earth and Related Environmental Sciences Climate Research hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Evolutionsbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Evolutionary Biology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Annan biologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Other Biological Topics hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Botanik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Botany hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Ekologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Ecology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Mikrobiologi inom det medicinska området hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Microbiology in the medical area hsv//eng
NATURVETENSKAP Geovetenskap och miljövetenskap Oceanografi, hydrologi och vattenresurser hsv//swe
NATURAL SCIENCES Earth and Related Environmental Sciences Oceanography, Hydrology and Water Resources hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Biologisk systematik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Biological Systematics hsv//eng
LANTBRUKSVETENSKAPER Lantbruksvetenskap, skogsbruk och fiske hsv//swe
AGRICULTURAL SCIENCES Agriculture, Forestry and Fisheries hsv//eng
NATURVETENSKAP Data- och informationsvetenskap Programvaruteknik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Computer and Information Sciences Software Engineering hsv//eng
TEKNIK OCH TEKNOLOGIER Nanoteknik hsv//swe
ENGINEERING AND TECHNOLOGY Nano-technology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Zoologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Zoology hsv//eng
LANTBRUKSVETENSKAPER Veterinärmedicin hsv//swe
AGRICULTURAL SCIENCES Veterinary Science hsv//eng
NATURVETENSKAP Data- och informationsvetenskap Datavetenskap hsv//swe
NATURAL SCIENCES Computer and Information Sciences Computer Sciences hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Mikrobiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Microbiology hsv//eng
NATURVETENSKAP Geovetenskap och miljövetenskap Miljövetenskap hsv//swe
NATURAL SCIENCES Earth and Related Environmental Sciences Environmental Sciences hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Bioinformatik och systembiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Bioinformatics and Systems Biology hsv//eng
Fungi ; ecology ; nutrient cycling ; climate change ; systematics ; high-throughput sequencing ; review

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Anslan, Sten (författare)
Bahram, MohammadSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för ekologi,Department of Ecology (författare)
Wurzbacher, Christian,1980 (författare)
Baldrian, Petr (författare)
Tedersoo, Leho (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för biologi och miljövetenskap (creator_code:org_t)
Sveriges lantbruksuniversitet

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature reviews. Microbiology: Springer Science and Business Media LLC17, s. 95-1091740-15341740-1526

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature reviews. Microbiology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Nilsson, R. Henr ...; Anslan, Sten; Bahram, Mohammad; Wurzbacher, Chri ...; Baldrian, Petr; Tedersoo, Leho

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Data och informa ...; och Bioinformatik

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Geovetenskap och ...; och Klimatforskning

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Evolutionsbiolog ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Annan biologi

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Botanik

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Ekologi

visa fler...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Genetik

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Mikrobiologi ino ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Geovetenskap och ...; och Oceanografi hydr ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Biologisk system ...

LANTBRUKSVETENSKAPER: LANTBRUKSVETENSK ...; och Lantbruksvetensk ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Data och informa ...; och Programvarutekni ...

TEKNIK OCH TEKNOLOGIER: TEKNIK OCH TEKNO ...; och Nanoteknik

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Zoologi

LANTBRUKSVETENSKAPER: LANTBRUKSVETENSK ...; och Veterinärmedicin

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Data och informa ...; och Datavetenskap

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Mikrobiologi

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Geovetenskap och ...; och Miljövetenskap

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Bioinformatik oc ...

visa färre...

Artiklar i publikationen: Nature reviews. ...

Av lärosätet: Göteborgs universitet; Sveriges Lantbruksuniversitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se