Rapid method for relative gene expression determination in human tissues using automated capillary gel electrophoresis and multicolor detection

Odin, Elisabeth,1955Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för de kirurgiska disciplinerna, Avdelningen för kirurgi,Institute of Surgical Sciences, Department of Surgery (författare)

The aim of this study was to evaluate a direct and automated post-polymerase chain reaction (PCR) detection system to simultaneously determine the relative gene expression levels of nine cancer-related human genes. Total RNA was prepared from flash-frozen biopsies derived from human colorectal tumors or normal mucosa and reverse-transcribed to cDNA which was PCR-amplified using primer pairs corresponding to the studied genes. In each reaction, the forward primer was labeled with a fluorescent dye. The PCR products were pooled and an internal size standard with a uniquely colored fluorescent dye was added. The samples were then subjected to automated capillary gel electrophoresis. Fragment analysis software was used to calculate the relative gene expression using beta-actin as the reference gene. We found that automated capillary gel electrophoresis with multicolor detection is a rapid, accurate and highly reproducible method for separation and quantification of PCR-amplified cDNA.

Wettergren, Yvonne,1957Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för de kirurgiska disciplinerna, Avdelningen för kirurgi,Institute of Surgical Sciences, Department of Surgery(Swepub:gu)xwetyv (författare)
Larsson, Lars (författare)
Larsson, Per-Anders (författare)
Gustavsson, Bengt,1947Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för de kirurgiska disciplinerna, Avdelningen för kirurgi,Institute of Surgical Sciences, Department of Surgery(Swepub:gu)xguben (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för de kirurgiska disciplinerna, Avdelningen för kirurgi (creator_code:org_t)

Av författaren/redakt...: Odin, Elisabeth, ...; Wettergren, Yvon ...; Larsson, Lars; Larsson, Per-And ...; Gustavsson, Beng ...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.