SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Vogtmann Emily)
 

Sökning: WFRF:(Vogtmann Emily) > (2019) > Meta-analysis of fe...

  • Wirbel, JakobEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)

Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer

  • Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2019-04-01
  • Springer Science and Business Media LLC,2019
  • 11 s.

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:8d3dbce1-5605-4564-a819-63082c4da5a1
  • https://lup.lub.lu.se/record/8d3dbce1-5605-4564-a819-63082c4da5a1URI
  • https://doi.org/10.1038/s41591-019-0406-6DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Association studies have linked microbiome alterations with many human diseases. However, they have not always reported consistent results, thereby necessitating cross-study comparisons. Here, a meta-analysis of eight geographically and technically diverse fecal shotgun metagenomic studies of colorectal cancer (CRC, n = 768), which was controlled for several confounders, identified a core set of 29 species significantly enriched in CRC metagenomes (false discovery rate (FDR) < 1 × 10 −5 ). CRC signatures derived from single studies maintained their accuracy in other studies. By training on multiple studies, we improved detection accuracy and disease specificity for CRC. Functional analysis of CRC metagenomes revealed enriched protein and mucin catabolism genes and depleted carbohydrate degradation genes. Moreover, we inferred elevated production of secondary bile acids from CRC metagenomes, suggesting a metabolic link between cancer-associated gut microbes and a fat- and meat-rich diet. Through extensive validations, this meta-analysis firmly establishes globally generalizable, predictive taxonomic and functional microbiome CRC signatures as a basis for future diagnostics.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Pyl, Paul TheodorLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,University of Copenhagen(Swepub:lu)pa7707py (författare)
  • Kartal, EceEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
  • Zych, KonradEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
  • Kashani, AlirezaUniversity of Copenhagen (författare)
  • Milanese, AlessioEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
  • Fleck, Jonas S.European Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
  • Voigt, Anita Y.European Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
  • Palleja, AlbertUniversity of Copenhagen (författare)
  • Ponnudurai, RubyEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
  • Sunagawa, ShinichiEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg,ETH Zürich (författare)
  • Coelho, Luis PedroEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg,Fudan University (författare)
  • Schrotz-King, PetraGerman Cancer Research Centre (författare)
  • Vogtmann, EmilyNational Cancer Institute, USA (författare)
  • Habermann, NinaEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
  • Niméus, EmmaLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Bröstcancerkirurgi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Breast Cancer Surgery,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital(Swepub:lu)onk-ens (författare)
  • Thomas, Andrew M.University of Trento,University of São Paulo (författare)
  • Manghi, PaoloUniversity of Trento (författare)
  • Gandini, SaraEuropean Institute of Oncology (författare)
  • Serrano, DavideEuropean Institute of Oncology (författare)
  • Mizutani, SayakaJapan Society for the Promotion of Science,Tokyo Institute of Technology (författare)
  • Shiroma, HirotsuguTokyo Institute of Technology (författare)
  • Shiba, SatoshiNational Cancer Center Research Institute, Japan (författare)
  • Shibata, TatsuhiroNational Cancer Center Research Institute, Japan (författare)
  • Yachida, ShinichiNational Cancer Center Research Institute, Japan,Osaka University (författare)
  • Yamada, TakujiTokyo Institute of Technology,Japan Science and Technology Agency (JST) (författare)
  • Waldron, LeviCity University of New York (författare)
  • Naccarati, AlessioInstitute of Experimental Medicine, Czech Academy of Science (författare)
  • Segata, NicolaUniversity of Trento (författare)
  • Sinha, RashmiNational Cancer Institute, USA (författare)
  • Ulrich, Cornelia M.University of Utah (författare)
  • Brenner, HermannGerman Cancer Research Centre (författare)
  • Arumugam, ManimozhiyanUniversity of Copenhagen,University of Southern Denmark (författare)
  • Bork, PeerJulius Maximilian University of Würzburg,European Molecular Biology Laboratory Heidelberg,Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC) (författare)
  • Zeller, GeorgEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
  • European Molecular Biology Laboratory HeidelbergBröstcancer-genetik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Medicine: Springer Science and Business Media LLC25:4, s. 679-6891078-89561546-170X

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy