SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Pennanen Ville)
 

Sökning: WFRF:(Pennanen Ville) > Improved chromosome...

Improved chromosome-level genome assembly of the Glanville fritillary butterfly (Melitaea cinxia) integrating Pacific Biosciences long reads and a high-density linkage map

Smolander, Olli Pekka (författare)
University of Helsinki,Tallinn University of Technology
Blande, Daniel (författare)
University of Helsinki
Ahola, Virpi (författare)
Karolinska Institute,University of Helsinki
visa fler...
Rastas, Pasi (författare)
University of Helsinki
Tanskanen, Jaakko (författare)
Natural Resources Institute Finland (Luke)
Kammonen, Juhana I. (författare)
University of Helsinki
Oostra, Vicencio (författare)
University of Helsinki,University of Liverpool
Pellegrini, Lorenzo (författare)
University of Helsinki,University of Warwick
Ikonen, Suvi (författare)
University of Helsinki
Dallas, Tad (författare)
Louisiana State University
Dileo, Michelle F. (författare)
University of Helsinki
Duplouy, Anne (författare)
Lund University,Lunds universitet,Biodiversitet,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Biodiversity,Department of Biology,Faculty of Science,University of Helsinki
Duru, Ilhan Cem (författare)
University of Helsinki
Halimaa, Pauliina (författare)
University of Eastern Finland
Kahilainen, Aapo (författare)
University of Helsinki
Kuwar, Suyog S. (författare)
Florida Museum Natural History
Kärenlampi, Sirpa O. (författare)
University of Eastern Finland
Lafuente, Elvira (författare)
Eawag: Swiss Federal Institute of Aquatic Science and Technology
Luo, Shiqi (författare)
China Agricultural University
Makkonen, Jenny (författare)
University of Eastern Finland
Nair, Abhilash (författare)
University of Helsinki
Celorio-Mancera, Maria de la Paz, 1978- (författare)
Stockholms universitet,Stockholm University,Zoologiska institutionen
Pennanen, Ville (författare)
University of Helsinki
Ruokolainen, Annukka (författare)
University of Helsinki
Sundell, Tarja (författare)
University of Helsinki
Tervahauta, Arja I. (författare)
University of Eastern Finland
Twort, Victoria (författare)
Lund University,Lunds universitet,Biodiversitet,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Systematisk biologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Biodiversity,Department of Biology,Faculty of Science,Systematic Biology Group,Lund University Research Groups,Finnish Museum of Natural History
Van Bergen, Erik (författare)
University of Helsinki
Österman-Udd, Janina (författare)
University of Helsinki
Paulin, Lars (författare)
University of Helsinki
Frilander, Mikko J. (författare)
University of Helsinki
Auvinen, Petri (författare)
University of Helsinki
Saastamoinen, Marjo (författare)
University of Helsinki
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2022-01-12
2022
Engelska.
Ingår i: GigaScience. - : Oxford University Press (OUP). - 2047-217X. ; 11
Relaterad länk:
http://dx.doi.org/10... (free)
visa fler...
https://academic.oup...
https://doi.org/10.1...
https://lup.lub.lu.s...
https://doi.org/10.1...
https://urn.kb.se/re...
http://kipublication...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Background: The Glanville fritillary (Melitaea cinxia) butterfly is a model system for metapopulation dynamics research in fragmented landscapes. Here, we provide a chromosome-level assembly of the butterfly's genome produced from Pacific Biosciences sequencing of a pool of males, combined with a linkage map from population crosses. Results: The final assembly size of 484 Mb is an increase of 94 Mb on the previously published genome. Estimation of the completeness of the genome with BUSCO indicates that the genome contains 92-94% of the BUSCO genes in complete and single copies. We predicted 14,810 genes using the MAKER pipeline and manually curated 1,232 of these gene models. Conclusions: The genome and its annotated gene models are a valuable resource for future comparative genomics, molecular biology, transcriptome, and genetics studies on this species.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Evolutionsbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Evolutionary Biology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)

Nyckelord

genome
Glanville fritillary
Melitaea cinxia
spatial ecology
Melitaea cinxia

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy