Sökning: WFRF:(Planck Maria) >
Epigenome-wide thre...
-
Ji, XinyuNanjing Medical University
(författare)
Epigenome-wide three-way interaction study identifies a complex pattern between TRIM27, KIAA0226, and smoking associated with overall survival of early-stage NSCLC
- Artikel/kapitelEngelska2022
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2022-01-07
-
Wiley,2022
-
15 s.
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:52602e54-76b4-4fa8-8dc3-f06fe35f02d2
-
https://lup.lub.lu.se/record/52602e54-76b4-4fa8-8dc3-f06fe35f02d2URI
-
https://doi.org/10.1002/1878-0261.13167DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Anmärkningar
-
The interaction between DNA methylation of tripartite motif containing 27 (cg05293407TRIM27) and smoking has previously been identified to reveal histologically heterogeneous effects of TRIM27 DNA methylation on early-stage non-small-cell lung cancer (NSCLC) survival. However, to understand the complex mechanisms underlying NSCLC progression, we searched three-way interactions. A two-phase study was adopted to identify three-way interactions in the form of pack-year of smoking (number of cigarettes smoked per day × number of years smoked) × cg05293407TRIM27 × epigenome-wide DNA methylation CpG probe. Two CpG probes were identified with FDR-q ≤ 0.05 in the discovery phase and P ≤ 0.05 in the validation phase: cg00060500KIAA0226 and cg17479956EXT2. Compared to a prediction model with only clinical information, the model added 42 significant three-way interactions using a looser criterion (discovery: FDR-q ≤ 0.10, validation: P ≤ 0.05) had substantially improved the area under the receiver operating characteristic curve (AUC) of the prognostic prediction model for both 3-year and 5-year survival. Our research identified the complex interaction effects among multiple environment and epigenetic factors, and provided therapeutic target for NSCLC patients.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Lin, LijuanNanjing Medical University
(författare)
-
Fan, JuanjuanNanjing Medical University
(författare)
-
Li, YiUniversity of Michigan
(författare)
-
Wei, YongyueHarvard University,Nanjing Medical University
(författare)
-
Shen, SipengNanjing Medical University
(författare)
-
Su, LiHarvard University
(författare)
-
Shafer, AndreaMassachusetts General Hospital
(författare)
-
Bjaanæs, Maria MoksnesOslo university hospital
(författare)
-
Karlsson, AnnaLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Department of Clinical Sciences, Lund(Swepub:lu)med-akn
(författare)
-
Planck, MariaLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Department of Clinical Sciences, Lund(Swepub:lu)onk-mpl
(författare)
-
Staaf, JohanLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Department of Clinical Sciences, Lund(Swepub:lu)onk-jst
(författare)
-
Helland, ÅslaugUniversity of Oslo,Oslo university hospital
(författare)
-
Esteller, ManelSpanish Center for Biomedical Research Network in Oncology (CIBERONC),Catalan Institution for Research and Advanced Studies,University of Barcelona,Josep Carreras Leukaemia Research Institute (IJC)
(författare)
-
Zhang, RuyangHarvard University,Nanjing Medical University
(författare)
-
Chen, FengNanjing Medical University
(författare)
-
Christiani, David C.Massachusetts General Hospital,Harvard University
(författare)
-
Nanjing Medical UniversityUniversity of Michigan
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Molecular Oncology: Wiley16:3, s. 717-7311574-78911878-0261
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Ji, Xinyu
-
Lin, Lijuan
-
Fan, Juanjuan
-
Li, Yi
-
Wei, Yongyue
-
Shen, Sipeng
-
visa fler...
-
Su, Li
-
Shafer, Andrea
-
Bjaanæs, Maria M ...
-
Karlsson, Anna
-
Planck, Maria
-
Staaf, Johan
-
Helland, Åslaug
-
Esteller, Manel
-
Zhang, Ruyang
-
Chen, Feng
-
Christiani, Davi ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Molecular Oncolo ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet