SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Salladini Edoardo)
 

Sökning: WFRF:(Salladini Edoardo) > PED in 2021 : A maj...

  • Lazar, TamasVrije Universiteit Brussel (VUB),Flanders Interuniversity Institute for Biotechnology (författare)

PED in 2021 : A major update of the protein ensemble database for intrinsically disordered proteins

  • Artikel/kapitelEngelska2021

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2020-12-10
  • Oxford University Press (OUP),2021
  • 8 s.

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:0790a52f-a49a-4ce1-8689-4191f21881f2
  • https://lup.lub.lu.se/record/0790a52f-a49a-4ce1-8689-4191f21881f2URI
  • https://doi.org/10.1093/nar/gkaa1021DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • The Protein Ensemble Database (PED) (https://proteinensemble.org), which holds structural ensembles of intrinsically disordered proteins (IDPs), has been significantly updated and upgraded since its last release in 2016. The new version, PED 4.0, has been completely redesigned and reimplemented with cutting-edge technology and now holds about six times more data (162 versus 24 entries and 242 versus 60 structural ensembles) and a broader representation of state of the art ensemble generation methods than the previous version. The database has a completely renewed graphical interface with an interactive feature viewer for region-based annotations, and provides a series of descriptors of the qualitative and quantitative properties of the ensembles. High quality of the data is guaranteed by a new submission process, which combines both automatic and manual evaluation steps. A team of biocurators integrate structured metadata describing the ensemble generation methodology, experimental constraints and conditions. A new search engine allows the user to build advanced queries and search all entry fields including cross-references to IDP-related resources such as DisProt, MobiDB, BMRB and SASBDB. We expect that the renewed PED will be useful for researchers interested in the atomic-level understanding of IDP function, and promote the rational, structure-based design of IDP-targeting drugs.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Martínez-Pérez, ElizabethFundación Instituto Leloir,European Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
  • Quaglia, FedericaUniversity of Padova (författare)
  • Hatos, AndrásUniversity of Padova (författare)
  • Chemes, Lucía B.National University of General San Martín (författare)
  • Iserte, Javier A.Fundación Instituto Leloir (författare)
  • Méndez, Nicolás A.National University of General San Martín (författare)
  • Garrone, Nicolás A.National University of General San Martín (författare)
  • Saldaño, Tadeo E.Quilmes National University (författare)
  • Marchetti, JuliaQuilmes National University (författare)
  • Rueda, Ana Julia VelezQuilmes National University (författare)
  • Bernadó, PauUniversity of Montpellier (författare)
  • Blackledge, MartinUniversity Grenoble Alpes (författare)
  • Cordeiro, Tiago N.NOVA University Lisbon,University of Montpellier (författare)
  • Fagerberg, EricLund University,Lunds universitet,Beräkningskemi,Enheten för fysikalisk och teoretisk kemi,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Computational Chemistry,Physical and theoretical chemistry,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)er5636fa (författare)
  • Forman-Kay, Julie D.University of Toronto,Hospital for Sick Children, Toronto (författare)
  • Fornasari, Maria S.Quilmes National University (författare)
  • Gibson, Toby J.European Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
  • Gomes, Gregory Neal W.University of Toronto (författare)
  • Gradinaru, Claudiu C.University of Toronto (författare)
  • Head-Gordon, TeresaUniversity of California, Berkeley (författare)
  • Jensen, Malene RingkjøbingUniversity Grenoble Alpes (författare)
  • Lemke, Edward A.Johannes-Gutenberg University Mainz (författare)
  • Longhi, SoniaAix-Marseille University (författare)
  • Marino-Buslje, CristinaFundación Instituto Leloir (författare)
  • Minervini, GiovanniUniversity of Padova (författare)
  • Mittag, TanjaSt Jude Children´s Research Hospital, Memphis (författare)
  • Monzon, Alexander MiguelUniversity of Padova (författare)
  • Pappu, Rohit V.Washington University in St. Louis (författare)
  • Parisi, GustavoQuilmes National University (författare)
  • Ricard-Blum, SylvieInstitute for Molecular and Supramolecular Chemistry and Biochemistry (ICBMS) (författare)
  • Ruff, Kiersten M.Washington University in St. Louis (författare)
  • Salladini, EdoardoArchitecture et Fonction des Macromolécules Biologiques (AFMB) (författare)
  • Skepö, MarieLund University,Lunds universitet,Beräkningskemi,Enheten för fysikalisk och teoretisk kemi,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,LINXS - Institute of advanced Neutron and X-ray Science,Computational Chemistry,Physical and theoretical chemistry,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)fk1-mjo (författare)
  • Svergun, DmitriEuropean Molecular Biology Laboratory Hamburg (författare)
  • Vallet, Sylvain D.Institute for Molecular and Supramolecular Chemistry and Biochemistry (ICBMS) (författare)
  • Varadi, MihalyEuropean Bioinformatics Institute (författare)
  • Tompa, PeterVrije Universiteit Brussel (VUB),Flanders Interuniversity Institute for Biotechnology,Research Centre for Natural Sciences of the Hungarian Academy of Sciences (författare)
  • Tosatto, Silvio C.E.University of Padova (författare)
  • Piovesan, DamianoUniversity of Padova (författare)
  • Vrije Universiteit Brussel (VUB)Flanders Interuniversity Institute for Biotechnology (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nucleic Acids Research: Oxford University Press (OUP)49:D1, s. 404-4110305-10481362-4962

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy