SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Lundholm Karin)
 

Sökning: WFRF:(Lundholm Karin) > Clinical and biolog...

  • Thysell, ElinUmeå universitet,Patologi (författare)

Clinical and biological relevance of the transcriptomic-based prostate cancer metastasis subtypes MetA-C

  • Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2021-12-27
  • Wiley,2022

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/312874
  • https://gup.ub.gu.se/publication/312874URI
  • https://doi.org/10.1002/1878-0261.13158DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-190463URI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-466659URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • To improve treatment of metastatic prostate cancer, the biology of metastases needs to be understood. We recently described three subtypes of prostate cancer bone metastases (MetA-C), based on differential gene expression. The aim of this study was to verify the clinical relevance of these subtypes and to explore their biology and relations to genetic drivers. Freshly-frozen metastasis samples were obtained as hormone-naive (n = 17), short-term castrated (n = 21), or castration-resistant (n = 65) from a total of 67 patients. Previously published sequencing data from 573 metastasis samples were also analyzed. Through transcriptome profiling and sample classification based on a set of predefined MetA-C-differentiating genes, we found that most metastases were heterogeneous for the MetA-C subtypes. Overall, MetA was the most common subtype, while MetB was significantly enriched in castration-resistant samples and in liver metastases, and consistently associated with poor prognosis. By gene set enrichment analysis, the phenotype of MetA was described by high androgen response, protein secretion and adipogenesis, MetB by high cell cycle activity and DNA repair, and MetC by epithelial-to-mesenchymal transition and inflammation. The MetB subtype demonstrated single nucleotide variants of RB transcriptional corepressor 1 (RB1) and loss of 21 genes at chromosome 13, including RB1, but provided independent prognostic value to those genetic aberrations. In conclusion, a distinct set of gene transcripts can be used to classify prostate cancer metastases into the subtypes MetA-C. The MetA-C subtypes show diverse biology, organ tropism, and prognosis. The MetA-C classification may be used independently, or in combination with genetic markers, primarily to identify MetB patients in need of complementary therapy to conventional androgen receptor-targeting treatments.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Köhn, Linda,1979-Umeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)liaann99 (författare)
  • Semenas, JuliusUmeå universitet,Patologi(Swepub:umu)juse0005 (författare)
  • Järemo, HelenaUmeå universitet,Patologi(Swepub:umu)heja0019 (författare)
  • Freyhult, Eva,1979-Uppsala universitet,Beräkningsbiologi och bioinformatik,Institutionen för medicinska vetenskaper,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,National Bioinformatics Infrastructure Sweden(Swepub:uu)evfre192 (författare)
  • Lundholm, Marie,1974-Umeå universitet,Patologi(Swepub:umu)malu0007 (författare)
  • Thellenberg-Karlsson, Camilla,1972-Umeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)cath0005 (författare)
  • Damber, Jan-Erik,1949Gothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för urologi,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR),Institute of Clinical Sciences, Department of Urology(Swepub:gu)xdamja (författare)
  • Widmark, AndersUmeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)anwi0004 (författare)
  • Crnalic, SeadUmeå universitet,Ortopedi(Swepub:umu)secr0001 (författare)
  • Josefsson, Andreas,1979Umeå universitet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för urologi,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR),Institute of Clinical Sciences, Department of Urology,Urologi och andrologi,Wallenberg centrum för molekylär medicin vid Umeå universitet (WCMM),Department of Urology, Sahlgrenska(Swepub:umu)aasjon01 (författare)
  • Welén, Karin,1970Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för urologi,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institute of Clinical Sciences, Department of Urology,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR)(Swepub:gu)xwelka (författare)
  • Nilsson, R. Jonas A.Umeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)joni0002 (författare)
  • Bergh, AndersUmeå universitet,Patologi(Swepub:umu)anbe0010 (författare)
  • Wikström, PernillaUmeå universitet,Patologi(Swepub:umu)pewi0001 (författare)
  • Umeå universitetPatologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Molecular Oncology: Wiley16:4, s. 846-8591574-78911878-0261

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy