Sökning: WFRF:(Salva A) >
Proteotyping bacter...
Proteotyping bacteria: Characterization, differentiation and identification of pneumococcus and other species within the Mitis Group of the genus Streptococcus by tandem mass spectrometry proteomics
-
- Karlsson, Roger, 1975 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg
-
- Gonzales-Siles, Lucia (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg
-
- Gomila, M. (författare)
- Universitat de les Illes Balears,University of the Balearic Islands
-
visa fler...
-
- Busquets, A. (författare)
- Universitat de les Illes Balears,University of the Balearic Islands
-
- Salvà-Serra, Francisco, 1989 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg
-
- Jaen-Luchoro, Daniel (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,Centre for antibiotic resistance research, CARe,University of Gothenburg
-
- Jakobsson, Hedvig E (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,Centre for antibiotic resistance research, CARe,University of Gothenburg
-
Karlsson, A. (författare)
-
- Boulund, Fredrik, 1985 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Department of Mathematical Sciences,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,University of Gothenburg
-
- Kristiansson, Erik, 1978 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Department of Mathematical Sciences,Centre for antibiotic resistance research, CARe,University of Gothenburg,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Moore, Edward R.B. 1954 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,Centre for antibiotic resistance research, CARe,University of Gothenburg
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2018-12-10
- 2018
- Engelska.
-
Ingår i: Plos One. - : Public Library of Science (PLoS). - 1932-6203. ; 13:12
- Relaterad länk:
-
https://journals.plo...
-
visa fler...
-
https://research.cha... (primary) (free)
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
https://research.cha...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- A range of methodologies may be used for analyzing bacteria, depending on the purpose and the level of resolution needed. The capability for recognition of species distinctions within the complex spectrum of bacterial diversity is necessary for progress in microbiological research. In clinical settings, accurate, rapid and cost-effective methods are essential for early and efficient treatment of infections. Characterization and identification of microorganisms, using, bottom-up proteomics, or "proteotyping", relies on recognition of species-unique or associated peptides, by tandem mass spectrometry analyses, dependent upon an accurate and comprehensive foundation of genome sequence data, allowing for differentiation of species, at amino acid-level resolution. In this study, the high resolution and accuracy of MS/MS-based proteotyping was demonstrated, through analyses of the three phylogenetically and taxonomically most closely-related species of the Mitis Group of the genus Streptococcus: i.e., the pathogenic species, Streptococcus pneumoniae (pneumococcus), and the commensal species, Streptococcus pseudopneumoniae and Streptococcus mitis. To achieve high accuracy, a genome sequence database used for matching peptides was created and carefully curated. Here, MS-based, bottom-up proteotyping was observed and confirmed to attain the level of resolution necessary for differentiating and identifying the most-closely related bacterial species, as demonstrated by analyses of species of the Streptococcus Mitis Group, even when S. pneumoniae were mixed with S. pseudopneumoniae and S. mitis, by matching and identifying more than 200 unique peptides for each species.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Infektionsmedicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Infectious Medicine (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Botanik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Botany (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biologisk systematik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biological Systematics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Mikrobiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)
Nyckelord
- acinetobacter-baumannii
- genomics
- taxonomy
- pneumoniae
- annotation
- resistance
- influenza
- parallel
- insights
- database
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
Plos One
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Karlsson, Roger, ...
-
Gonzales-Siles, ...
-
Gomila, M.
-
Busquets, A.
-
Salvà-Serra, Fra ...
-
Jaen-Luchoro, Da ...
-
visa fler...
-
Jakobsson, Hedvi ...
-
Karlsson, A.
-
Boulund, Fredrik ...
-
Kristiansson, Er ...
-
Moore, Edward R. ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Mikrobiologi ino ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Infektionsmedici ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Botanik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biologisk system ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Mikrobiologi
- Artiklar i publikationen
-
Plos One
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Chalmers tekniska högskola