Post-GWAS multiomic functional investigation of the TNIP1 locus in Alzheimer's disease highlights a potential role for GPX3

INTRODUCTION Recent genome-wide association studies (GWAS) have reported a genetic association with Alzheimer's disease (AD) at the TNIP1/GPX3 locus, but the mechanism is unclear. METHODS We used cerebrospinal fluid (CSF) proteomics data to test (n = 137) and replicate (n = 446) the association of glutathione peroxidase 3 (GPX3) with CSF biomarkers (including amyloid and tau) and the GWAS-implicated variants (rs34294852 and rs871269). RESULTS CSF GPX3 levels decreased with amyloid and tau positivity (analysis of variance P = 1.5 x 10(-5)) and higher CSF phosphorylated tau (p-tau) levels (P = 9.28 x 10(-7)). The rs34294852 minor allele was associated with decreased GPX3 (P = 0.041). The replication cohort found associations of GPX3 with amyloid and tau positivity (P = 2.56 x 10(-6)) and CSF p-tau levels (P = 4.38 x 10(-9)). DISCUSSION These results suggest variants in the TNIP1 locus may affect the oxidative stress response in AD via altered GPX3 levels.

Reus, Lianne M. (författare)
Ali, Muhammad (författare)
Liu, Jihua (författare)
Deming, Yuetiva K. (författare)
Lu, Qiongshi (författare)
Kollmorgen, Gwendlyn (författare)
Carboni, Margherita (författare)
Wild, Norbert (författare)
Visser, Pieter J. (författare)
Bertram, Lars (författare)
Zetterberg, Henrik,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi,Institute of Neuroscience and Physiology(Swepub:gu)xzethe (författare)
Blennow, Kaj,1958Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi,Institute of Neuroscience and Physiology(Swepub:gu)xbleka (författare)
Gobom, JohanGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi,Institute of Neuroscience and Physiology(Swepub:gu)xgobjo (författare)
Western, Dan (författare)
Sung, Yun Ju (författare)
Carlsson, Cynthia M. (författare)
Johnson, Sterling C. (författare)
Asthana, Sanjay (författare)
Cruchaga, Carlos (författare)
Tijms, Betty M. (författare)
Engelman, Corinne D. (författare)
Snyder, Michael P. (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för neurovetenskap och fysiologi (creator_code:org_t)

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Neurologi

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.