SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Balint F)
 

Sökning: WFRF:(Balint F) > Comprehensive DNA m...

  • Wouters, JasperCatholic University of Leuven,OncoMark Ltd (författare)

Comprehensive DNA methylation study identifies novel progression-related and prognostic markers for cutaneous melanoma

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2017-06-05
  • Springer Science and Business Media LLC,2017

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:3e3b333f-8717-496d-a457-22458c3689ee
  • https://lup.lub.lu.se/record/3e3b333f-8717-496d-a457-22458c3689eeURI
  • https://doi.org/10.1186/s12916-017-0851-3DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Background: Cutaneous melanoma is the deadliest skin cancer, with an increasing incidence and mortality rate. Currently, staging of patients with primary melanoma is performed using histological biomarkers such as tumor thickness and ulceration. As disruption of the epigenomic landscape is recognized as a widespread feature inherent in tumor development and progression, we aimed to identify novel biomarkers providing additional clinical information over current factors using unbiased genome-wide DNA methylation analyses. Methods: We performed a comprehensive DNA methylation analysis during all progression stages of melanoma using Infinium HumanMethylation450 BeadChips on a discovery cohort of benign nevi (n = 14) and malignant melanoma from both primary (n = 33) and metastatic (n = 28) sites, integrating the DNA methylome with gene expression data. We validated the discovered biomarkers in three independent validation cohorts by pyrosequencing and immunohistochemistry. Results: We identified and validated biomarkers for, and pathways involved in, melanoma development (e.g., HOXA9 DNA methylation) and tumor progression (e.g., TBC1D16 DNA methylation). In addition, we determined a prognostic signature with potential clinical applicability and validated PON3 DNA methylation and OVOL1 protein expression as biomarkers with prognostic information independent of tumor thickness and ulceration. Conclusions: Our data underscores the importance of epigenomic regulation in triggering metastatic dissemination through the inactivation of central cancer-related pathways. Inactivation of cell-adhesion and differentiation unleashes dissemination, and subsequent activation of inflammatory and immune system programs impairs anti-tumoral defense pathways. Moreover, we identify several markers of tumor development and progression previously unrelated to melanoma, and determined a prognostic signature with potential clinical utility.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Vizoso, MiguelBellvitge Biomedical Research Institute (författare)
  • Martinez-Cardus, AnnaBellvitge Biomedical Research Institute (författare)
  • Carmona, F JavierBellvitge Biomedical Research Institute (författare)
  • Govaere, OlivierCatholic University of Leuven (författare)
  • Laguna, TeresaJohannes-Gutenberg University Mainz,Bellvitge Biomedical Research Institute (författare)
  • Joseph, JesuchristopherOncoMark Ltd (författare)
  • Dynoodt, PeterOncoMark Ltd (författare)
  • Aura, ClaudiaCatholic University of Leuven (författare)
  • Foth, MonaCancer Research UK,OncoMark Ltd (författare)
  • Cloots, RoyMaastricht University,OncoMark Ltd (författare)
  • van den Hurk, KarinMaastricht University,OncoMark Ltd (författare)
  • Balint, BalazsBellvitge Biomedical Research Institute,OncoMark Ltd (författare)
  • Murphy, Ian G.St Vincent's University Hospital (författare)
  • McDermott, Enda W.St Vincent's University Hospital (författare)
  • Sheahan, KieranSt Vincent's University Hospital (författare)
  • Jirström, KarinLund University,Lunds universitet,Tumörmikromiljö,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Tumor microenvironment,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital(Swepub:lu)pat-kji (författare)
  • Nodin, BjornLund University,Lunds universitet,Tumörmikromiljö,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Tumor microenvironment,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital(Swepub:lu)immu-bnn (författare)
  • Mallya-Udupi, GirishOncoMark Ltd (författare)
  • Van den Oord, Joost JCatholic University of Leuven (författare)
  • Gallagher, William MUniversity College Dublin,OncoMark Ltd (författare)
  • Esteller, ManelUniversity of Barcelona,Bellvitge Biomedical Research Institute,Catalan Institution for Research and Advanced Studies (författare)
  • Catholic University of LeuvenOncoMark Ltd (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:BMC Medicine: Springer Science and Business Media LLC15:1, s. 1-161741-7015

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy