SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Rosén Emil)
 

Sökning: WFRF:(Rosén Emil) > Inference of gliobl...

  • Rosén, EmilUppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden. (författare)

Inference of glioblastoma migration and proliferation rates using single time-point images

  • Artikel/kapitelEngelska2023

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Springer Nature,2023

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/327591
  • https://gup.ub.gu.se/publication/327591URI
  • https://doi.org/10.1038/s42003-023-04750-0DOI
  • https://research.chalmers.se/publication/535487URI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-502114URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Cancer cell migration is a driving mechanism of invasion in solid malignant tumors. Anti-migratory treatments provide an alternative approach for managing disease progression. However, we currently lack scalable screening methods for identifying novel anti-migratory drugs. To this end, we develop a method that can estimate cell motility from single end-point images in vitro by estimating differences in the spatial distribution of cells and inferring proliferation and diffusion parameters using agent-based modeling and approximate Bayesian computation. To test the power of our method, we use it to investigate drug responses in a collection of 41 patient-derived glioblastoma cell cultures, identifying migration-associated pathways and drugs with potent anti-migratory effects. We validate our method and result in both in silico and in vitro using time-lapse imaging. Our proposed method applies to standard drug screen experiments, with no change needed, and emerges as a scalable approach to screen for anti-migratory drugs. The spatial positioning of cultured glioblastoma cells is used to estimate cell motility and drug effects from single end-point images in vitro.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Mangukiya, Hitesh,ResearcherUppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden.(Swepub:uu)manhi588 (författare)
  • Elfineh, LioudmilaUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Uppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden.(Swepub:uu)liouelfi (författare)
  • Stockgard, R.Uppsala universitet,Neuroonkologi och neurodegeneration,Uppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden. (författare)
  • Krona, Cecilia,1976-Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Uppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden.(Swepub:uu)ceckr429 (författare)
  • Gerlee, Philip,1980Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper,Department of Mathematical Sciences,University of Gothenburg,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,Chalmers Univ Technol, Math Sci, Gothenburg, Sweden.;Univ Gothenburg, Math Sci, Gothenburg, Sweden.(Swepub:cth)gerlee (författare)
  • Nelander, SvenUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Neuroonkologi och neurodegeneration,Uppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden.(Swepub:uu)svene843 (författare)
  • Uppsala universitetUppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Communications Biology: Springer Nature6:12399-3642

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy