Phenomics reveals a novel putative chloroplast fatty acid transporter in the marine diatom Skeletonema marinoi involved in temperature acclimation

Johansson, Oskar N.,1984Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences (författare)

Diatoms are the dominant phytoplankton in temperate oceans and coastal regions and yet little is known about the genetic basis underpinning their global success. Here, we address this challenge by developing the first phenomic approach for a diatom, screening a collection of randomly mutagenized but identifiably tagged transformants. Based upon their tolerance to temperature extremes, several compromised mutants were identified revealing genes either stress related or encoding hypothetical proteins of unknown function. We reveal one of these hypothetical proteins is a novel putative chloroplast fatty acid transporter whose loss affects several fatty acids including the two omega-3, long-chain polyunsaturated fatty acids - eicosapentaenoic and docosahexaenoic acid, both of which have medical importance as dietary supplements and industrial significance in aquaculture and biofuels. This mutant phenotype not only provides new insights into the fatty acid biosynthetic pathways in diatoms but also highlights the future value of phenomics for revealing specific gene functions in these ecologically important phytoplankton.

Töpel, Mats H.,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för marina vetenskaper,Department of marine sciences(Swepub:gu)xamatl (författare)
Egardt, Jenny,1981Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences(Swepub:gu)xegaje (författare)
Pinder, Matthew I. M.,1990Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för marina vetenskaper,Department of marine sciences(Swepub:gu)xpinma (författare)
Andersson, Mats X.,1977Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences(Swepub:gu)xamatb (författare)
Godhe, Anna,1967Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för marina vetenskaper,Department of marine sciences(Swepub:gu)xgodan (författare)
Clarke, Adrian K,1964Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences(Swepub:gu)xclaad (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för biologi och miljövetenskap (creator_code:org_t)

Av författaren/redakt...: Johansson, Oskar ...; Töpel, Mats H., ...; Egardt, Jenny, 1 ...; Pinder, Matthew ...; Andersson, Mats ...; Godhe, Anna, 196 ...; visa fler...; Clarke, Adrian K ...; visa färre...

Om ämnet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.