Analysis of copy number alterations reveals the lncRNA ALAL-1 as a regulator of lung cancer immune evasion

Cancer is characterized by genomic instability leading to deletion or amplification of oncogenes or tumor suppressors. However, most of the altered regions are devoid of known cancer drivers. Here, we identify lncRNAs frequently lost or amplified in cancer. Among them, we found amplified lncRNA associated with lung cancer-1 (ALAL-1) as frequently amplified in lung adenocarcinomas. ALAL-1 is also overexpressed in additional tumor types, such as lung squamous carcinoma. The RNA product of ALAL-1 is able to promote the proliferation and tumorigenicity of lung cancer cells. ALAL-1 is a TNFα- and NF-κB-induced cytoplasmic lncRNA that specifically interacts with SART3, regulating the subcellular localization of the protein deubiquitinase USP4 and, in turn, its function in the cell. Interestingly, ALAL-1 expression inversely correlates with the immune infiltration of lung squamous tumors, while tumors with ALAL-1 amplification show lower infiltration of several types of immune cells. We have thus unveiled a pro-oncogenic lncRNA that mediates cancer immune evasion, pointing to a new target for immune potentiation.

Marchese, Francesco P (författare)
González, Jovanna (författare)
Lozano, Teresa (författare)
Raimondi, Ivan (författare)
Juvvuna, Prasanna KumarGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology(Swepub:gu)xjuvpr (författare)
Abad, Amaya (författare)
Marin-Bejar, Oskar (författare)
Serizay, Jacques (författare)
Martínez, Dannys (författare)
Ajona, Daniel (författare)
Pajares, Maria Jose (författare)
Sandoval, Juan (författare)
Montuenga, Luis M (författare)
Kanduri, Chandrasekhar,1967Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology(Swepub:gu)xchaka (författare)
Lasarte, Juan J (författare)
Huarte, Maite (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi (creator_code:org_t)

Ingår i:The Journal of cell biology: Rockefeller University Press219:91540-81400021-9525

Av författaren/redakt...: Athie, Alejandro; Marchese, France ...; González, Jovann ...; Lozano, Teresa; Raimondi, Ivan; Juvvuna, Prasann ...; visa fler...; Abad, Amaya; Marin-Bejar, Osk ...; Serizay, Jacques; Martínez, Dannys; Ajona, Daniel; Pajares, Maria J ...; Sandoval, Juan; Montuenga, Luis ...; Kanduri, Chandra ...; Lasarte, Juan J; Huarte, Maite; visa färre...

Om ämnet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.