SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Lakhani Sunil R.)
 

Sökning: WFRF:(Lakhani Sunil R.) > (2016) > The topography of m...

  • Morganella, SandroEuropean Bioinformatics Institute (författare)

The topography of mutational processes in breast cancer genomes

  • Artikel/kapitelEngelska2016

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2016-05-02
  • Springer Science and Business Media LLC,2016

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:ab43a332-5aec-4446-bde6-09b9546317f5
  • https://lup.lub.lu.se/record/ab43a332-5aec-4446-bde6-09b9546317f5URI
  • https://doi.org/10.1038/ncomms11383DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Somatic mutations in human cancers show unevenness in genomic distribution that correlate with aspects of genome structure and function. These mutations are, however, generated by multiple mutational processes operating through the cellular lineage between the fertilized egg and the cancer cell, each composed of specific DNA damage and repair components and leaving its own characteristic mutational signature on the genome. Using somatic mutation catalogues from 560 breast cancer whole-genome sequences, here we show that each of 12 base substitution, 2 insertion/deletion (indel) and 6 rearrangement mutational signatures present in breast tissue, exhibit distinct relationships with genomic features relating to transcription, DNA replication and chromatin organization. This signature-based approach permits visualization of the genomic distribution of mutational processes associated with APOBEC enzymes, mismatch repair deficiency and homologous recombinational repair deficiency, as well as mutational processes of unknown aetiology. Furthermore, it highlights mechanistic insights including a putative replication-dependent mechanism of APOBEC-related mutagenesis.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Alexandrov, Ludmil B.Los Alamos National Laboratory (författare)
  • Glodzik, DominikWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Zou, XueqingWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Davies, HelenWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Staaf, JohanLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)onk-jst (författare)
  • Sieuwerts, Anieta M.Erasmus University Medical Center (författare)
  • Brinkman, Arie B.Radboud University Nijmegen (författare)
  • Martin, SanchaWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Ramakrishna, ManasaWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Butler, AdamWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Kim, Hyung YongHanyang University (författare)
  • Borg, ÅkeLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)onk-abo (författare)
  • Sotiriou, ChristosInstitut Jules Bordet (författare)
  • Futreal, P. AndrewUniversity of Texas (författare)
  • Campbell, Peter J.Wellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Span, Paul N.Radboud University Nijmegen (författare)
  • Van Laere, StevenUniversity of Antwerp (författare)
  • Lakhani, Sunil R.Royal Brisbane and Women's Hospital (författare)
  • Eyfjord, Jorunn E.University of Iceland (författare)
  • Thompson, Alastair M.Ninewells Hospital and Medical School (författare)
  • Stunnenberg, Hendrik G.Radboud University Nijmegen (författare)
  • Van De Vijver, Marc J.Academic Medical Center of University of Amsterdam (AMC) (författare)
  • Martens, John W MErasmus University Medical Center (författare)
  • Børresen-Dale, Anne LiseUniversity of Oslo (författare)
  • Richardson, Andrea L.Dana-Farber Cancer Institute (författare)
  • Kong, GuHanyang University (författare)
  • Thomas, GillesCentre Léon Bérard (författare)
  • Sale, JulianMRC Laboratory of Molecular Biology (författare)
  • Rada, CristinaMRC Laboratory of Molecular Biology (författare)
  • Stratton, Michael R.Wellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Birney, EwanEuropean Bioinformatics Institute (författare)
  • Nik-Zainal, SerenaCambridge University Hospitals NHS Foundation Trust (författare)
  • European Bioinformatics InstituteLos Alamos National Laboratory (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Communications: Springer Science and Business Media LLC72041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy