SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Yeh D)
 

Sökning: WFRF:(Yeh D) > Impact of Next-gene...

  • Benton, S. (författare)

Impact of Next-generation Sequencing on Interobserver Agreement and Diagnosis of Spitzoid Neoplasms

  • Artikel/kapitelEngelska2021

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2021-07-12
  • Ovid Technologies (Wolters Kluwer Health),2021

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/311119
  • https://gup.ub.gu.se/publication/311119URI
  • https://doi.org/10.1097/pas.0000000000001753DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Atypical Spitzoid melanocytic tumors are diagnostically challenging. Many studies have suggested various genomic markers to improve classification and prognostication. We aimed to assess whether next-generation sequencing studies using the Tempus xO assay assessing mutations in 1711 cancer-related genes and performing whole transcriptome mRNA sequencing for structural alterations could improve diagnostic agreement and accuracy in assessing neoplasms with Spitzoid histologic features. Twenty expert pathologists were asked to review 70 consultation level cases with Spitzoid features, once with limited clinical information and again with additional genomic information. There was an improvement in overall agreement with additional genomic information. Most significantly, there was increase in agreement of the diagnosis of conventional melanoma from moderate (kappa=0.470, SE=0.0105) to substantial (kappa=0.645, SE=0.0143) as measured by an average Cohen kappa. Clinical follow-up was available in all 70 cases which substantiated that the improved agreement was clinically significant. Among 3 patients with distant metastatic disease, there was a highly significant increase in diagnostic recognition of the cases as conventional melanoma with genomics (P<0.005). In one case, none of 20 pathologists recognized a tumor with BRAF and TERT promoter mutations associated with fatal outcome as a conventional melanoma when only limited clinical information was provided, whereas 60% of pathologists correctly diagnosed this case when genomic information was also available. There was also a significant improvement in agreement of which lesions should be classified in the Spitz category/WHO Pathway from an average Cohen kappa of 0.360 (SE=0.00921) to 0.607 (SE=0.0232) with genomics.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Zhao, J. F. (författare)
  • Zhang, B. (författare)
  • Bahrami, A. (författare)
  • Barnhill, R. L. (författare)
  • Busam, K. (författare)
  • Cerroni, L. (författare)
  • Cook, M. G. (författare)
  • de la FouchardiUre, A. (författare)
  • Elder, D. E. (författare)
  • Johansson, Iva,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper,Institute of Clinical Sciences(Swepub:gu)xjohiv (författare)
  • Landman, G. (författare)
  • Lazar, A. (författare)
  • LeBoit, P. (författare)
  • Lowe, L. (författare)
  • Massi, D. (författare)
  • Duncan, L. M. (författare)
  • Messina, J. (författare)
  • Mihic-Probst, D. (författare)
  • Mihm, M. C. (författare)
  • Piepkorn, M. W. (författare)
  • Schmidt, B. (författare)
  • Scolyer, R. A. (författare)
  • Shea, C. R. (författare)
  • Tetzlaff, M. T. (författare)
  • Tron, V. A. (författare)
  • Xu, X. W. (författare)
  • Yeh, I. W. (författare)
  • Yun, S. J. (författare)
  • Zembowicz, A. (författare)
  • Gerami, P. (författare)
  • Göteborgs universitetInstitutionen för kliniska vetenskaper (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:American Journal of Surgical Pathology: Ovid Technologies (Wolters Kluwer Health)45:12, s. 1597-16050147-51851532-0979

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy