Sökning: WFRF:(Woodward Eleanor L) >
Proteogenomics and ...
Proteogenomics and Hi-C reveal transcriptional dysregulation in high hyperdiploid childhood acute lymphoblastic leukemia
-
- Yang, Minjun (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Aneuploidi i cancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Aneuploidy in cancer,Lund University Research Groups
-
- Vesterlund, Mattias (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute
-
- Siavelis, Ioannis (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute
-
visa fler...
-
- Moura-Castro, Larissa H. (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Aneuploidi i cancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Aneuploidy in cancer,Lund University Research Groups
-
- Castor, Anders (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Pediatrik, Lund,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Paediatrics (Lund),Section V,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital
-
- Fioretos, Thoas (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Translationella genomiska och funktionella studier av leukemi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Genomic and Functional Studies of Leukemia,Lund University Research Groups
-
- Jafari, Rozbeh (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute
-
- Lilljebjörn, Henrik (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Translationella genomiska och funktionella studier av leukemi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Genomic and Functional Studies of Leukemia,Lund University Research Groups
-
- Odom, Duncan T. (författare)
- German Cancer Research Centre,University of Cambridge
-
- Olsson, Linda (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Genetiska och epigenetiska studier av barnleukemi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genetic and epigenetic studies of pediatric leukemia,Lund University Research Groups
-
- Ravi, Naveen (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Aneuploidi i cancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Aneuploidy in cancer,Lund University Research Groups
-
- Woodward, Eleanor L. (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Aneuploidi i cancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Aneuploidy in cancer,Lund University Research Groups
-
- Harewood, Louise (författare)
- Queen's University Belfast,University of Cambridge
-
- Lehtiö, Janne (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute
-
- Paulsson, Kajsa (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Aneuploidi i cancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Aneuploidy in cancer,Lund University Research Groups
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-04-03
- 2019
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723. ; 10:1
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Hyperdiploidy, i.e. gain of whole chromosomes, is one of the most common genetic features of childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL), but its pathogenetic impact is poorly understood. Here, we report a proteogenomic analysis on matched datasets from genomic profiling, RNA-sequencing, and mass spectrometry-based analysis of >8,000 genes and proteins as well as Hi-C of primary patient samples from hyperdiploid and ETV6/RUNX1-positive pediatric ALL. We show that CTCF and cohesin, which are master regulators of chromatin architecture, display low expression in hyperdiploid ALL. In line with this, a general genome-wide dysregulation of gene expression in relation to topologically associating domain (TAD) borders were seen in the hyperdiploid group. Furthermore, Hi-C of a limited number of hyperdiploid childhood ALL cases revealed that 2/4 cases displayed a clear loss of TAD boundary strength and 3/4 showed reduced insulation at TAD borders, with putative leukemogenic effects.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Pediatrik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Pediatrics (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Yang, Minjun
-
Vesterlund, Matt ...
-
Siavelis, Ioanni ...
-
Moura-Castro, La ...
-
Castor, Anders
-
Fioretos, Thoas
-
visa fler...
-
Jafari, Rozbeh
-
Lilljebjörn, Hen ...
-
Odom, Duncan T.
-
Olsson, Linda
-
Ravi, Naveen
-
Woodward, Eleano ...
-
Harewood, Louise
-
Lehtiö, Janne
-
Paulsson, Kajsa
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Pediatrik
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet
-
Karolinska Institutet