WFRF:(Ponnikas Suvi)
Sökning: WFRF:(Ponnikas Suvi) > (2020-2022) > Extreme variation i...
- Ponnikas, SuviLund University,Lunds universitet,MEMEG,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Department of Biology,Faculty of Science,University of Oulu (författare)
Extreme variation in recombination rate and genetic diversity along the Sylvioidea neo-sex chromosome
- Artikel/kapitelEngelska2022
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- 2022-06-06
- Wiley,2022
- 18 s.
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:6c67066c-22a9-4987-910d-21a0f79e6192
- https://lup.lub.lu.se/record/6c67066c-22a9-4987-910d-21a0f79e6192URI
- https://doi.org/10.1111/mec.16532DOI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- Recombination strongly impacts sequence evolution by affecting the extent of linkage and the efficiency of selection. Here, we study recombination over the Z chromosome in great reed warblers (Acrocephalus arundinaceus) using pedigree-based linkage mapping. This species has extended Z and W chromosomes (“neo-sex chromosomes”) formed by a fusion between a part of chromosome 4A and the ancestral sex chromosomes, which provides a unique opportunity to assess recombination and sequence evolution in sex-linked regions of different ages. We assembled an 87.54 Mbp and 90.19 cM large Z with a small pseudoautosomal region (0.89 Mbp) at one end and the fused Chr4A-part at the other end of the chromosome. A prominent feature in our data was an extreme variation in male recombination rate along Z with high values at both chromosome ends, but an apparent lack of recombination over a substantial central section, covering 78% of the chromosome. The nonrecombining region showed a drastic loss of genetic diversity and accumulation of repeats compared to the recombining parts. Thus, our data emphasize a key role of recombination in affecting local levels of polymorphism. Nonetheless, the evolutionary rate of genes (dN/dS) did not differ between high and low recombining regions, suggesting that the efficiency of selection on protein-coding sequences can be maintained also at very low levels of recombination. Finally, the Chr4A-derived part showed a similar recombination rate as the part of the ancestral Z that did recombine, but its sequence characteristics reflected both its previous autosomal, and current Z-linked, recombination patterns.
Ämnesord och genrebeteckningar
- NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng
- evolutionary rates
- genetic variation
- great reed warbler
- linkage map
- neo-sex chromosome
- recombination
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Sigeman, HannaLund University,Lunds universitet,MEMEG,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Könsskillnadernas genetik,Forskargrupper vid Lunds universitet,Molekylär ekologi och evolution,Department of Biology,Faculty of Science,Genetics of Sex Differences,Lund University Research Groups,Molecular Ecology and Evolution Lab(Swepub:lu)ha4515si (författare)
- Lundberg, MaxLund University,Lunds universitet,MEMEG,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molekylär ekologi och evolution,Forskargrupper vid Lunds universitet,CAnMove - Centrum för forskning om djurs spridning och flyttning,Department of Biology,Faculty of Science,Molecular Ecology and Evolution Lab,Lund University Research Groups,CAnMove - Centre for Animal Movement Research(Swepub:lu)zooe-mld (författare)
- Hansson, BengtLund University,Lunds universitet,MEMEG,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Könsskillnadernas genetik,Forskargrupper vid Lunds universitet,Molekylär ekologi och evolution,CAnMove - Centrum för forskning om djurs spridning och flyttning,Department of Biology,Faculty of Science,Genetics of Sex Differences,Lund University Research Groups,Molecular Ecology and Evolution Lab,CAnMove - Centre for Animal Movement Research(Swepub:lu)ekol-bhn (författare)
- MEMEGBiologiska institutionen (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:Molecular Ecology: Wiley31:13, s. 3566-35830962-10831365-294X
Internetlänk
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Ponnikas, Suvi
- Sigeman, Hanna
- Lundberg, Max
- Hansson, Bengt
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Genetik
- Artiklar i publikationen
- Molecular Ecolog ...
- Av lärosätet
- Lunds universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
