Genome-wide association study on 13,167 individuals identifies regulators of hematopoietic stem and progenitor cell levels in human blood

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Niroula Abhishek) > (2021) > Genome-wide associa...

Genome-wide association study on 13,167 individuals identifies regulators of hematopoietic stem and progenitor cell levels in human blood

Lopez de Lapuente Portilla, Aitzkoa (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Stamcellscentrum (SCC),Avdelningen för stamcellsforskning,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Stem Cell Center,Division of stem cell research,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments

Ekdahl, Ludvig (författare): Lund University,Lunds universitet,Stamcellscentrum (SCC),Avdelningen för stamcellsforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Stem Cell Center,Division of stem cell research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments

Cafaro, Caterina (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments

visa fler...

Ali, Zain (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups

Miharada, Natsumi (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för molekylärmedicin och genterapi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Molecular Medicine and Gene Therapy,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups

Thorleifsson, Gudmar (författare): deCODE Genetics

Zemaitis, Kristijonas (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för molekylärmedicin och genterapi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Stamcellscentrum (SCC),Avdelningen för stamcellsforskning,Division of Molecular Medicine and Gene Therapy,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Stem Cell Center,Division of stem cell research

Lamarca Arrizabalaga, Antton (författare): Lund University

Thodberg, Malte (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups

Pertesi, Maroulio (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments

Dhapola, Parashar (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för molekylär hematologi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Stem Cells and Leukemia,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Molecular Hematology (DMH),Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups

Bao, Erik L (författare): Harvard Medical School,Broad Institute

Niroula, Abhishek (författare): Lund University,Lunds universitet,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Broad Institute

Bali, Divya (författare): Lund University,Lunds universitet,Klinisk minnesforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Clinical Memory Research,Lund University Research Groups,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine

Norddahl, Gudmundur L. (författare): deCODE Genetics

Ugidos Damboriena, Nerea (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups

Sankaran, Vijay G (författare): Broad Institute,Boston Children's Hospital

Karlsson, Göran (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för molekylär hematologi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Stem Cells and Leukemia,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Molecular Hematology (DMH),Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups

Thorsteinsdottir, Unnur (författare): deCODE Genetics

Larsson, Jonas (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för molekylärmedicin och genterapi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,WCMM- Wallenberg center för molekylär medicinsk forskning,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Division of Molecular Medicine and Gene Therapy,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,WCMM-Wallenberg Centre for Molecular Medicine,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments

Stefánsson, Kári (författare): deCODE Genetics

Nilsson, Björn (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments

visa färre...

(creator_code:org_t)

Cold Spring Harbor Laboratory, 2021
Engelska.

Relaterad länk:: http://dx.doi.org/10... (free); visa fler...; https://www.biorxiv....; https://lup.lub.lu.s...; https://doi.org/10.1...; visa färre...

Annan publikation (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)

Abstract Ämnesord

Stäng

Understanding how hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs) are regulated is of central importance for the development of new therapies for blood disorders and stem cell transplantation. To date, HSPC regulation has been extensively studied in vitro and in animal models, but less is known about the mechanisms in vivo in humans. Here, in a genome-wide association study on 13,167 individuals, we identify 9 significant and 2 suggestive DNA sequence variants that influence HSPC (CD34+) levels in human blood. The identified loci associate with blood disorders, harbor known and novel HSPC genes, and affect gene expression in HSPCs. Interestingly, our strongest association maps to the PPM1H gene, encoding an evolutionarily conserved serine/threonine phosphatase never previously implicated in stem cell biology. PPM1H is expressed in HSPCs, and the allele that confers higher blood CD34+ cell levels downregulates PPM1H. By functional fine-mapping, we find that this downregulation is caused by the variant rs772557-A, which abrogates a MYB transcription factor binding site in PPM1H intron 1 that is active in specific HSPC subpopulations, including hematopoietic stem cells, and interacts with the promoter by chromatin looping. Furthermore, rs772557-A selectively increases HSPC subpopulations in which the MYB site is active, and PPM1H shRNA- knockdown increased CD34+ and CD34+90+ cell proportions in umbilical cord blood cultures. Our findings represent the first large-scale association study on a stem cell trait, illuminating HSPC regulation in vivo in humans, and identifying PPM1H as a novel inhibition target that can potentially be utilized clinically to facilitate stem cell harvesting for transplantation.

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Hematologi

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

Av lärosätet: Lunds universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se

Genome-wide association study on 13,167 individuals identifies regulators of hematopoietic stem and progenitor cell levels in human blood

Ämnesord

Publikations- och innehållstyp

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Sök utanför SwePub