id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/56087"
Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/56087" > Detection and typin...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
- Namvar, LillyGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för laboratoriemedicin, Avdelningen för klinisk virologi,Institute of Laboratory Medicine, Dept of Clinical Virology (författare)
Detection and typing of Herpes Simplex virus (HSV) in mucocutaneous samples by TaqMan PCR targeting a gB segment homologous for HSV types 1 and 2.
- Artikel/kapitelEngelska2005
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- 2005
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/56087
- https://gup.ub.gu.se/publication/56087URI
- https://doi.org/10.1128/JCM.43.5.2058-2064.2005DOI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- Herpes simplex virus types 1 (HSV-1) and 2 (HSV-2) are major causes of mucocutaneous lesions and severe infections of the central nervous system. Here a new semiautomated method for detecting and typing of HSV was used to analyze 479 mucocutaneous swab samples. After DNA extraction using a Magnapure LC robot, a 118-bp segment of the gB region was amplified by real-time PCR utilizing type-specific TaqMan probes to identify HSV-1 or HSV-2. HSV detection in a single well using probes labeled with carboxyfluorescein (FAM) for HSV-1 and JOE (6-carboxy-4',5'-dichloro-2',7'-dimethoxyfluorescein) for HSV-2 had a sensitivity similar to that seen in separate reactions. All but one of 217 samples (99.5%) that had been positive by virus culture were positive by TaqMan PCR, with a correct identification of type in all cases. Out of 262 samples negative by virus culture, 48 (18.3%) were positive by TaqMan PCR, with higher Ct values compared with culture positive samples (P < 0.0001). Overall, the Ct values for HSV-1 were lower than for HSV-2 (mean, 25.5 versus 27.9), but to some extent this could be due to weaker fluorescence by JOE. Lower C(t) values for HSV-1 were seen also in the 202 genital samples (79 HSV-1, 122 HSV-2, 1 HSV-1 and HSV-2), indicating that HSV-1 replicates as well as HSV-2 in the genital area. HSV-1 constituted 40% of genital infections and was associated with lower mean age (29.2 versus 36.4 years), probably reflecting the fact that recurrent genital HSV-1 infections are rare.
Ämnesord och genrebeteckningar
- Adolescent
- Adult
- Aged
- Base Sequence
- DNA Primers
- DNA
- Viral
- genetics
- isolation & purification
- Herpes Simplex
- diagnosis
- Herpesvirus 1
- Human
- classification
- genetics
- isolation & purification
- Herpesvirus 2
- Human
- classification
- genetics
- isolation & purification
- Humans
- Middle Aged
- Polymerase Chain Reaction
- methods
- Reproducibility of Results
- Sensitivity and Specificity
- Taq Polymerase
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Olofsson, Sigvard,1948Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för laboratoriemedicin, Avdelningen för klinisk virologi,Institute of Laboratory Medicine, Dept of Clinical Virology(Swepub:gu)xolosi (författare)
- Bergström, Tomas,1950Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för laboratoriemedicin, Avdelningen för klinisk virologi,Institute of Laboratory Medicine, Dept of Clinical Virology(Swepub:gu)xberto (författare)
- Lindh, Magnus,1960Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för laboratoriemedicin, Avdelningen för klinisk virologi,Institute of Laboratory Medicine, Dept of Clinical Virology(Swepub:gu)xlmagr (författare)
- Göteborgs universitetInstitutionen för laboratoriemedicin, Avdelningen för klinisk virologi (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:Journal of clinical microbiology43:5, s. 2058-640095-1137
Internetlänk
Hitta via bibliotek
- Journal of clinical microbiology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Namvar, Lilly
- Olofsson, Sigvar ...
- Bergström, Tomas ...
- Lindh, Magnus, 1 ...
- Artiklar i publikationen
- Journal of clini ...
- Av lärosätet
- Göteborgs universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
