Discovery and Fine-Mapping of Glycaemic and Obesity-Related Trait Loci Using High-Density Imputation.

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: WFRF:(De Craen Anton J. M.) > Discovery and Fine-...

Horikoshi, MomokoUniv Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England.;Univ Oxford, Oxford Ctr Diabet Endocrinol & Metab, Oxford, England. (författare)

Discovery and Fine-Mapping of Glycaemic and Obesity-Related Trait Loci Using High-Density Imputation.

Artikel/kapitelEngelska2015

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2015-07-01
Public Library of Science (PLoS),2015
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:9376a6a0-6b9b-4b1e-8f75-e4c9f79f087d
https://lup.lub.lu.se/record/7751176URI
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1005230DOI
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:131936669URI
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-263537URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

Reference panels from the 1000 Genomes (1000G) Project Consortium provide near complete coverage of common and low-frequency genetic variation with minor allele frequency ≥0.5% across European ancestry populations. Within the European Network for Genetic and Genomic Epidemiology (ENGAGE) Consortium, we have undertaken the first large-scale meta-analysis of genome-wide association studies (GWAS), supplemented by 1000G imputation, for four quantitative glycaemic and obesity-related traits, in up to 87,048 individuals of European ancestry. We identified two loci for body mass index (BMI) at genome-wide significance, and two for fasting glucose (FG), none of which has been previously reported in larger meta-analysis efforts to combine GWAS of European ancestry. Through conditional analysis, we also detected multiple distinct signals of association mapping to established loci for waist-hip ratio adjusted for BMI (RSPO3) and FG (GCK and G6PC2). The index variant for one association signal at the G6PC2 locus is a low-frequency coding allele, H177Y, which has recently been demonstrated to have a functional role in glucose regulation. Fine-mapping analyses revealed that the non-coding variants most likely to drive association signals at established and novel loci were enriched for overlap with enhancer elements, which for FG mapped to promoter and transcription factor binding sites in pancreatic islets, in particular. Our study demonstrates that 1000G imputation and genetic fine-mapping of common and low-frequency variant association signals at GWAS loci, integrated with genomic annotation in relevant tissues, can provide insight into the functional and regulatory mechanisms through which their effects on glycaemic and obesity-related traits are mediated.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Mӓgi, Reedik (författare)
van de Bunt, MartijnUniv Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England.;Univ Oxford, Oxford Ctr Diabet Endocrinol & Metab, Oxford, England. (författare)
Surakka, IdaUniv Helsinki, Inst Mol Med Finland FIMM, Helsinki, Finland.;Natl Inst Hlth & Welf, Helsinki, Finland. (författare)
Sarin, Antti-PekkaUniv Helsinki, Inst Mol Med Finland FIMM, Helsinki, Finland.;Natl Inst Hlth & Welf, Helsinki, Finland. (författare)
Mahajan, AnubhaUniv Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England. (författare)
Marullo, LetiziaUniv Ferrara, Dept Life Sci & Biotechnol, I-44100 Ferrara, Italy. (författare)
Thorleifsson, GudmardeCode Genet Amgen Inc, Reykjavik, Iceland. (författare)
Hägg, SaraUppsala universitet,Karolinska Institutet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostatist, Stockholm, Sweden.(Swepub:uu)sarha464 (författare)
Hottenga, Jouke-JanVrije Univ Amsterdam, Dept Biol Psychol, Amsterdam, Netherlands.,Vrije Univ Amsterdam, Dept Psychiat, Med Ctr, Amsterdam, Netherlands. (författare)
Ladenvall, ClaesLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups,Skane Univ Hosp, Lund Univ Diabet Ctr, Dept Clin Sci Diabet & Endocrinol, Malmo, Sweden.(Swepub:lu)med-cll (författare)
Ried, Janina SHelmholtz Zentrum Munchen, Inst Genet Epidemiol, German Res Ctr Environm Hlth, Neuherberg, Germany. (författare)
Winkler, Thomas WUniv Regensburg, Dept Genet Epidemiol, Inst Epidemiol & Prevent Med, D-93053 Regensburg, Germany. (författare)
Willems, Sara MErasmus Univ, Med Ctr, Dept Epidemiol, Genet Epidemiol Unit, Rotterdam, Netherlands. (författare)
Pervjakova, NataliaUniv Tartu, Estonian Genome Ctr, EE-50090 Tartu, Estonia. (författare)
Esko, TõnuUniv Tartu, Estonian Genome Ctr, EE-50090 Tartu, Estonia.;Childrens Hosp, Div Endocrinol, Boston, MA 02115 USA.;Childrens Hosp, Ctr Basic & Translat Obes Res, Boston, MA 02115 USA.;Broad Inst, Program Med & Populat Genet, Cambridge, MA USA.;Harvard Univ, Sch Med, Dept Genet, Boston, MA USA. (författare)
Beekman, MarianLeiden Univ, Med Ctr, Dept Mol Epidemiol, Leiden, Netherlands.;Netherlands Consortium Hlth Ageing, Leiden, Netherlands. (författare)
Nelson, Christopher PUniv Leicester, Dept Cardiovasc Sci, Leicester, Leics, England.;Natl Inst Hlth Res, Leicester Cardiovasc Dis Biomed Res Unit, Glenfield Hosp, Leicester, Leics, England. (författare)
Willenborg, ChristinaUniv Lubeck, Inst Integrat & Expt Gen, Lubeck, Germany.;DZHK German Ctr Cardiovascular Res, Lubeck, Germany. (författare)
Wiltshire, StevenUniv Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England.;Univ Oxford, Oxford Ctr Diabet Endocrinol & Metab, Oxford, England. (författare)
Ferreira, TeresaUniv Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England. (författare)
Fernandez, JuanUniv Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England. (författare)
Gaulton, Kyle JUniv Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England. (författare)
Steinthorsdottir, ValgerdurdeCode Genet Amgen Inc, Reykjavik, Iceland. (författare)
Hamsten, AndersKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Atherosclerosis Res Unit, Dept Med Solna, Cardiovascular Genet & Genom Grp, Stockholm, Sweden. (författare)
Magnusson, Patrik K EKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostatist, Stockholm, Sweden. (författare)
Willemsen, GonnekeVrije Univ Amsterdam, Dept Biol Psychol, Amsterdam, Netherlands. (författare)
Milaneschi, YuriVrije Univ Amsterdam, Dept Psychiat, Med Ctr, Amsterdam, Netherlands. (författare)
Robertson, Neil RUniv Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England.;Univ Oxford, Oxford Ctr Diabet Endocrinol & Metab, Oxford, England. (författare)
Groves, Christopher JUniv Oxford, Oxford Ctr Diabet Endocrinol & Metab, Oxford, England. (författare)
Bennett, Amanda JUniv Oxford, Oxford Ctr Diabet Endocrinol & Metab, Oxford, England. (författare)
Lehtimӓki, TerhoUniv Tampere, Dept Clin Chem, Fimlab Labs, FIN-33101 Tampere, Finland.;Univ Tampere, Sch Med, FIN-33101 Tampere, Finland. (författare)
Viikari, Jorma SUniv Turku, Dept Med, Turku, Finland.;Turku Univ Hosp, Div Med, FIN-20520 Turku, Finland. (författare)
Rung, JohanEuropean Bioinformat Inst, European Mol Biol Lab, Hinxton, England. (författare)
Lyssenko, ValeriyaLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups,Skane Univ Hosp, Lund Univ Diabet Ctr, Dept Clin Sci Diabet & Endocrinol, Malmo, Sweden.;Steno Diabet Ctr AS, Gentofte, Denmark.(Swepub:lu)endo-vly (författare)
Perola, MarkusUniv Helsinki, Inst Mol Med Finland FIMM, Helsinki, Finland.;Natl Inst Hlth & Welf, Helsinki, Finland. (författare)
Heid, Iris MUniv Regensburg, Dept Genet Epidemiol, Inst Epidemiol & Prevent Med, D-93053 Regensburg, Germany. (författare)
Herder, ChristianUniv Dusseldorf, Leibniz Inst Diabet Res, German Diabet Ctr, Inst Clin Diabetol, Dusseldorf, Germany.;German Ctr Diabet Res DZD eV, Partner Dusseldorf, Dusseldorf, Germany. (författare)
Grallert, HaraldHelmholtz Zentrum Munchen, German Res Ctr Environm Hlth, Res Unit Mol Epidemiol, Neuherberg, Germany.;Helmholtz Zentrum Munchen, German Res Ctr Environm Hlth, Inst Epidemiol 2, Neuherberg, Germany. (författare)
Müller-Nurasyid, MartinaHelmholtz Zentrum Munchen, Inst Genet Epidemiol, German Res Ctr Environm Hlth, Neuherberg, Germany.;Univ Munich, Univ Hosp Grosshadern, Dept Med 1, Munich, Germany.;Univ Munich, Inst Med Informat,Biometry & Epidemiol, Chair Genet Epidemiol, Munich, Germany. (författare)
Roden, MichaelUniv Dusseldorf, Leibniz Inst Diabet Res, German Diabet Ctr, Inst Clin Diabetol, Dusseldorf, Germany.;German Ctr Diabet Res DZD eV, Partner Dusseldorf, Dusseldorf, Germany.;Univ Hosp Dusseldorf, Dept Endocrinol & Diabetol, Dusseldorf, Germany. (författare)
Hypponen, ElinaUniv S Australia, Sch Populat Hlth, Adelaide, SA 5001, Australia.;UCL, Inst Child Hlth, Ctr Paediat Epidemiol & Biostat, London, England. (författare)
Isaacs, AaronErasmus Univ, Med Ctr, Dept Epidemiol, Genet Epidemiol Unit, Rotterdam, Netherlands.;Ctr Med Syst Biol, Leiden, Netherlands. (författare)
van Leeuwen, Elisabeth MErasmus Univ, Med Ctr, Dept Epidemiol, Genet Epidemiol Unit, Rotterdam, Netherlands. (författare)
Karssen, Lennart CErasmus Univ, Med Ctr, Dept Epidemiol, Genet Epidemiol Unit, Rotterdam, Netherlands. (författare)
Mihailov, EvelinUniv Tartu, Estonian Genome Ctr, EE-50090 Tartu, Estonia. (författare)
Houwing-Duistermaat, Jeanine JLeiden Univ, Med Ctr, Dept Med Stat & Bioinformat, Leiden, Netherlands. (författare)
de Craen, Anton J MNetherlands Consortium Hlth Ageing, Leiden, Netherlands.;Leiden Univ, Med Ctr, Dept Gerontol & Geriatr, Leiden, Netherlands.,Natl Inst Hlth & Welf, Dept Chron Dis Prevent, Turku, Finland. (författare)
Deelen, JorisLeiden Univ, Med Ctr, Dept Mol Epidemiol, Leiden, Netherlands.;Netherlands Consortium Hlth Ageing, Leiden, Netherlands. (författare)
Havulinna, Aki SNatl Inst Hlth & Welf, Unit Chron Dis Epidemiol & Prevent, Helsinki, Finland. (författare)
Blades, MatthewUniv Leicester, Bioinformat & Biostatist Support Hub, Leicester, Leics, England. (författare)
Hengstenberg, ChristianTech Univ Munich, Deutsch Herzzentrum Munchen, D-80290 Munich, Germany.;DZHK German Ctr Cardiovasc Res, Munich, Germany. (författare)
Erdmann, JeanetteUniv Lubeck, Inst Integrat & Expt Gen, Lubeck, Germany.;DZHK German Ctr Cardiovascular Res, Lubeck, Germany. (författare)
Schunkert, HeribertTech Univ Munich, Deutsch Herzzentrum Munchen, D-80290 Munich, Germany.;DZHK German Ctr Cardiovasc Res, Munich, Germany. (författare)
Kaprio, JaakkoUniv Helsinki, Inst Mol Med Finland FIMM, Helsinki, Finland.;Natl Inst Hlth & Welf, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Publ Hlth, Helsinki, Finland. (författare)
Tobin, Martin DUniv Leicester, Dept Hlth Sci, Genet Epidemiol Grp, Leicester, Leics, England.;Natl Inst Hlth Res, Leicester Resp Biomed Res Unit, Glenfield Hosp, Leicester, Leics, England. (författare)
Samani, Nilesh JUniv Leicester, Dept Cardiovasc Sci, Leicester, Leics, England.;Natl Inst Hlth Res, Leicester Cardiovasc Dis Biomed Res Unit, Glenfield Hosp, Leicester, Leics, England. (författare)
Lind, LarsUppsala universitet,Karolinska Institutet,Kardiovaskulär epidemiologi,Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostatist, Stockholm, Sweden.(Swepub:uu)larslind (författare)
Salomaa, VeikkoNatl Inst Hlth & Welf, Unit Chron Dis Epidemiol & Prevent, Helsinki, Finland. (författare)
Lindgren, Cecilia MUniv Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England.;Broad Inst Harvard & MIT, Broad Inst, Cambridge, MA USA. (författare)
Slagboom, P ElineLeiden Univ, Med Ctr, Dept Mol Epidemiol, Leiden, Netherlands.;Netherlands Consortium Hlth Ageing, Leiden, Netherlands. (författare)
