SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Sud A)
 

Sökning: WFRF:(Sud A) > (2019) > Transcriptome-wide ...

  • Went, MollyInstitute of Cancer Research London (författare)

Transcriptome-wide association study of multiple myeloma identifies candidate susceptibility genes

  • Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2019-08-20
  • Springer Science and Business Media LLC,2019

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:67cc4652-a39b-43df-9b49-857ec014e6a9
  • https://lup.lub.lu.se/record/67cc4652-a39b-43df-9b49-857ec014e6a9URI
  • https://doi.org/10.1186/s40246-019-0231-5DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • BackgroundWhile genome-wide association studies (GWAS) of multiple myeloma (MM) have identified variants at 23 regions influencing risk, the genes underlying these associations are largely unknown. To identify candidate causal genes at these regions and search for novel risk regions, we performed a multi-tissue transcriptome-wide association study (TWAS).ResultsGWAS data on 7319 MM cases and 234,385 controls was integrated with Genotype-Tissue Expression Project (GTEx) data assayed in 48 tissues (sample sizes, N = 80–491), including lymphocyte cell lines and whole blood, to predict gene expression. We identified 108 genes at 13 independent regions associated with MM risk, all of which were in 1 Mb of known MM GWAS risk variants. Of these, 94 genes, located in eight regions, had not previously been considered as a candidate gene for that locus.ConclusionsOur findings highlight the value of leveraging expression data from multiple tissues to identify candidate genes responsible for GWAS associations which provide insight into MM tumorigenesis. Among the genes identified, a number have plausible roles in MM biology, notably APOBEC3C, APOBEC3H, APOBEC3D, APOBEC3F, APOBEC3G, or have been previously implicated in other malignancies. The genes identified in this TWAS can be explored for follow-up and validation to further understand their role in MM biology.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Kinnersley, BenInstitute of Cancer Research London (författare)
  • Sud, AmitInstitute of Cancer Research London (författare)
  • Johnson, David CInstitute of Cancer Research London (författare)
  • Weinhold, NielsHeidelberg University,University of Arkansas for Medical Sciences,University Hospital Heidelberg (författare)
  • Försti, AstaGerman Cancer Research Centre(Swepub:lu)med-asf (författare)
  • van Duin, MarkErasmus University Medical Center (författare)
  • Orlando, GiuliaInstitute of Cancer Research London (författare)
  • Mitchell, Jonathan SInstitute of Cancer Research London (författare)
  • Kuiper, RowanErasmus University Medical Center (författare)
  • Walker, Brian A.University of Arkansas for Medical Sciences (författare)
  • Gregory, Walter M.University of Leeds (författare)
  • Hoffmann, PerUniversity Hospital Bonn,University of Bonn,University of Basel (författare)
  • Jackson, Graham H.Royal Victoria Infirmary (författare)
  • Nöthen, Markus MUniversity of Bonn,University Hospital Bonn (författare)
  • Inacio da Silva Filho, MiguelGerman Cancer Research Centre (författare)
  • Thomsen, HaukeGerman Cancer Research Centre(Swepub:lu)med-hth (författare)
  • Broyl, AnnemiekErasmus University Medical Center (författare)
  • Davies, Faith E.University of Arkansas for Medical Sciences (författare)
  • Thorsteinsdottir, UnnurAgricultural University of Iceland,deCODE Genetics,University of Iceland (författare)
  • Hansson, MarkusLund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Myelomgruppen,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Myeloma research group,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital(Swepub:lu)hema-mha (författare)
  • Kaiser, MartinRoyal Marsden Hospital, Sutton,Institute of Cancer Research London (författare)
  • Sonneveld, PieterErasmus University Medical Center (författare)
  • Goldschmidt, HartmutHeidelberg University,National Centre of Tumor Diseases,German Cancer Research Centre,University Hospital Heidelberg (författare)
  • Stefansson, KarideCODE Genetics,Agricultural University of Iceland,National University Hospital of Iceland,University of Iceland (författare)
  • Hemminki, KariGerman Cancer Research Centre (författare)
  • Nilsson, BjörnLund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups,Broad Institute(Swepub:lu)klin-bni (författare)
  • Morgan, Gareth J.University of Arkansas for Medical Sciences (författare)
  • Houlston, Richard S.Institute of Cancer Research London (författare)
  • Institute of Cancer Research LondonHeidelberg University (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Human Genomics: Springer Science and Business Media LLC13:11479-7364

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy