Activation of PLAG1 and HMGA2 by gene fusions involving the transcriptional regulator gene NFIB

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: L773:1045 2257 OR L773:1098 2264 > Activation of PLAG1...

Afshari, Maryam K.Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Sahlgrenska Cancer Center,Department of Laboratory Medicine (författare)

Activation of PLAG1 and HMGA2 by gene fusions involving the transcriptional regulator gene NFIB

Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2020-08-05
Wiley,2020

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/295462
https://gup.ub.gu.se/publication/295462URI
https://doi.org/10.1002/gcc.22885DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

The pleomorphic adenoma (PA), which is the most common salivary gland neoplasm, is a benign tumor characterized by recurrent chromosome rearrangements involving 8q12 and 12q14-15. We have previously shown that thePLAG1andHMGA2oncogenes are the targets of these rearrangements. Here, we have identified previously unrecognized subsets of PAs with ins(9;8)/t(8;9) (n = 5) and ins(9;12)/t(9;12) (n = 8) and breakpoints located in the vicinity of thePLAG1andHMGA2loci. RNA-sequencing and reverse transcriptase (RT)-PCR analyses of a case with an ins(9;8) revealed a novelNFIB-PLAG1fusion in whichNFIBexon 4 is linked toPLAG1exon 3. In contrast to the developmentally regulatedPLAG1gene,NFIBwas highly expressed in normal salivary gland, indicating thatPLAG1in this case, as in other variant fusions, is activated by promoter swapping. RT-PCR analysis of three PAs with t(9;12) revealed two tumors with chimeric transcripts consisting ofHMGA2exon 4 linked toNFIBexons 9 or 3 and one case with a fusion linkingHMGA2exon 3 toNFIBexon 9. TheNFIBfusion events resulted in potent activation ofPLAG1andHMGA2. Analysis of the chromatin landscape surroundingNFIBrevealed several super-enhancers in the 5 '- and 3 '-parts of theNFIBlocus and its flanking sequences. These findings indicate thatPLAG1andHMGA2, similar toMYBin adenoid cystic carcinoma, may be activated by enhancer-hijacking events, in which super-enhancers inNFIBare translocated upstream ofPLAG1or downstream ofHMGA2. Our results further emphasize the role ofNFIBas a fusion partner to multiple oncogenes in histopathologically different types of salivary gland tumors.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Medicinsk genetik hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Medical Genetics hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Cancer och onkologi hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Cancer and Oncology hsv//eng
enhancer hijacking
gene fusion
HMGA2
NFIB
PLAG1
salivary
pleomorphic adenoma
adenoid cystic carcinoma
salivary-gland tumors
pleomorphic adenomas
chromosomal patterns
nfib
cell
histogenesis
specificity
expression
breast
Oncology
Genetics & Heredity

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Fehr, AndreGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Sahlgrenska Cancer Center,Department of Laboratory Medicine(Swepub:gu)xfehra (författare)
Nevado, PalomaGothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Cancer Center,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine(Swepub:gu)xtejpa (författare)
Andersson, Mattias K,1979Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Sahlgrenska Cancer Center,Department of Laboratory Medicine(Swepub:gu)xamatx (författare)
Stenman, Göran,1953Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Sahlgrenska Cancer Center,Department of Laboratory Medicine(Swepub:gu)xsteng (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Genes Chromosomes & Cancer: Wiley59:11, s. 652-6601045-22571098-2264

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Genes Chromosomes & Cancer (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Afshari, Maryam ...; Fehr, Andre; Nevado, Paloma; Andersson, Matti ...; Stenman, Göran, ...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

Artiklar i publikationen: Genes Chromosome ...

Av lärosätet: Göteborgs universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se