SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Solimena M.)
 

Sökning: WFRF:(Solimena M.) > Islet Gene View-a t...

  • Asplund, OlofLund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups (författare)

Islet Gene View-a tool to facilitate islet research

  • Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2022-08-10
  • Life Science Alliance, LLC,2022

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/318613
  • https://gup.ub.gu.se/publication/318613URI
  • https://doi.org/10.26508/lsa.202201376DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-483882URI
  • https://lup.lub.lu.se/record/6578fb3c-e71f-4d4b-ae6e-4d28314eebe8URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Characterization of gene expression in pancreatic islets and its alteration in type 2 diabetes (T2D) are vital in understanding islet function and T2D pathogenesis. We leveraged RNA sequencing and genome-wide genotyping in islets from 188 donors to create the Islet Gene View (IGW) platform to make this information easily accessible to the scientific community. Expression data were related to islet phenotypes, diabetes status, other islet-expressed genes, islet hormone-encoding genes and for expression in insulin target tissues. The IGW web application produces output graphs for a particular gene of interest. In IGW, 284 differentially expressed genes (DEGs) were identified in T2D donor islets compared with controls. Forty percent of DEGs showed cell-type enrichment and a large proportion significantly co-expressed with islet hormone-encoding genes; glucagon (GCG, 56%), amylin (IAPP, 52%), insulin (INS, 44%), and somatostatin (SST, 24%). Inhibition of two DEGs, UNC5D and SERPINE2, impaired glucose-stimulated insulin secretion and impacted cell survival in a human beta-cell model. The exploratory use of IGW could help designing more comprehensive functional follow-up studies and serve to identify therapeutic targets in T2D.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Storm, PetterLund University,Lunds universitet,Utvecklings- och regenerativ neurobiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Wallenberg Neurocentrum, Lund,Medicinska fakulteten,Developmental and Regenerative Neurobiology,Lund University Research Groups,Wallenberg Neuroscience Centre, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)med-psm (författare)
  • Chandra, V.Univ Helsinki, Fac Med, Stem Cells & Metab Res Program, Helsinki, Finland.,University of Helsinki (författare)
  • Hatem, GadLund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups(Swepub:lu)ga5503ha (författare)
  • Ottosson-Laakso, EmiliaLund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-eo_ (författare)
  • Mansour-Aly, DinaLund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups(Swepub:lu)di3053ma (författare)
  • Krus, UlrikaLund University,Lunds universitet,-lup-obsolete,Forskargrupper vid Lunds universitet,CRC, Clinical Research Centre,Medicinska fakulteten,Lund University Bioimaging Center,LUDC (Lund University Diabetes Centre)-lup-obsolete,Lund University Research Groups,CRC, Clinical Research Centre,Faculty of Medicine(Swepub:lu)medk-ufr (författare)
  • Ibrahim, H.Univ Helsinki, Fac Med, Stem Cells & Metab Res Program, Helsinki, Finland.,University of Helsinki (författare)
  • Ahlqvist, EmmaLund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups(Swepub:lu)infl-eah (författare)
  • Tuomi, TiinamaijaLund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups,Helsinki University Central Hospital,University of Helsinki(Swepub:lu)ti8736tu (författare)
  • Renström, ErikLund University,Lunds universitet,Diabetes - öpatofysiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes - Islet Patophysiology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)mphy-ere (författare)
  • Korsgren, OlleUppsala University,Uppsala universitet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin,Institute of Biomedicine,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,, Sweden.;Univ Gothenburg, Inst Biomed, Dept Clin Chem & Transfus Med, Gothenburg, Sweden.(Swepub:uu)ollekors (författare)
  • Wierup, NilsLund University,Lunds universitet,Neuroendokrin cellbiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Neuroendocrine Cell Biology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)mphy-nwi (författare)
  • Ibberson, M.SIB Swiss Inst Bioinformat, Vital IT Grp, Lausanne, Switzerland.,Swiss Institute for Bioinformatics (SIB) (författare)
  • Solimena, M.Tech Univ Dresden, Paul Langerhans Inst Dresden, Munich Univ Hosp Carl Gustav Carus, Helmholtz Ctr, Dresden, Germany.;Tech Univ Dresden, Fac Med, Dresden, Germany.;German Ctr Diabet Res DZD, Munich, Germany.;Max Planck Inst Mol Cell Biol & Genet, MPI CBG, Dresden, Germany.,German Center for Diabetes Research (författare)
  • Marchetti, P.Univ Pisa, Cisanello Univ Hosp, Dept Clin & Expt Med, Pisa, Italy.,University Hospital of Pisa (författare)
  • Wollheim, ClaesLund University,Lunds universitet,Diabetiska komplikationer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetic Complications,Lund University Research Groups,University of Geneva(Swepub:lu)med-cwe (författare)
  • Artner, IsabellaLund University,Lunds universitet,Endokrin Celldifferentiering,Forskargrupper vid Lunds universitet,Endocrine Cell Differentiation and Function,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-iba (författare)
  • Mulder, HindrikLund University,Lunds universitet,Diabetes - molekylär metabolism,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes - Molecular Metabolism,Lund University Research Groups(Swepub:lu)medk-hmu (författare)
  • Hansson, OlaLund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups,University of Helsinki(Swepub:lu)medk-oha (författare)
  • Otonkoski, T.Univ Helsinki, Fac Med, Stem Cells & Metab Res Program, Helsinki, Finland.;Helsinki Univ Hosp, Childrens Hosp, Helsinki, Finland.,University of Helsinki (författare)
  • Groop, LeifLund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups,University of Helsinki(Swepub:lu)endo-lgr (författare)
  • Prasad, Rashmi BLund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups,University of Helsinki(Swepub:lu)med-rpa (författare)
  • Translationell muskelforskningForskargrupper vid Lunds universitet (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Life Science Alliance: Life Science Alliance, LLC5:122575-1077

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy