SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Extended search

id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/336885"
 

Search: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/336885" > Large-scale plasma ...

  • 1 of 1
  • Previous record
  • Next record
  •    To hitlist
  • Royer, PatrickGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine (author)

Large-scale plasma proteomics in the UK Biobank modestly improves prediction of major cardiovascular events in a population without previous cardiovascular disease

  • Article/chapterEnglish2024

Publisher, publication year, extent ...

  • 2024

Numbers

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/336885
  • https://gup.ub.gu.se/publication/336885URI
  • https://doi.org/10.1093/eurjpc/zwae124DOI

Supplementary language notes

  • Language:English

Part of subdatabase

Classification

  • Subject category:ref swepub-contenttype
  • Subject category:art swepub-publicationtype

Notes

  • [ ' A i m s I m p r o v e d i d e n t i f i c a t i o n o f i n d i v i d u a l s a t h i g h r i s k o f d e v e l o p i n g c a r d i o v a s c u l a r d i s e a s e w o u l d e n a b l e t a r g e t e d i n t e r v e n t i o n s a n d p o t e n t i a l l y l e a d t o r e d u c t i o n s i n m o r t a l i t y a n d m o r b i d i t y . O u r a i m w a s t o d e t e r m i n e w h e t h e r u s e o f l a r g e - s c a l e p r o t e o m i c s i m p r o v e s p r e d i c t i o n o f c a r d i o v a s c u l a r e v e n t s b e y o n d t r a d i t i o n a l r i s k f a c t o r s ( T R F s ) . M e t h o d s a n d r e s u l t s U s i n g p r o x i m i t y e x t e n s i o n a s s a y s , 2 9 1 9 p l a s m a p r o t e i n s w e r e m e a s u r e d i n 3 8 3 8 0 p a r t i c i p a n t s o f t h e U K B i o b a n k . B o t h d a t a - a n d l i t e r a t u r e - b a s e d f e a t u r e s e l e c t i o n a n d t r a i n e d m o d e l s u s i n g e x t r e m e g r a d i e n t b o o s t i n g m a c h i n e l e a r n i n g w e r e u s e d t o p r e d i c t r i s k o f m a j o r c a r d i o v a s c u l a r e v e n t s ( M A C E s : f a t a l a n d n o n - f a t a l m y o c a r d i a l i n f a r c t i o n , s t r o k e , a n d c o r o n a r y a r t e r y r e v a s c u l a r i z a t i o n ) d u r i n g a 1 0 - y e a r f o l l o w - u p . A r e a u n d e r t h e c u r v e ( A U C ) a n d n e t r e c l a s s i f i c a t i o n i n d e x ( N R I ) w e r e u s e d t o e v a l u a t e t h e a d d i t i v e v a l u e o f s e l e c t e d p r o t e i n p a n e l s t o M A C E p r e d i c t i o n b y S y s t e m a t i c C O r o n a r y R i s k E v a l u a t i o n 2 ( S C O R E 2 ) o r t h e 1 0 T R F s u s e d i n S C O R E 2 . S C O R E 2 a n d S C O R E 2 r e f i t t e d t o U K B i o b a n k d a t a p r e d i c t e d M A C E w i t h A U C s o f 0 . 7 4 0 a n d 0 . 7 4 9 , r e s p e c t i v e l y . D a t a - d r i v e n s e l e c t i o n i d e n t i f i e d 1 1 4 p r o t e i n s o f g r e a t e s t r e l e v a n c e f o r p r e d i c t i o n . P r e d i c t i o n o f M A C E w a s n o t i m p r o v e d b y u s i n g t h e s e p r o t e i n s a l o n e ( A U C o f 0 . 7 5 8 ) b u t w a s s i g n i f i c a n t l y i m p r o v e d b y c o m b i n i n g t h e s e p r o t e i n s w i t h S C O R E 2 o r t h e 1 0 T R F s ( A U C = 0 . 7 7 1 , P < 0 0 1 , N R I = 0 . 1 4 0 , a n d A U C = 0 . 7 6 7 , P = 0 . 0 3 , N R I 0 . 0 5 3 , r e s p e c t i v e l y ) . L i t e r a t u r e - b a s e d p r o t e i n s e l e c t i o n ( 1 1 3 p r o t e i n s f r o m f i v e p r e v i o u s s t u d i e s ) a l s o i m p r o v e d r i s k p r e d i c t i o n b e y o n d T R F s w h i l e a r a n d o m s e l e c t i o n o f 1 1 4 p r o t e i n s d i d n o t . C o n c l u s i o n L a r g e - s c a l e p l a s m a p r o t e o m i c s w i t h d a t a - d r i v e n a n d l i t e r a t u r e - b a s e d p r o t e i n s e l e c t i o n m o d e s t l y i m p r o v e s p r e d i c t i o n o f f u t u r e M A C E b e y o n d T R F s . L a y s u m m a r y T h e r i s k o f h a v i n g a m y o c a r d i a l i n f a r c t i o n o r s t r o k e i s u s u a l l y a s s e s s e d b y c l i n i c a l s c o r e s i n c l u d i n g t r a d i t i o n a l r i s k f a c t o r s f o r c a r d i o v a s c u l a r d i s e a s e . T h e d e v e l o p m e n t o f n e w t e c h n o l o g i e s e n a b l e s t h e r a p i d m e a s u r e m e n t o f a n i n c r e a s i n g n u m b e r o f b l o o d p r o t e i n s . I n t h i s s t u d y , w e a p p l i e d m a c h i n e l e a r n i n g t e c h n i q u e s i n a U K - b a s e d c o h o r t o f 3 8 3 8 0 p a r t i c i p a n t s w i t h 2 9 1 9 b l o o d p r o t e i n s m e a s u r e d . W e o b t a i n e d a s e t o f 1 1 4 p r o t e i n s t h a t i m p r o v e d t h e p r e d i c t i o n o f t h e 1 0 - y e a r r i s k o f m a j o r c a r d i o v a s c u l a r e v e n t w h e n a d d e d t o t r a d i t i o n a l r i s k f a c t o r s . I m p r o v e m e n t s w e r e a l s o a c h i e v e d u s i n g a s e t o f 1 1 3 p r o t e i n s f o u n d i n p r e v i o u s s t u d i e s . H o w e v e r , t h e m a g n i t u d e o f t h e s e i m p r o v e m e n t s w a s r e l a t i v e l y l o w a n d t h e c l i n i c a l u t i l i t y o f c o m b i n i n g t h e s e p r o t e i n s w i t h t r a d i t i o n a l r i s k f a c t o r s i n p r i m a r y p r e v e n t i o n w i l l h a v e t o b e f u r t h e r i n v e s t i g a t e d . ' , ' [ G R A P H I C S ] ' , ' . ' ]

Subject headings and genre

Added entries (persons, corporate bodies, meetings, titles ...)

  • Björnson, Elias,1988Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xbelia (author)
  • Adiels, Martin,1976Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xadima (author)
  • Josefson, RebeccaGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xlinre (author)
  • Hagberg, EvaGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xhevaj (author)
  • Gummesson, Anders,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xguman (author)
  • Bergström, Göran,1964Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xbgort (author)
  • Göteborgs universitetInstitutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin (creator_code:org_t)

Related titles

  • In:EUROPEAN JOURNAL OF PREVENTIVE CARDIOLOGY2047-48732047-4881

Internet link

Find in a library

To the university's database

  • 1 of 1
  • Previous record
  • Next record
  •    To hitlist

Search outside SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Close

Copy and save the link in order to return to this view