SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Lindquist Kajsa Ericson)
 

Sökning: WFRF:(Lindquist Kajsa Ericson) > Clinical framework ...

Clinical framework for next generation sequencing based analysis of treatment predictive mutations and multiplexed gene fusion detection in non-small cell lung cancer

Lindquist, Kajsa Ericson (författare)
Regional Laboratories Region Skåne
Karlsson, Anna (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Levéen, Per (författare)
Regional Laboratories Region Skåne
visa fler...
Brunnström, Hans (författare)
Lund University,Lunds universitet,Tumörmikromiljö,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Tumor microenvironment,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Regional Laboratories Region Skåne
Reuterswärd, Christel (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups
Holm, Karolina (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Jönsson, Mats (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups
Annersten, Karin (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Rosengren, Frida (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Jirström, Karin (författare)
Lund University,Lunds universitet,Tumörmikromiljö,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Personlig patologi och cancerbehandling,Forskargrupper vid Lunds universitet,Tumor microenvironment,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Personalized Pathology & Cancer Therapy,Lund University Research Groups,Regional Laboratories Region Skåne
Kosieradzki, Jaroslaw (författare)
Skåne University Hospital
Ek, Lars (författare)
Skåne University Hospital
Borg, Åke (författare)
Lund University,Lunds universitet,Create Health,Annan verksamhet, LTH,Lunds Tekniska Högskola,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Other operations, LTH,Faculty of Engineering, LTH,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Planck, Maria (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
Jönsson, Göran (författare)
Lund University,Lunds universitet,Create Health,Annan verksamhet, LTH,Lunds Tekniska Högskola,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Other operations, LTH,Faculty of Engineering, LTH,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Staaf, Johan (författare)
Lund University,Lunds universitet,Create Health,Annan verksamhet, LTH,Lunds Tekniska Högskola,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Other operations, LTH,Faculty of Engineering, LTH,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2017-03-16
2017
Engelska 15 s.
Ingår i: Oncotarget. - : Impact Journals, LLC. - 1949-2553. ; 8:21, s. 34796-34810
Relaterad länk:
http://dx.doi.org/10... (free)
visa fler...
http://www.oncotarge...
https://lup.lub.lu.s...
https://doi.org/10.1...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Precision medicine requires accurate multi-gene clinical diagnostics. We describe the implementation of an Illumina TruSight Tumor (TST) clinical NGS diagnostic framework and parallel validation of a NanoString RNA-based ALK, RET, and ROS1 gene fusion assay for combined analysis of treatment predictive alterations in non-small cell lung cancer (NSCLC) in a regional healthcare region of Sweden (Scandinavia). The TST panel was clinically validated in 81 tumors (99% hotspot mutation concordance), after which 533 consecutive NSCLCs were collected during one-year of routine clinical analysis in the healthcare region (~90% advanced stage patients). The NanoString assay was evaluated in 169 of 533 cases. In the 533-sample cohort 79% had 1-2 variants, 12% >2 variants and 9% no detected variants. Ten gene fusions (five ALK, three RET, two ROS1) were detected in 135 successfully analyzed cases (80% analysis success rate). No ALK or ROS1 FISH fusion positive case was missed by the NanoString assay. Stratification of the 533-sample cohort based on actionable alterations in 11 oncogenes revealed that 66% of adenocarcinomas, 13% of squamous carcinoma (SqCC) and 56% of NSCLC not otherwise specified harbored ≥1 alteration. In adenocarcinoma, 10.6% of patients (50.3% if including KRAS) could potentially be eligible for emerging therapeutics, in addition to the 15.3% of patients eligible for standard EGFR or ALK inhibitors. For squamous carcinoma corresponding proportions were 4.4% (11.1% with KRAS) vs 2.2%. In conclusion, multiplexed NGS and gene fusion analyses are feasible in NSCLC for clinical diagnostics, identifying notable proportions of patients potentially eligible for emerging molecular therapeutics.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy