onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/318991"
Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/318991" > A multi-layer funct...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Abstract
Ämnesord
Stäng
- A major challenge of genome-wide association studies (GWASs) is to translate phenotypic associations into biological insights. Here, we integrate a large GWAS on blood lipids involving 1.6 million individuals from five ancestries with a wide array of functional genomic datasets to discover regulatory mechanisms underlying lipid associations. We first prioritize lipid-associated genes with expression quantitative trait locus (eQTL) colocalizations and then add chromatin interaction data to narrow the search for functional genes. Polygenic enrichment analysis across 697 annotations from a host of tissues and cell types confirms the central role of the liver in lipid levels and highlights the selective enrichment of adipose-specific chromatin marks in high-density lipoprotein cholesterol and triglycerides. Overlapping transcription factor (TF) binding sites with lipid-associated loci identifies TFs relevant in lipid biology. In addition, we present an integrative framework to prioritize causal variants at GWAS loci, producing a comprehensive list of candidate causal genes and variants with multiple layers of functional evidence. We highlight two of the prioritized genes, CREBRF and RRBP1, which show convergent evidence across functional datasets supporting their roles in lipid biology.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Nyckelord
- integrative analysis
- wide association
- 3d genome
- variants
- cholesterol
- annotation
- obesity
- common
- loci
- expression
- Genetics & Heredity
- complex traits
- fine-mapping
- functional genomics
- lipid biology
- post-GWAS
- regulatory mechanism
- variant prioritization
- lipid
- chromatin
- genetics
- genome-wide association study
- genomics
- human
- single nucleotide polymorphism
- Chromatin
- Genome-Wide Association Study
- Genomics
- Humans
- Lipids
- Polymorphism, Single Nucleotide
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
- American Journal of Human Genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Ramdas, S.
- Judd, J.
- Graham, S. E.
- Kanoni, S.
- Wang, Y. X.
- Surakka, I.
- visa fler...
- Wenz, B.
- Lind, Lars
- Chesi, A.
- Wells, A.
- Bhatti, K. F.
- Vedantam, S.
- Winkler, T. W.
- Locke, A. E.
- Marouli, E.
- Zajac, G. J. M.
- Wu, K. H. H.
- Ntalla, I.
- Hui, Q.
- Klarin, D.
- Hilliard, A. T.
- Wang, Z. Y.
- Xue, C.
- Thorleifsson, G.
- Helgadottir, A.
- Gudbjartsson, D. ...
- Holm, H.
- Olafsson, I.
- Hwang, M. Y.
- Han, S.
- Akiyama, M.
- Sakaue, S.
- Terao, C.
- Kanai, M.
- Zhou, W.
- Brumpton, B.
- Rasheed, H.
- Havulinna, A. S.
- Veturi, Y.
- Pacheco, J. A.
- Rosenthal, E. A.
- Lingren, T.
- Feng, Q. P.
- Kullo, I. J.
- Narita, A.
- Takayama, J.
- Martin, H. C.
- Kurbasic, A.
- Trivedi, B.
- Haessler, J.
- Giulianini, F.
- Bradford, Y.
- Miller, J. E.
- Campbell, A.
- Lin, K.
- Millwood, I. Y.
- Rasheed, A.
- Hindy, G.
- Faul, J. D.
- Zhao, W.
- Weir, D. R.
- Turman, C.
- Huang, H. Y.
- Graff, M.
- Choudhury, A.
- Sengupta, D.
- Mahajan, A.
- Brown, M. R.
- Zhang, W. H.
- Yu, K. T.
- Schmidt, E. M.
- Pandit, A.
- Gustafsson, Stef ...
- Yin, X. Y.
- Luan, J. A.
- Zhao, J. H.
- Matsuda, F.
- Jang, H. M.
- Yoon, K.
- Medina-Gomez, C.
- Pitsillides, A.
- Hottenga, J. J.
- Wood, A. R.
- Ji, Y. J.
- Gao, Z. S.
- Haworth, S.
- Mitchell, R. E.
- Chai, J. F.
- Aadahl, M.
- Bjerregaard, A. ...
- Yao, J.
- Manichaikul, A.
- Lee, W. J.
- Hsiung, C. A.
- Warren, H. R.
- Ramirez, J.
- Bork-Jensen, J.
- Karhus, L. L.
- Goel, A.
- Sabater-Lleal, M ...
- Noordam, R.
- Mauro, P.
- Matteo, F.
- McDaid, A. F.
- Marques-Vidal, P ...
- Wielscher, M.
- Trompet, S.
- Sattar, N.
- Mollehave, L. T.
- Munz, M.
- Zeng, L. Y.
- Huang, J. F.
- Yang, B.
- Poveda, A.
- Schonherr, S.
- Forer, L.
- Scholz, M.
- Galesloot, T. E.
- Bradfield, J. P.
- Ruotsalainen, S. ...
- Daw, E. W.
- Zmuda, J. M.
- Mitchell, J. S.
- Fuchsberger, C.
- Christensen, H.
- Brody, J. A.
- Le, P.
- Feitosa, M. F.
- Wojczynski, M. K ...
- Hemerich, D.
- Preuss, M.
- Mangino, M.
- Christofidou, P.
- Verweij, N.
- Benjamins, J. W.
- Engmann, J.
- Noah, T. L.
- Verma, A.
- Slieker, R. C.
- Lo, K. S.
- Zilhao, N. R.
- Kleber, M. E.
- Delgado, G. E.
- Huo, S. F.
- Ikeda, D. D.
- Iha, H.
- Yang, J.
- Liu, J.
- Demirkan, A.
- Leonard, H. L.
- Marten, J.
- Emmel, C.
- Schmidt, B.
- Smyth, L. J.
- Canadas-Garre, M ...
- Wang, C. L.
- Nakatochi, M.
- Wong, A.
- Hutri-Kahonen, N ...
- Sim, X. L.
- Xia, R.
- Huerta-Chagoya, ...
- Fernandez-Lopez, ...
- Lyssenko, V.
- Nongmaithem, S. ...
- Sankareswaran, A ...
- Irvin, M. R.
- Oldmeadow, C.
- Kim, H. N.
- Ryu, S.
- Timmers, Prhj
- Arbeeva, L.
- Dorajoo, R.
- Lange, L. A.
- Prasad, G.
- Lores-Motta, L.
- Pauper, M.
- Long, J. R.
- Li, X. H.
- Theusch, E.
- Takeuchi, F.
- Spracklen, C. N.
- Loukola, A.
- Bollepalli, S.
- Warner, S. C.
- Wei, W. B.
- Nutile, T.
- Ruggiero, D.
- Sung, Y. J.
- Chen, S. F.
- Liu, F. C.
- Yang, J. Y.
- Kentistou, K. A.
- Banas, B.
- Morgan, A.
- Meidtner, K.
- Bielak, L. F.
- Smith, J. A.
- Hebbar, P.
- Farmaki, A. E.
- Hofer, E.
- Lin, M. X.
- Concas, M. P.
- Vaccargiu, S.
- van der Most, P. ...
- Pitkanen, N.
- Cade, B. E.
- van der Laan, S. ...
- Chitrala, K. N.
- Weiss, S.
- Bentley, A. R.
- Doumatey, A. P.
- Adeyemo, A. A.
- Lee, J. Y.
- Petersen, E. R. ...
- Nielsen, A. A.
- Choi, H. S.
- Nethander, Maria ...
- Freitag-Wolf, S.
- Southam, L.
- Rayner, N. W.
- Wang, C. A.
- Lin, S. Y.
- Wang, J. S.
- Couture, C.
- Lyytikainen, L. ...
- Nikus, K.
- Cuellar-Partida, ...
- Vestergaard, H.
- Hidalgo, B.
- Giannakopoulou, ...
- Cai, Q. Y.
- Obura, M. O.
- van Setten, J.
- He, K. Y.
- Tang, H.
- Terzikhan, N.
- Shin, J. H.
- Jackson, R. D.
- Reiner, A. P.
- Martin, L. W.
- Chen, Z. M.
- Li, L. M.
- Kawaguchi, T.
- Thiery, J.
- Bis, J. C.
- Launer, L. J.
- Li, H. X.
- Nalls, M. A.
- Raitakari, O. T.
- Ichihara, S.
- Wild, S. H.
- Nelson, C. P.
- Campbell, H.
- Jager, S.
- Nabika, T.
- Al-Mulla, F.
- Niinikoski, H.
- Braund, P. S.
- Kolcic, I.
- Kovacs, P.
- Giardoglou, T.
- Katsuya, T.
- de Kleijn, D.
- de Borst, G. J.
- Kim, E. K.
- Adams, H. H. H.
- Ikram, M. A.
- Zhu, X. F.
- Asselbergs, F. W ...
- Kraaijeveld, A. ...
- Beulens, J. W. J ...
- Shu, X. O.
- Rallidis, L. S.
- Pedersen, O.
- Hansen, T.
- Mitchell, P.
- Hewitt, A. W.
- Kahonen, M.
- Perusse, L.
- Bouchard, C.
- Tonjes, A.
- Chen, Y. D. I.
- Pennell, C. E.
- Mori, T. A.
- Lieb, W.
- Franke, A.
- Ohlsson, Claes, ...
- Mellström, Dan, ...
- Cho, Y. S.
- Lee, H.
- Yuan, J. M.
- Koh, W. P.
- Rhee, S. Y.
- Woo, J. T.
- Heid, I. M.
- Stark, K. J.
- Zimmermann, M. E ...
- Volzke, H.
- Homuth, G.
- Evans, M. K.
- Zonderman, A. B.
- Polasek, O.
- Pasterkamp, G.
- Ingelsson, Erik, ...
- Redline, S.
- Pahkala, K.
- Oldehinkel, A. J ...
- Snieder, H.
- Biino, G.
- Schmidt, R.
- Schmidt, H.
- Bandinelli, S.
- Dedoussis, G.
- Thanaraj, T. A.
- Peyser, P. A.
- Kato, N.
- Schulze, M. B.
- Girotto, G.
- Boger, C. A.
- Jung, B.
- Joshi, P. K.
- Bennett, D. A.
- De Jager, P. L.
- Lu, X. F.
- Mamakou, V.
- Brown, M.
- Caulfield, M. J.
- Munroe, P. B.
- Guo, X. Q.
- Ciullo, M.
- Jonas, J. B.
- Samani, N. J.
- Kaprio, J.
- Franks, P.W.
- Tusie-Luna, T.
- Aguilar-Salinas, ...
- Adair, L. S.
- Bechayda, S. A.
- de Silva, H. J.
- Wickremasinghe, ...
- Krauss, R. M.
- Wu, J. Y.
- Zheng, W.
- den Hollander, A ...
- Bharadwaj, D.
- Correa, A.
- Wilson, J. G.
- Lind, L.
- Heng, C. K.
- Nelson, A. E.
- Golightly, Y. M.
- Wilson, J. F.
- Penninx, B.
- Kim, H. L.
- Attia, J.
- Scott, R. J.
- Rao, D. C.
- Arnett, D. K.
- Walker, M.
- Scott, L. J.
- Koistinen, H. A.
- Chandak, G. R.
- Mercader, J. M.
- Villalpando, C. ...
- Orozco, L.
- Fornage, M.
- Tai, E. S.
- van Dam, R. M.
- Lehtimaki, T.
- Chaturvedi, N.
- Yokota, M.
- Liu, J. J.
- Reilly, D. F.
- McKnight, A. J.
- Kee, F.
- Jockel, K. H.
- McCarthy, M. I.
- Palmer, C. N. A.
- Vitart, V.
- Hayward, C.
- Simonsick, E.
- van Duijn, C. M.
- Jin, Z. B.
- Lu, F.
- Hishigaki, H.
- Lin, X.
- Marz, W.
- Gudnason, V.
- Tardif, J. C.
- Lettre, G.
- Hart, L. M. T.
- Elders, P. J. M.
- Rader, D. J.
- Damrauer, S. M.
- Kumari, M.
- Kivimaki, M.
- van der Harst, P ...
- Spector, T. D.
- Loos, R. J. F.
- Province, M. A.
- Parra, E. J.
- Cruz, M.
- Psaty, B. M.
- Brandslund, I.
- Pramstaller, P. ...
- Rotimi, C. N.
- Christensen, K.
- Ripatti, S.
- Widen, E.
- Hakonarson, H.
- Grant, S. F. A.
- Kiemeney, L.
- de Graaf, J.
- Loeffler, M.
- Kronenberg, F.
- Gu, D. F.
- Erdmann, J.
- Schunkert, H.
- Franks, P. W.
- Linneberg, A.
- Jukema, J. W.
- Khera, A. V.
- Mannikko, M.
- Jarvelin, M. R.
- Kutalik, Z.
- Francesco, C.
- Mook-Kanamori, D ...
- van Dijk, K. W.
- Watkins, H.
- Strachan, D. P.
- Grarup, N.
- Sever, P.
- Poulter, N.
- Sheu, W. H. H.
- Rotter, J. I.
- Dantoft, T. M.
- Karpe, F.
- Neville, M. J.
- Timpson, N. J.
- Cheng, C. Y.
- Wong, T. Y.
- Khor, C. C.
- Li, H. T.
- Sabanayagam, C.
- Peters, A.
- Gieger, C.
- Hattersley, A. T ...
- Pedersen, N. L.
- Magnusson, P. K. ...
- Boomsma, D. I.
- de Geus, E. J. C ...
- Cupples, L. A.
- van Meurs, J. B. ...
- Ikram, A.
- Ghanbari, M.
- Gordon-Larsen, P ...
- Huang, W.
- Kim, Y. J.
- Tabara, Y.
- Wareham, N. J.
- Langenberg, C.
- Zeggini, E.
- Tuomilehto, J.
- Kuusisto, J.
- Laakso, M.
- Ingelsson, E.
- Abecasis, G.
- Chambers, J. C.
- Kooner, J. S.
- de Vries, P. S.
- Morrison, A. C.
- Hazelhurst, S.
- Ramsay, M.
- North, K. E.
- Daviglus, M.
- Kraft, P.
- Martin, N. G.
- Whitfield, J. B.
- Abbas, S.
- Saleheen, D.
- Walters, R. G.
- Holmes, M. V.
- Black, C.
- Smith, B. H.
- Baras, A.
- Justice, A. E.
- Buring, J. E.
- Ridker, P. M.
- Chasman, D. I.
- Kooperberg, C.
- Tamiya, G.
- Yamamoto, M.
- van Heel, D. A.
- Trembath, R. C.
- Wei, W. Q.
- Jarvik, G. P.
- Namjou, B.
- Hayes, M. G.
- Ritchie, M. D.
- Jousilahti, P.
- Salomaa, V.
- Hveem, K.
- Asvold, B. O.
- Kubo, M.
- Kamatani, Y.
- Okada, Y.
- Murakami, Y.
- Kim, B. J.
- Thorsteinsdottir ...
- Stefansson, K.
- Zhang, J. F.
- Chen, Y. E.
- Ho, Y. L.
- Lynch, J. A.
- Tsao, P. S.
- Chang, K. M.
- Cho, K.
- O'Donnell, C. J.
- Gaziano, J. M.
- Wilson, P.
- Mohlke, K. L.
- Frayling, T. M.
- Hirschhorn, J. N ...
- Kathiresan, S.
- Boehnke, M.
- Grant, S.
- Natarajan, P.
- Sun, Y. V.
- Morris, A. P.
- Deloukas, P.
- Peloso, G.
- Assimes, T. L.
- Willer, C. J.
- Zhu, X.
- Brown, C. D.
- visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Genetik
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Medicinska och f ...
- och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
- American Journal ...
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
