SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

(WFRF:(Glunk Viktoria))
 

Sökning: (WFRF:(Glunk Viktoria)) > Leveraging cross-sp...

  • Claussnitzer, Melina (författare)

Leveraging cross-species transcription factor binding site patterns: from diabetes risk Loci to disease mechanisms.

  • Artikel/kapitelEngelska2014

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Elsevier BV,2014
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:ab111aca-769a-4d9f-92c5-9231ec557d24
  • https://lup.lub.lu.se/record/4291144URI
  • https://doi.org/10.1016/j.cell.2013.10.058DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:128111323URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Genome-wide association studies have revealed numerous risk loci associated with diverse diseases. However, identification of disease-causing variants within association loci remains a major challenge. Divergence in gene expression due to cis-regulatory variants in noncoding regions is central to disease susceptibility. We show that integrative computational analysis of phylogenetic conservation with a complexity assessment of co-occurring transcription factor binding sites (TFBS) can identify cis-regulatory variants and elucidate their mechanistic role in disease. Analysis of established type 2 diabetes risk loci revealed a striking clustering of distinct homeobox TFBS. We identified the PRRX1 homeobox factor as a repressor of PPARG2 expression in adipose cells and demonstrate its adverse effect on lipid metabolism and systemic insulin sensitivity, dependent on the rs4684847 risk allele that triggers PRRX1 binding. Thus, cross-species conservation analysis at the level of co-occurring TFBS provides a valuable contribution to the translation of genetic association signals to disease-related molecular mechanisms.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Dankel, Simon N (författare)
  • Klocke, Bernward (författare)
  • Grallert, Harald (författare)
  • Glunk, Viktoria (författare)
  • Berulava, Tea (författare)
  • Lee, Heekyoung (författare)
  • Oskolkov, NikolayLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-nao (författare)
  • Fadista, JoaoLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-jft (författare)
  • Ehlers, Kerstin (författare)
  • Wahl, Simone (författare)
  • Hoffmann, Christoph (författare)
  • Qian, Kun (författare)
  • Rönn, TinaLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes - epigenetik,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups,Diabetes - Epigenetics(Swepub:lu)med-tar (författare)
  • Riess, Helene (författare)
  • Müller-Nurasyid, Martina (författare)
  • Bretschneider, Nancy (författare)
  • Schroeder, Timm (författare)
  • Skurk, Thomas (författare)
  • Horsthemke, Bernhard (författare)
  • Spieler, Derek (författare)
  • Klingenspor, Martin (författare)
  • Seifert, Martin (författare)
  • Kern, Michael J (författare)
  • Mejhert, NiklasKarolinska Institutet (författare)
  • Dahlman, IngridKarolinska Institutet (författare)
  • Hansson, OlaLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)medk-oha (författare)
  • Hauck, Stefanie M (författare)
  • Blüher, Matthias (författare)
  • Arner, PeterKarolinska Institutet (författare)
  • Groop, LeifLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)endo-lgr (författare)
  • Illig, Thomas (författare)
  • Suhre, Karsten (författare)
  • Hsu, Yi-Hsiang (författare)
  • Mellgren, Gunnar (författare)
  • Hauner, Hans (författare)
  • Laumen, Helmut (författare)
  • Genomik, diabetes och endokrinologiForskargrupper vid Lunds universitet (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Cell: Elsevier BV156:1-2, s. 343-3581097-41720092-8674

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • Cell (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy