Molecular pathways in patients with systemic lupus erythematosus revealed by gene-centred DNA sequencing

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: WFRF:(Jacobsen Søren) > Molecular pathways ...

Molecular pathways in patients with systemic lupus erythematosus revealed by gene-centred DNA sequencing

Sandling, Johanna K. (författare): Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Reumatologi

Pucholt, Pascal, Dr, 1985- (författare): Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Reumatologi

Hultin-Rosenberg, Lina (författare): Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab

visa fler...

Farias, Fabiana H. G. (författare): Uppsala universitet,Uppsala University,Washington University in St. Louis,Uppsala Univ, Sweden; Washington Univ, MO 63110 USA,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Washington Univ, Dept Psychiat, St Louis, MO 63110 USA.

Kozyrev, Sergey V. (författare): Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab

Eloranta, Maija-Leena (författare): Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Reumatologi

Bengtsson, Anders A. (författare): Uppsala universitet,Lund University,Lunds universitet,Uppsala University,University of Oslo,Odense University Hospital,Lund SLE Research Group,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital,Uppsala Univ, Sweden,Lund Univ, Skane Univ Hosp, Dept Clin Sci Lund, Rheumatol, Lund, Sweden.,Reumatologi

Bianchi, Matteo (författare): Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab

Padyukov, Leonid (författare): Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Dept Med, Div Rheumatol, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden.

Bengtsson, Christine (författare): Umeå universitet,Umeå University,Reumatologi,Umeå Univ, Dept Publ Hlth & Clin Med Rheumatol, Umeå, Sweden.

Jonsson, Roland (författare): University of Bergen,Univ Bergen, Dept Clin Sci, Broegelmann Res Lab, Bergen, Norway.

Omdal, Roald (författare): University of Bergen,Stavanger University Hospital,Univ Bergen, Dept Clin Sci, Broegelmann Res Lab, Bergen, Norway.;Stavanger Univ Hosp, Dept Internal Med, Clin Immunol Unit, Stavanger, Norway.

Lie, Benedicte A. (författare): University of Oslo,Univ Oslo, Dept Med Genet, Oslo, Norway.

Massarenti, Laura (författare): Copenhagen University Hospital,Copenhagen Univ Hosp, Rigshosp, Ctr Rheumatol & Spine Dis, Inst Inflammat Res, Copenhagen, Denmark.

Steffensen, Rudi (författare): Aalborg University,Aalborg Univ, Dept Clin Immunol, Aalborg, Denmark.

Jakobsen, Marianne A. (författare): Odense University Hospital,Odense Univ Hosp, Dept Clin Immunol, Odense, Denmark.

Lillevang, Søren T. (författare): Odense University Hospital,Odense Univ Hosp, Dept Clin Immunol, Odense, Denmark.

Lerang, Karoline (författare): Oslo university hospital,Oslo Univ Hosp, Dept Rheumatol, Oslo, Norway.

Molberg, Øyvind (författare): University of Oslo,Oslo university hospital,Oslo Univ Hosp, Dept Rheumatol, Oslo, Norway.;Univ Oslo, Inst Clin Med, Oslo, Norway.

Voss, Anne (författare): Odense University Hospital,Odense Univ Hosp, Dept Rheumatol, Odense, Denmark.

Troldborg, Anne (författare): Aarhus University Hospital,Aarhus Univ Hosp, Dept Rheumatol, Aarhus, Denmark.;Aarhus Univ, Inst Clin Med, Aarhus, Denmark.

Jacobsen, Søren (författare): Copenhagen University Hospital,University of Copenhagen,Copenhagen Univ Hosp, Rigshosp, Ctr Rheumatol & Spine Dis, Copenhagen, Denmark.;Univ Copenhagen, Inst Clin Med, Copenhagen, Denmark.

Syvänen, Ann-Christine, 1950- (författare): Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab

Jönsen, Andreas (författare): Lund University,Lunds universitet,Lund SLE Research Group,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital,Lund Univ, Skane Univ Hosp, Dept Clin Sci Lund, Rheumatol, Lund, Sweden.

Gunnarsson, Iva (författare): Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Dept Med, Div Rheumatol, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden.

Svenungsson, Elisabet (författare): Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Dept Med, Div Rheumatol, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden.

Rantapää-Dahlqvist, Solbritt (författare): Umeå universitet,Umeå University,Reumatologi,Umeå Univ, Dept Publ Hlth & Clin Med Rheumatol, Umeå, Sweden.

Bengtsson, Anders A. (författare): Lund University,Lunds universitet,Lund SLE Research Group,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital

Sjöwall, Christopher (författare): Linköpings universitet,Linköping University,Avdelningen för inflammation och infektion,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Reumatologiska kliniken i Östergötland,Linköping Univ, Dept Biomed & Clin Sci, Div Inflammat & Infect, Linköping, Sweden.

Leonard, Dag, 1975- (författare): Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Reumatologi

Lindblad-Toh, Kerstin (författare): Uppsala universitet,Uppsala University,Broad Institute,Uppsala Univ, Sweden; Broad Inst MIT & Harvard, MA 02142 USA,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Broad Inst MIT & Harvard, Cambridge, MA 02142 USA.

Rönnblom, Lars (författare): Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Reumatologi

Molberg, O (författare)

Dahlqvist, Johanna, 1979- (bidragsgivare): Uppsala universitet,Reumatologi,DISSECT consortium

visa färre...

(creator_code:org_t)

2020-10-09
2021
Engelska 9 s.
Ingår i: Annals of the Rheumatic Diseases. - : BMJ. - 0003-4967 .- 1468-2060. ; 80:1, s. 109-117

Relaterad länk:: http://dx.doi.org/10... (free); visa fler...; https://ard.bmj.com/...; https://doi.org/10.1...; https://umu.diva-por... (primary) (Raw object); https://liu.diva-por... (primary) (Raw object); https://uu.diva-port... (primary) (Raw object); https://lup.lub.lu.s...; https://doi.org/10.1...; https://urn.kb.se/re...; http://kipublication...; https://urn.kb.se/re...; https://urn.kb.se/re...; visa färre...

Tidskriftsartikel (refereegranskat)

Abstract Ämnesord

Stäng

Objectives: Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease with extensive heterogeneity in disease presentation between patients, which is likely due to an underlying molecular diversity. Here, we aimed at elucidating the genetic aetiology of SLE from the immunity pathway level to the single variant level, and stratify patients with SLE into distinguishable molecular subgroups, which could inform treatment choices in SLE. Methods: We undertook a pathway-centred approach, using sequencing of immunological pathway genes. Altogether 1832 candidate genes were analysed in 958 Swedish patients with SLE and 1026 healthy individuals. Aggregate and single variant association testing was performed, and we generated pathway polygenic risk scores (PRS). Results: We identified two main independent pathways involved in SLE susceptibility: T lymphocyte differentiation and innate immunity, characterised by HLA and interferon, respectively. Pathway PRS defined pathways in individual patients, who on average were positive for seven pathways. We found that SLE organ damage was more pronounced in patients positive for the T or B cell receptor signalling pathways. Further, pathway PRS-based clustering allowed stratification of patients into four groups with different risk score profiles. Studying sets of genes with priors for involvement in SLE, we observed an aggregate common variant contribution to SLE at genes previously reported for monogenic SLE as well as at interferonopathy genes. Conclusions: Our results show that pathway risk scores have the potential to stratify patients with SLE beyond clinical manifestations into molecular subsets, which may have implications for clinical follow-up and therapy selection.

Hitta via bibliotek

Annals of the Rheumatic Diseases (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Reumatologi och ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

Artiklar i publikationen: Annals of the Rh ...

Av lärosätet: Lunds universitet; Umeå universitet; Karolinska Institutet; Linköpings universitet; Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se

Molecular pathways in patients with systemic lupus erythematosus revealed by gene-centred DNA sequencing

Ämnesord

Nyckelord

Publikations- och innehållstyp

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Sök utanför SwePub