WFRF:(Irbäck Anders)
Sökning: WFRF:(Irbäck Anders) > Monte Carlo update ...
Monte Carlo update for chain molecules: Biased Gaussian steps in torsional space
-
- Favrin, Giorgio (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics - Undergoing reorganization,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Undergoing reorganization,Faculty of Science
-
- Irbäck, Anders (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics - Undergoing reorganization,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Undergoing reorganization,Faculty of Science
-
- Sjunnesson, Fredrik (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics - Undergoing reorganization,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Undergoing reorganization,Faculty of Science
- (creator_code:org_t)
- AIP Publishing, 2001
- 2001
- Engelska.
- Ingår i: Journal of Chemical Physics. - : AIP Publishing. - 0021-9606 .- 1089-7690. ; 114:8, s. 8154-8158
- Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- We develop a new elementary move for simulations of polymer chains in torsion angle space. The method is flexible and easy to implement. Tentative updates are drawn from a (conformation-dependent) Gaussian distribution that favors approximately local deformations of the chain. The degree of bias is controlled by a parameter b. The method is tested on a reduced model protein with 54 amino acids and the Ramachandran torsion angles as its only degrees of freedom, for different b. Without excessive fine tuning, we find that the effective step size can be increased by a factor of 3 compared to the unbiased b = 0 case. The method may be useful for kinetic studies, too.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biofysik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biophysics (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
- Journal of Chemical Physics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Favrin, Giorgio
- Irbäck, Anders
- Sjunnesson, Fred ...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Biofysik
- Artiklar i publikationen
- Journal of Chemi ...
- Av lärosätet
- Lunds universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
