SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:9b9aad4c-a364-4655-98e0-c49059781c6b"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:9b9aad4c-a364-4655-98e0-c49059781c6b" > A GWAS follow-up st...

  • Bossini-Castillo, Lara (författare)

A GWAS follow-up study reveals the association of the IL12RB2 gene with systemic sclerosis in Caucasian populations

  • Artikel/kapitelEngelska2012

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2011-11-10
  • Oxford University Press (OUP),2012

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:9b9aad4c-a364-4655-98e0-c49059781c6b
  • https://lup.lub.lu.se/record/2416098URI
  • https://doi.org/10.1093/hmg/ddr522DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:123985807URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • A single-nucleotide polymorphism (SNP) at the IL12RB2 locus showed a suggestive association signal in a previously published genome-wide association study (GWAS) in systemic sclerosis (SSc). Aiming to reveal the possible implication of the IL12RB2 gene in SSc, we conducted a follow-up study of this locus in different Caucasian cohorts. We analyzed 10 GWAS-genotyped SNPs in the IL12RB2 region (2309 SSc patients and 5161 controls). We then selected three SNPs (rs3790567, rs3790566 and rs924080) based on their significance level in the GWAS, for follow-up in an independent European cohort comprising 3344 SSc and 3848 controls. The most-associated SNP (rs3790567) was further tested in an independent cohort comprising 597 SSc patients and 1139 controls from the USA. After conditional logistic regression analysis of the GWAS data, we selected rs3790567 [P-MH = 1.92 x 10(-5) odds ratio (OR) = 1.19] as the genetic variant with the firmest independent association observed in the analyzed GWAS peak of association. After the first follow-up phase, only the association of rs3790567 was consistent (P-MH = 4.84 x 10(-3) OR = 1.12). The second follow-up phase confirmed this finding (P-chi 2 = 2.82 x 10(-4) OR = 1.34). After performing overall pooled-analysis of all the cohorts included in the present study, the association found for the rs3790567 SNP in the IL12RB2 gene region reached GWAS-level significant association (P-MH = 2.82 x 10(-9) OR = 1.17). Our data clearly support the IL12RB2 genetic association with SSc, and suggest a relevant role of the interleukin 12 signaling pathway in SSc pathogenesis.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Martin, Jose-Ezequiel (författare)
  • Broen, Jasper (författare)
  • Gorlova, Olga (författare)
  • Simeon, Carmen P. (författare)
  • Beretta, Lorenzo (författare)
  • Vonk, Madelon C. (författare)
  • Luis Callejas, Jose (författare)
  • Castellvi, Ivan (författare)
  • Carreira, Patricia (författare)
  • Jose Garcia-Hernandez, Francisco (författare)
  • Fernandez Castro, Monica (författare)
  • Coenen, Marieke J. H. (författare)
  • Riemekasten, Gabriela (författare)
  • Witte, Torsten (författare)
  • Hunzelmann, Nicolas (författare)
  • Kreuter, Alexander (författare)
  • Distler, Joerg H. W. (författare)
  • Koeleman, Bobby P. (författare)
  • Voskuyl, Alexandre E. (författare)
  • Schuerwegh, Annemie J. (författare)
  • Palm, Oyvind (författare)
  • Hesselstrand, RogerLund University,Lunds universitet,Reumatologi och molekylär skelettbiologi,Sektion III,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Rheumatology,Section III,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)reum-rhe (författare)
  • Nordin, AnnikaKarolinska Institutet (författare)
  • Airo, Paolo (författare)
  • Lunardi, Claudio (författare)
  • Scorza, Raffaella (författare)
  • Shiels, Paul (författare)
  • van Laar, Jacob M. (författare)
  • Herrick, Ariane (författare)
  • Worthington, Jane (författare)
  • Denton, Christopher (författare)
  • Tan, Filemon K. (författare)
  • Arnett, Frank C. (författare)
  • Agarwal, Sandeep K. (författare)
  • Assassi, Shervin (författare)
  • Fonseca, Carmen (författare)
  • Mayes, Maureen D. (författare)
  • Radstake, Timothy R. D. J. (författare)
  • Martin, Javier (författare)
  • Reumatologi och molekylär skelettbiologiSektion III (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Human Molecular Genetics: Oxford University Press (OUP)21:4, s. 926-9330964-69061460-2083

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy