Sökning: WFRF:(Thompson Alastair M.) >
Landscape of somati...
-
Nik-Zainal, SerenaWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
Landscape of somatic mutations in 560 breast cancer whole-genome sequences
- Artikel/kapitelEngelska2016
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2016-05-02
-
Springer Science and Business Media LLC,2016
-
8 s.
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:78b7cd41-aebe-4756-b732-c07ef1455952
-
https://lup.lub.lu.se/record/78b7cd41-aebe-4756-b732-c07ef1455952URI
-
https://doi.org/10.1038/nature17676DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Anmärkningar
-
We analysed whole-genome sequences of 560 breast cancers to advance understanding of the driver mutations conferring clonal advantage and the mutational processes generating somatic mutations. We found that 93 protein-coding cancer genes carried probable driver mutations. Some non-coding regions exhibited high mutation frequencies, but most have distinctive structural features probably causing elevated mutation rates and do not contain driver mutations. Mutational signature analysis was extended to genome rearrangements and revealed twelve base substitution and six rearrangement signatures. Three rearrangement signatures, characterized by tandem duplications or deletions, appear associated with defective homologous-recombination-based DNA repair: one with deficient BRCA1 function, another with deficient BRCA1 or BRCA2 function, the cause of the third is unknown. This analysis of all classes of somatic mutation across exons, introns and intergenic regions highlights the repertoire of cancer genes and mutational processes operating, and progresses towards a comprehensive account of the somatic genetic basis of breast cancer.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Davies, HelenWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Staaf, JohanLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)onk-jst
(författare)
-
Ramakrishna, ManasaWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Glodzik, DominikWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Zou, XueqingWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Martincorena, InigoWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Alexandrov, Ludmil BWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Martin, SanchaWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Wedge, David CWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Van Loo, Peter
(författare)
-
Ju, Young Seok
(författare)
-
Smid, Marcel
(författare)
-
Brinkman, Arie B
(författare)
-
Morganella, Sandro
(författare)
-
Aure, Miriam R
(författare)
-
Lingjærde, Ole Christian
(författare)
-
Langerød, Anita
(författare)
-
Ringnér, MarkusLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)thep-mri
(författare)
-
Ahn, Sung-Min
(författare)
-
Boyault, Sandrine
(författare)
-
Brock, Jane E
(författare)
-
Broeks, Annegien
(författare)
-
Butler, Adam
(författare)
-
Desmedt, Christine
(författare)
-
Dirix, Luc
(författare)
-
Dronov, Serge
(författare)
-
Fatima, Aquila
(författare)
-
Foekens, John A
(författare)
-
Gerstung, Moritz
(författare)
-
Hooijer, Gerrit K J
(författare)
-
Jang, Se Jin
(författare)
-
Jones, David R
(författare)
-
Kim, Hyung-Yong
(författare)
-
King, Tari A
(författare)
-
Krishnamurthy, Savitri
(författare)
-
Lee, Hee Jin
(författare)
-
Lee, Jeong-Yeon
(författare)
-
Li, Yilong
(författare)
-
McLaren, Stuart
(författare)
-
Menzies, Andrew
(författare)
-
Mustonen, Ville
(författare)
-
O'Meara, Sarah
(författare)
-
Pauporté, Iris
(författare)
-
Pivot, Xavier
(författare)
-
Purdie, Colin A
(författare)
-
Raine, Keiran
(författare)
-
Ramakrishnan, Kamna
(författare)
-
Rodríguez-González, F Germán
(författare)
-
Romieu, Gilles
(författare)
-
Sieuwerts, Anieta M
(författare)
-
Simpson, Peter T
(författare)
-
Shepherd, Rebecca
(författare)
-
Stebbings, Lucy
(författare)
-
Stefansson, Olafur A
(författare)
-
Teague, Jon
(författare)
-
Tommasi, Stefania
(författare)
-
Treilleux, Isabelle
(författare)
-
Van den Eynden, Gert G
(författare)
-
Vermeulen, Peter
(författare)
-
Vincent-Salomon, Anne
(författare)
-
Yates, Lucy
(författare)
-
Caldas, Carlos
(författare)
-
van't Veer, Laura
(författare)
-
Tutt, Andrew
(författare)
-
Knappskog, Stian
(författare)
-
Tan, Benita Kiat Tee
(författare)
-
Jonkers, Jos
(författare)
-
Borg, ÅkeLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Familjär bröstcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Familial Breast Cancer,Lund University Research Groups(Swepub:lu)onk-abo
(författare)
-
Ueno, Naoto T
(författare)
-
Sotiriou, Christos
(författare)
-
Viari, Alain
(författare)
-
Futreal, P Andrew
(författare)
-
Campbell, Peter J
(författare)
-
Span, Paul N
(författare)
-
Van Laere, Steven
(författare)
-
Lakhani, Sunil R
(författare)
-
Eyfjord, Jorunn E
(författare)
-
Thompson, Alastair M
(författare)
-
Birney, Ewan
(författare)
-
Stunnenberg, Hendrik G
(författare)
-
van de Vijver, Marc J
(författare)
-
Martens, John W M
(författare)
-
Børresen-Dale, Anne-Lise
(författare)
-
Richardson, Andrea L
(författare)
-
Kong, Gu
(författare)
-
Thomas, Gilles
(författare)
-
Stratton, Michael R
(författare)
-
Wellcome Trust Sanger InstituteBröstcancer-genetik
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature: Springer Science and Business Media LLC534:7605, s. 47-540028-08361476-4687
Internetlänk
Hitta via bibliotek
-
Nature
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Nik-Zainal, Sere ...
-
Davies, Helen
-
Staaf, Johan
-
Ramakrishna, Man ...
-
Glodzik, Dominik
-
Zou, Xueqing
-
visa fler...
-
Martincorena, In ...
-
Alexandrov, Ludm ...
-
Martin, Sancha
-
Wedge, David C
-
Van Loo, Peter
-
Ju, Young Seok
-
Smid, Marcel
-
Brinkman, Arie B
-
Morganella, Sand ...
-
Aure, Miriam R
-
Lingjærde, Ole C ...
-
Langerød, Anita
-
Ringnér, Markus
-
Ahn, Sung-Min
-
Boyault, Sandrin ...
-
Brock, Jane E
-
Broeks, Annegien
-
Butler, Adam
-
Desmedt, Christi ...
-
Dirix, Luc
-
Dronov, Serge
-
Fatima, Aquila
-
Foekens, John A
-
Gerstung, Moritz
-
Hooijer, Gerrit ...
-
Jang, Se Jin
-
Jones, David R
-
Kim, Hyung-Yong
-
King, Tari A
-
Krishnamurthy, S ...
-
Lee, Hee Jin
-
Lee, Jeong-Yeon
-
Li, Yilong
-
McLaren, Stuart
-
Menzies, Andrew
-
Mustonen, Ville
-
O'Meara, Sarah
-
Pauporté, Iris
-
Pivot, Xavier
-
Purdie, Colin A
-
Raine, Keiran
-
Ramakrishnan, Ka ...
-
Rodríguez-Gonzál ...
-
Romieu, Gilles
-
Sieuwerts, Aniet ...
-
Simpson, Peter T
-
Shepherd, Rebecc ...
-
Stebbings, Lucy
-
Stefansson, Olaf ...
-
Teague, Jon
-
Tommasi, Stefani ...
-
Treilleux, Isabe ...
-
Van den Eynden, ...
-
Vermeulen, Peter
-
Vincent-Salomon, ...
-
Yates, Lucy
-
Caldas, Carlos
-
van't Veer, Laur ...
-
Tutt, Andrew
-
Knappskog, Stian
-
Tan, Benita Kiat ...
-
Jonkers, Jos
-
Borg, Åke
-
Ueno, Naoto T
-
Sotiriou, Christ ...
-
Viari, Alain
-
Futreal, P Andre ...
-
Campbell, Peter ...
-
Span, Paul N
-
Van Laere, Steve ...
-
Lakhani, Sunil R
-
Eyfjord, Jorunn ...
-
Thompson, Alasta ...
-
Birney, Ewan
-
Stunnenberg, Hen ...
-
van de Vijver, M ...
-
Martens, John W ...
-
Børresen-Dale, A ...
-
Richardson, Andr ...
-
Kong, Gu
-
Thomas, Gilles
-
Stratton, Michae ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature
- Av lärosätet
-
Lunds universitet