SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Ashwood K.)
 

Sökning: WFRF:(Ashwood K.) > (2015-2019) > Towards a standardi...

  • Rojas-Macias, Miguel A.,1979University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology (författare)

Towards a standardized bioinformatics infrastructure for N- and O-glycomics

  • Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2019-07-22
  • Springer Science and Business Media LLC,2019

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/282836
  • https://gup.ub.gu.se/publication/282836URI
  • https://doi.org/10.1038/s41467-019-11131-xDOI
  • https://lup.lub.lu.se/record/93e00fe5-1261-46bc-b7d5-bf1c29fc3a27URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • The mass spectrometry (MS)-based analysis of free polysaccharides and glycans released from proteins, lipids and proteoglycans increasingly relies on databases and software. Here, we review progress in the bioinformatics analysis of protein-released N- and O-linked glycans (N-and O-glycomics) and propose an e-infrastructure to overcome current deficits in data and experimental transparency. This workflow enables the standardized submission of MS-based glycomics information into the public repository UniCarb-DR. It implements the MIRAGE (Minimum Requirement for A Glycomics Experiment) reporting guidelines, storage of unprocessed MS data in the GlycoPOST repository and glycan structure registration using the GlyTouCan registry, thereby supporting the development and extension of a glycan structure knowledgebase.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Mariethoz, J.University of Geneva (författare)
  • Andersson, PeterUniversity of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology (författare)
  • Jin, ChunshengUniversity of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology(Swepub:gu)xjinch (författare)
  • Venkatakrishnan, Vignesh,1987University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology(Swepub:gu)xvenvi (författare)
  • Aoki, N. P.SparqLite LLC. (författare)
  • Shinmachi, D.SparqLite LLC. (författare)
  • Ashwood, C.Medical College of Wisconsin (författare)
  • Madunic, K.Leiden University (författare)
  • Zhang, T.Leiden University (författare)
  • Miller, R. L.University of Copenhagen (författare)
  • Horlacher, O.Swiss Institute for Bioinformatics (SIB) (författare)
  • Struwe, W. B.University of Oxford (författare)
  • Watanabe, Y.Niigata University (författare)
  • Okuda, S.Niigata University (författare)
  • Levander, FredrikLund University,Lunds universitet,Institutionen för immunteknologi,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Immunotechnology,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH,National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS), SciLifeLab(Swepub:lu)tmb-fle (författare)
  • Kolarich, D.ARC Centre of Excellence for Nanoscale BioPhotonics (författare)
  • Rudd, P. M.A*Star, Bioprocessing Technology Institute (BTI) (författare)
  • Wuhrer, M.Leiden University (författare)
  • Kettner, C.Beilstein Institute for the Advancement of Chemical Sciences (författare)
  • Packer, N. H.ARC Centre of Excellence for Nanoscale BioPhotonics (författare)
  • Aoki-Kinoshita, K. F.Soka University (författare)
  • Lisacek, F.University of Geneva (författare)
  • Karlsson, N. G.University of Gothenburg (författare)
  • Göteborgs universitetInstitutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Communications: Springer Science and Business Media LLC102041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy