SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Ngo Debby)
 

Sökning: WFRF:(Ngo Debby) > (2018) > Probing the Virtual...

  • Mosley, Jonathan D.Vanderbilt University (författare)

Probing the Virtual Proteome to Identify Novel Disease Biomarkers

  • Artikel/kapitelEngelska2018

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2018
  • 13 s.

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:72cac14a-bfb1-4c22-b4a0-a3edd2c9d336
  • https://lup.lub.lu.se/record/72cac14a-bfb1-4c22-b4a0-a3edd2c9d336URI
  • https://doi.org/10.1161/CIRCULATIONAHA.118.036063DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • BACKGROUND: Proteomic approaches allow measurement of thousands of proteins in a single specimen, which can accelerate biomarker discovery. However, applying these technologies to massive biobanks is not currently feasible because of the practical barriers and costs of implementing such assays at scale. To overcome these challenges, we used a "virtual proteomic" approach, linking genetically predicted protein levels to clinical diagnoses in >40 000 individuals. METHODS: We used genome-wide association data from the Framingham Heart Study (n=759) to construct genetic predictors for 1129 plasma protein levels. We validated the genetic predictors for 268 proteins and used them to compute predicted protein levels in 41 288 genotyped individuals in the Electronic Medical Records and Genomics (eMERGE) cohort. We tested associations for each predicted protein with 1128 clinical phenotypes. Lead associations were validated with directly measured protein levels and either low-density lipoprotein cholesterol or subclinical atherosclerosis in the MDCS (Malmö Diet and Cancer Study; n=651). RESULTS: In the virtual proteomic analysis in eMERGE, 55 proteins were associated with 89 distinct diagnoses at a false discovery rate q<0.1. Among these, 13 associations involved lipid (n=7) or atherosclerosis (n=6) phenotypes. We tested each association for validation in MDCS using directly measured protein levels. At Bonferroni-adjusted significance thresholds, levels of apolipoprotein E isoforms were associated with hyperlipidemia, and circulating C-type lectin domain family 1 member B and platelet-derived growth factor receptor-β predicted subclinical atherosclerosis. Odds ratios for carotid atherosclerosis were 1.31 (95% CI, 1.08-1.58; P=0.006) per 1-SD increment in C-type lectin domain family 1 member B and 0.79 (0.66-0.94; P=0.008) per 1-SD increment in platelet-derived growth factor receptor-β. CONCLUSIONS: We demonstrate a biomarker discovery paradigm to identify candidate biomarkers of cardiovascular and other diseases.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Benson, Mark D.Brigham and Women's Hospital / Harvard Medical School,Beth Israel Deaconess Medical Center (författare)
  • Smith, J. GustavLund University,Lunds universitet,Molecular Epidemiology and Cardiology,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital(Swepub:lu)med-gvs (författare)
  • Melander, OlleLund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - hypertoni,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Hypertension,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital(Swepub:lu)endo-ome (författare)
  • Ngo, DebbyHarvard University,Massachusetts General Hospital (författare)
  • Shaffer, Christian M.Vanderbilt University (författare)
  • Ferguson, Jane F.Vanderbilt University (författare)
  • Herzig, Matthew S.Beth Israel Deaconess Medical Center (författare)
  • McCarty, Catherine A.University of Minnesota (författare)
  • Chute, Christopher G.Johns Hopkins University (författare)
  • Jarvik, Gail P.University of Washington (författare)
  • Gordon, Adam S.University of Washington (författare)
  • Palmer, Melody R.University of Washington (författare)
  • Crosslin, David R.University of Washington (författare)
  • Larson, Eric B.Kaiser Permanente Research Institute,University of Washington (författare)
  • Carrell, David S.Kaiser Permanente Research Institute (författare)
  • Kullo, Iftikhar J.Mayo Clinic Minnesota (författare)
  • Pacheco, Jennifer A.Northwestern University (författare)
  • Peissig, Peggy L.Marshfield Clinic (författare)
  • Brilliant, Murray H.Marshfield Clinic (författare)
  • Kitchner, Terrie E.Marshfield Clinic (författare)
  • Linneman, James G.Marshfield Clinic (författare)
  • Namjou, BahramUniversity of Cincinnati,Cincinnati Children's Hospital Medical Center (författare)
  • Williams, Marc S.Geisinger Health System (författare)
  • Ritchie, Marylyn D.University of Pennsylvania (författare)
  • Borthwick, Kenneth M.Geisinger Health System (författare)
  • Kiryluk, KrzysztofColumbia University (författare)
  • Mentch, Frank D.The Children's Hospital of Philadelphia (författare)
  • Sleiman, Patrick M.The Children's Hospital of Philadelphia (författare)
  • Karlson, Elizabeth W.Harvard University,Brigham and Women's Hospital / Harvard Medical School (författare)
  • Verma, Shefali S.University of Pennsylvania (författare)
  • Zhu, YinengBoston University (författare)
  • Vasan, Ramachandran S.Boston University (författare)
  • Yang, QiongBoston University (författare)
  • Denny, Josh C.Vanderbilt University (författare)
  • Roden, Dan M.Vanderbilt University (författare)
  • Gerszten, Robert E.Beth Israel Deaconess Medical Center (författare)
  • Wang, Thomas J.Vanderbilt University (författare)
  • Vanderbilt UniversityBrigham and Women's Hospital / Harvard Medical School (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Circulation138:22, s. 2469-24811524-4539

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy