Sökning: WFRF:(Boström Anders) >
Elevated pyrimidine...
Elevated pyrimidine dimer formation at distinct genomic bases underlies promoter mutation hotspots in UV-exposed cancers.
-
- Elliott, Kerryn (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin,Institute of Biomedicine
-
- Boström, Martin (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology
-
- Filges, Stefan, 1991 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Wallenberg Centre for Molecular and Translational Medicine,Sahlgrenska Cancer Center,Institute of Biomedicine, Department of Pathology
-
visa fler...
-
- Lindberg, Markus, 1989 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin,Institute of Biomedicine
-
- Van den Eynden, Jimmy, 1977 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology
-
- Ståhlberg, Anders, 1975 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Sahlgrenska Cancer Center,Wallenberg Centre for Molecular and Translational Medicine,Institute of Biomedicine, Department of Pathology
-
- Clausen, Anders R, 1979 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology
-
- Larsson, Erik, 1975 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin,Institute of Biomedicine
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2018-12-26
- 2018
- Engelska.
-
Ingår i: PLoS genetics. - : Public Library of Science (PLoS). - 1553-7404. ; 14:12
- Relaterad länk:
-
https://journals.plo...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Sequencing of whole cancer genomes has revealed an abundance of recurrent mutations in gene-regulatory promoter regions, in particular in melanoma where strong mutation hotspots are observed adjacent to ETS-family transcription factor (TF) binding sites. While sometimes interpreted as functional driver events, these mutations are commonly believed to be due to locally inhibited DNA repair. Here, we first show that low-dose UV light induces mutations preferably at a known ETS promoter hotspot in cultured cells even in the absence of global or transcription-coupled nucleotide excision repair (NER). Further, by genome-wide mapping of cyclobutane pyrimidine dimers (CPDs) shortly after UV exposure and thus before DNA repair, we find that ETS-related mutation hotspots exhibit strong increases in CPD formation efficacy in a manner consistent with tumor mutation data at the single-base level. Analysis of a large whole genome cohort illustrates the widespread contribution of this effect to recurrent mutations in melanoma. While inhibited NER underlies a general increase in somatic mutation burden in regulatory elements including ETS sites, our data supports that elevated DNA damage formation at specific genomic bases is at the core of the prominent promoter mutation hotspots seen in skin cancers, thus explaining a key phenomenon in whole-genome cancer analyses.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Elliott, Kerryn
-
Boström, Martin
-
Filges, Stefan, ...
-
Lindberg, Markus ...
-
Van den Eynden, ...
-
Ståhlberg, Ander ...
-
visa fler...
-
Clausen, Anders ...
-
Larsson, Erik, 1 ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
- Artiklar i publikationen
-
PLoS genetics
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet