Sökning: WFRF:(Szikora I) >
Potential Biomarker...
Potential Biomarkers of Acute Ischemic Stroke Etiology Revealed by Mass Spectrometry-Based Proteomic Characterization of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Blood Clots
-
Rossi, R. (författare)
-
Mereuta, O. M. (författare)
-
Barbachan e Silva, M. (författare)
-
visa fler...
-
Molina Gil, S. (författare)
-
Douglas, A. (författare)
-
Pandit, A. (författare)
-
Gilvarry, M. (författare)
-
McCarthy, R. (författare)
-
O'Connell, S. (författare)
-
Tierney, C. (författare)
-
Psychogios, K. (författare)
-
Tsivgoulis, G. (författare)
-
Szikora, I. (författare)
-
- Tatlisumak, Turgut (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Clinical Neuroscience
-
- Rentzos, Alexandros, 1979 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för radiologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Radiology
-
Thornton, J. (författare)
-
Ó Broin, P. (författare)
-
Doyle, K. M. (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2022-04-19
- 2022
- Engelska.
-
Ingår i: Frontiers in Neurology. - : Frontiers Media SA. - 1664-2295. ; 13
- Relaterad länk:
-
https://gup.ub.gu.se...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.3...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Background and Aims: Besides the crucial role in the treatment of acute ischemic stroke (AIS), mechanical thrombectomy represents a unique opportunity for researchers to study the retrieved clots, with the possibility of unveiling biological patterns linked to stroke pathophysiology and etiology. We aimed to develop a shotgun proteomic approach to study and compare the proteome of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) cardioembolic and large artery atherosclerotic (LAA) clots. Methods: We used 16 cardioembolic and 15 LAA FFPE thrombi from 31 AIS patients. The thrombus proteome was analyzed by label-free quantitative liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). MaxQuant v1.5.2.8 and Perseus v.1.6.15.0 were used for bioinformatics analysis. Protein classes were identified using the PANTHER database and the STRING database was used to predict protein interactions. Results: We identified 1,581 protein groups as part of the AIS thrombus proteome. Fourteen significantly differentially abundant proteins across the two etiologies were identified. Four proteins involved in the ubiquitin-proteasome pathway, blood coagulation or plasminogen activating cascade were identified as significantly abundant in LAA clots. Ten proteins involved in the ubiquitin proteasome-pathway, cytoskeletal remodeling of platelets, platelet adhesion or blood coagulation were identified as significantly abundant in cardioembolic clots. Conclusion: Our results outlined a set of 14 proteins for a proof-of-principle characterization of cardioembolic and LAA FFPE clots, advancing the proteome profile of AIS human thrombi and understanding the pathophysiology of ischemic stroke.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine (hsv//eng)
Nyckelord
- biomarkers stroke etiology
- FFPE proteomics
- mass spectrometry proteomics
- stroke biomarkers
- thrombus proteome
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Rossi, R.
-
Mereuta, O. M.
-
Barbachan e Silv ...
-
Molina Gil, S.
-
Douglas, A.
-
Pandit, A.
-
visa fler...
-
Gilvarry, M.
-
McCarthy, R.
-
O'Connell, S.
-
Tierney, C.
-
Psychogios, K.
-
Tsivgoulis, G.
-
Szikora, I.
-
Tatlisumak, Turg ...
-
Rentzos, Alexand ...
-
Thornton, J.
-
Ó Broin, P.
-
Doyle, K. M.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
- Artiklar i publikationen
-
Frontiers in Neu ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet