Sökning: (WFRF:(Westerbergh Johan))
> (2023) >
High-quality annota...
-
Fagman, ErikaGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för radiologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Radiology,Sahlgrenska universitetssjukhuset,Sahlgrenska University Hospital,University of Gothenburg,Univ Gothenburg, Inst Clin Sci, Dept Radiol, Gothenburg, Sweden.;Sahlgrens Univ Hosp, Dept Radiol, Gothenburg, Sweden.
(författare)
High-quality annotations for deep learning enabled plaque analysis in SCAPIS cardiac computed tomography angiography
- Artikel/kapitelEngelska2023
Förlag, utgivningsår, omfång ...
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/328617
-
https://gup.ub.gu.se/publication/328617URI
-
https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2023.e16058DOI
-
https://research.chalmers.se/publication/535874URI
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-511127URI
-
https://lup.lub.lu.se/record/d9d8166c-2676-4179-b044-551abbd643fdURI
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-197907URI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:153570687URI
Kompletterande språkuppgifter
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Funding Agencies|VINNOVA to the "SCAPIS AI platform"; Swedish Heart and Lung Foundation; Knut and Alice Wallenberg Foundation; Swedish Research Council and VINNOVA; Heart and Lung foundation [20180324]; Swedish Research Council [2019-01140]; LUA/ALF [ALFGBG-718851]
-
Background: Plaque analysis with coronary computed tomography angiography (CCTA) is a promising tool to identify high risk of future coronary events. The analysis process is time-consuming, and requires highly trained readers. Deep learning models have proved to excel at similar tasks, however, training these models requires large sets of expert-annotated training data. The aims of this study were to generate a large, high-quality annotated CCTA dataset derived from Swedish CArdioPulmonary BioImage Study (SCAPIS), report the reproducibility of the annotation core lab and describe the plaque characteristics and their association with established risk factors.Methods and results: The coronary artery tree was manually segmented using semi-automatic software by four primary and one senior secondary reader. A randomly selected sample of 469 subjects, all with coronary plaques and stratified for cardiovascular risk using the Systematic Coronary Risk Evaluation (SCORE), were analyzed. The reproducibility study (n = 78) showed an agreement for plaque detection of 0.91 (0.84-0.97). The mean percentage difference for plaque volumes was-0.6% the mean absolute percentage difference 19.4% (CV 13.7%, ICC 0.94). There was a positive correlation between SCORE and total plaque volume (rho = 0.30, p < 0.001) and total low attenuation plaque volume (rho = 0.29, p < 0.001).Conclusions: We have generated a CCTA dataset with high-quality plaque annotations showing good reproducibility and an expected correlation between plaque features and cardiovascular risk. The stratified data sampling has enriched high-risk plaques making the data well suited as training, validation and test data for a fully automatic analysis tool based on deep learning.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Alvén, Jennifer,1989Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,University of Gothenburg,Univ Gothenburg, Inst Med, Dept Mol & Clin Med, Gothenburg, Sweden.;Chalmers Univ Technol, Dept Elect Engn, Comp Vis & Med Image Anal, Gothenburg, Sweden.(Swepub:cth)alven
(författare)
-
Westerbergh, JohanUppsala University,Uppsala universitet,Uppsala kliniska forskningscentrum (UCR),Uppsala Univ, Sweden(Swepub:uu)johwe257
(författare)
-
Kitslaar, P.Med Med Imaging Syst BV, Leiden, Netherlands.
(författare)
-
Kercsik, MikaelGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,University of Gothenburg,Univ Gothenburg, Inst Med, Dept Mol & Clin Med, Gothenburg, Sweden.;Alingsas Hosp, Dept Radiol, Alingsas, Sweden.,Alingsås hospital(Swepub:gu)xkermi
(författare)
-
Cederlund, K.Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Sweden
(författare)
-
Duvernoy, OlovUppsala University,Uppsala universitet,Radiologi,Uppsala Univ, Sweden(Swepub:uu)olovdn
(författare)
-
Engvall, JanLinköpings universitet,Linköping University,Avdelningen för diagnostik och specialistmedicin,Medicinska fakulteten,Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV,Region Östergötland, Fysiologiska kliniken US(Swepub:liu)janen74
(författare)
-
Gonçalves, IsabelLund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - translationella studier,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Translational Studies,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital,Skane Univ Hosp, Sweden(Swepub:lu)medf-igo
(författare)
-
Markstad, HannaLund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - translationella studier,Cardiovascular Research - Epidemiology,Lund University Research Groups,Cardiovascular Research - Translational Studies,Lund Univ, Sweden(Swepub:lu)med-hmk
(författare)
-
Ostenfeld, EllenLund University,Lunds universitet,Klinisk fysiologi, Lund,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Hjärt-MR-gruppen i Lund,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Physiology (Lund),Section V,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Lund Cardiac MR Group,Lund University Research Groups,Lund Univ, Sweden(Swepub:lu)medf-eos
(författare)
-
Bergström, Göran,1964Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,University of Gothenburg,Sahlgrenska universitetssjukhuset,Sahlgrenska University Hospital,Univ Gothenburg, Inst Med, Dept Mol & Clin Med, Gothenburg, Sweden.;Sahlgrens Univ Hosp, Dept Clin Physiol, Gothenburg, Sweden.(Swepub:gu)xbgort
(författare)
-
Hjelmgren, OlaGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,Sahlgrenska universitetssjukhuset,Sahlgrenska University Hospital,University of Gothenburg,Univ Gothenburg, Inst Med, Dept Mol & Clin Med, Gothenburg, Sweden.;Sahlgrens Univ Hosp, Dept Clin Physiol, Gothenburg, Sweden.(Swepub:gu)xhjelo
(författare)
-
Göteborgs universitetInstitutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för radiologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Heliyon: Elsevier BV9:52405-8440
Internetlänk
Hitta via bibliotek
-
Heliyon
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Fagman, Erika
-
Alvén, Jennifer, ...
-
Westerbergh, Joh ...
-
Kitslaar, P.
-
Kercsik, Mikael
-
Cederlund, K.
-
visa fler...
-
Duvernoy, Olov
-
Engvall, Jan
-
Gonçalves, Isabe ...
-
Markstad, Hanna
-
Ostenfeld, Ellen
-
Bergström, Göran ...
-
Hjelmgren, Ola
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Kardiologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Radiologi och bi ...
-
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER
-
TEKNIK OCH TEKNO ...
-
och Medicinteknik
-
och Medicinsk bildbe ...
- Artiklar i publikationen
-
Heliyon
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Chalmers tekniska högskola
-
Uppsala universitet
-
Lunds universitet
-
Linköpings universitet
-
Karolinska Institutet