Metspalu, AndresUniv Tartu, Estonian Genome Ctr, EE-50090 Tartu, Estonia.;Univ Tartu, Inst Mol & Cell Biol, EE-50090 Tartu, Estonia. (författare)
van Duijn, Cornelia MErasmus Univ, Med Ctr, Dept Epidemiol, Genet Epidemiol Unit, Rotterdam, Netherlands.;Ctr Med Syst Biol, Leiden, Netherlands. (författare)
Eriksson, Johan GUniv Helsinki, Dept Gen Practice & Primary Hlth Care, Helsinki, Finland.;Folkhalsan Res Ctr, Helsinki, Finland.;Vasa Cent Hosp, Vaasa, Finland.;Natl Inst Hlth & Welf, Dept Hlth Promot & Chron Dis Prevent, Helsinki, Finland. (författare)
Peters, AnnetteHelmholtz Zentrum Munchen, German Res Ctr Environm Hlth, Res Unit Mol Epidemiol, Neuherberg, Germany.;Helmholtz Zentrum Munchen, German Res Ctr Environm Hlth, Inst Epidemiol 2, Neuherberg, Germany. (författare)
Gieger, ChristianHelmholtz Zentrum Munchen, Inst Genet Epidemiol, German Res Ctr Environm Hlth, Neuherberg, Germany.;Helmholtz Zentrum Munchen, German Res Ctr Environm Hlth, Res Unit Mol Epidemiol, Neuherberg, Germany.;Helmholtz Zentrum Munchen, German Res Ctr Environm Hlth, Inst Epidemiol 2, Neuherberg, Germany. (författare)
Jula, Antti (författare)
Groop, LeifLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups,Univ Helsinki, Inst Mol Med Finland FIMM, Helsinki, Finland.;Skane Univ Hosp, Lund Univ Diabet Ctr, Dept Clin Sci Diabet & Endocrinol, Malmo, Sweden.(Swepub:lu)endo-lgr (författare)
Raitakari, Olli TUniv Turku, Res Ctr Appl & Prevent Cardiovasc Med, Turku, Finland.;Univ Turku, Dept Clin Physiol & Nucl Med, Turku, Finland.;Turku Univ Hosp, FIN-20520 Turku, Finland. (författare)
Power, ChrisUCL, Inst Child Hlth, Ctr Paediat Epidemiol & Biostat, London, England. (författare)
Penninx, Brenda W J H (författare)
de Geus, EcoVrije Univ Amsterdam, Dept Biol Psychol, Amsterdam, Netherlands.;Vrije Univ Amsterdam, EMGO Inst Hlth & Care Res, Amsterdam, Netherlands.;Vrije Univ Amsterdam, Med Ctr, Amsterdam, Netherlands. (författare)
Smit, Johannes HVrije Univ Amsterdam, Dept Psychiat, Med Ctr, Amsterdam, Netherlands. (författare)
Boomsma, Dorret IVrije Univ Amsterdam, Dept Biol Psychol, Amsterdam, Netherlands. (författare)
Pedersen, Nancy L (författare)
Ingelsson, ErikUppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Univ Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England.(Swepub:uu)ering425 (författare)
Thorsteinsdottir, UnnurdeCode Genet Amgen Inc, Reykjavik, Iceland.;Univ Iceland, Fac Med, Reykjavik, Iceland. (författare)
Stefansson, KarideCode Genet Amgen Inc, Reykjavik, Iceland.;Univ Iceland, Fac Med, Reykjavik, Iceland. (författare)
Ripatti, SamuliUniv Helsinki, Inst Mol Med Finland FIMM, Helsinki, Finland.;Natl Inst Hlth & Welf, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Publ Hlth, Helsinki, Finland.;Wellcome Trust Sanger Inst, Cambridge, England. (författare)
Prokopenko, IngaUniv London Imperial Coll Sci Technol & Med, Dept Genom Common Dis, Sch Publ Hlth, London, England. (författare)
McCarthy, Mark IUniv Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England.;Univ Oxford, Oxford Ctr Diabet Endocrinol & Metab, Oxford, England.;Churchill Hosp, Biomed Res Ctr, Oxford Natl Inst Hlth Res, Oxford OX3 7LJ, England. (författare)
Morris, Andrew PUniv Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England.;Univ Tartu, Estonian Genome Ctr, EE-50090 Tartu, Estonia.;Univ Liverpool, Dept Biostat, Liverpool L69 3BX, Merseyside, England.;Univ Liverpool, Dept Mol & Clin Pharmacol, Liverpool, Merseyside, England. (författare)
Maegi, ReedikUniv Tartu, Estonian Genome Ctr, EE-50090 Tartu, Estonia. (författare)
Univ Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England.;Univ Oxford, Oxford Ctr Diabet Endocrinol & Metab, Oxford, England.Univ Helsinki, Inst Mol Med Finland FIMM, Helsinki, Finland.;Natl Inst Hlth & Welf, Helsinki, Finland. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:PLoS Genetics: Public Library of Science (PLoS)11:71553-74041553-7390

Internetlänk

Hitta via bibliotek

PLoS Genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Horikoshi, Momok ...; Mӓgi, Reedik; van de Bunt, Mar ...; Surakka, Ida; Sarin, Antti-Pek ...; Mahajan, Anubha; visa fler...; Marullo, Letizia; Thorleifsson, Gu ...; Hägg, Sara; Hottenga, Jouke- ...; Ladenvall, Claes; Ried, Janina S; Winkler, Thomas ...; Willems, Sara M; Pervjakova, Nata ...; Esko, Tõnu; Beekman, Marian; Nelson, Christop ...; Willenborg, Chri ...; Wiltshire, Steve ...; Ferreira, Teresa; Fernandez, Juan; Gaulton, Kyle J; Steinthorsdottir ...; Hamsten, Anders; Magnusson, Patri ...; Willemsen, Gonne ...; Milaneschi, Yuri; Robertson, Neil ...; Groves, Christop ...; Bennett, Amanda ...; Lehtimӓki, Terho; Viikari, Jorma S; Rung, Johan; Lyssenko, Valeri ...; Perola, Markus; Heid, Iris M; Herder, Christia ...; Grallert, Harald; Müller-Nurasyid, ...; Roden, Michael; Hypponen, Elina; Isaacs, Aaron; van Leeuwen, Eli ...; Karssen, Lennart ...; Mihailov, Evelin; Houwing-Duisterm ...; de Craen, Anton ...; Deelen, Joris; Havulinna, Aki S; Blades, Matthew; Hengstenberg, Ch ...; Erdmann, Jeanett ...; Schunkert, Herib ...; Kaprio, Jaakko; Tobin, Martin D; Samani, Nilesh J; Lind, Lars; Salomaa, Veikko; Lindgren, Cecili ...; Slagboom, P Elin ...; Metspalu, Andres; van Duijn, Corne ...; Eriksson, Johan ...; Peters, Annette; Gieger, Christia ...; Jula, Antti; Groop, Leif; Raitakari, Olli ...; Power, Chris; Penninx, Brenda ...; de Geus, Eco; Smit, Johannes H; Boomsma, Dorret ...; Pedersen, Nancy ...; Ingelsson, Erik; Thorsteinsdottir ...; Stefansson, Kari; Ripatti, Samuli; Prokopenko, Inga; McCarthy, Mark I; Morris, Andrew P; Maegi, Reedik; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Endokrinologi oc ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

Artiklar i publikationen: PLoS Genetics

Av lärosätet: Lunds universitet; Karolinska Institutet; Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se