SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:b6a78db8-4f29-4631-a467-0cc39a533ef8"
 

Sökning: id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:b6a78db8-4f29-4631-a467-0cc39a533ef8" > Reproducible Quanti...

  • Huttenhain, Ruth (författare)

Reproducible Quantification of Cancer-Associated Proteins in Body Fluids Using Targeted Proteomics

  • Artikel/kapitelEngelska2012

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • American Association for the Advancement of Science (AAAS),2012

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:b6a78db8-4f29-4631-a467-0cc39a533ef8
  • https://lup.lub.lu.se/record/2994974URI
  • https://doi.org/10.1126/scitranslmed.3003989DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • The rigorous testing of hypotheses on suitable sample cohorts is a major limitation in translational research. This is particularly the case for the validation of protein biomarkers; the lack of accurate, reproducible, and sensitive assays for most proteins has precluded the systematic assessment of hundreds of potential marker proteins described in the literature. Here, we describe a high-throughput method for the development and refinement of selected reaction monitoring (SRM) assays for human proteins. The method was applied to generate such assays for more than 1000 cancer-associated proteins, which are functionally related to candidate cancer driver mutations. We used the assays to determine the detectability of the target proteins in two clinically relevant samples: plasma and urine. One hundred eighty-two proteins were detected in depleted plasma, spanning five orders of magnitude in abundance and reaching below a concentration of 10 ng/ml. The narrower concentration range of proteins in urine allowed the detection of 408 proteins. Moreover, we demonstrate that these SRM assays allow reproducible quantification by monitoring 34 biomarker candidates across 83 patient plasma samples. Through public access to the entire assay library, researchers will be able to target their cancer-associated proteins of interest in any sample type using the detectability information in plasma and urine as a guide. The generated expandable reference map of SRM assays for cancer-associated proteins will be a valuable resource for accelerating and planning biomarker verification studies.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Soste, Martin (författare)
  • Selevsek, Nathalie (författare)
  • Roest, Hannes (författare)
  • Sethi, Atul (författare)
  • Carapito, Christine (författare)
  • Farrah, Terry (författare)
  • Deutsch, Eric W. (författare)
  • Kusebauch, Ulrike (författare)
  • Moritz, Robert L. (författare)
  • Niméus, EmmaLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Bröstcancer Proteogenomik,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Breast cancer Proteogenomics,Lund University Research Groups(Swepub:lu)onk-ens (författare)
  • Rinner, Oliver (författare)
  • Aebersold, Ruedi (författare)
  • Bröstcancer-genetikSektion I (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Science Translational Medicine: American Association for the Advancement of Science (AAAS)4:142, s. 94-1421946-62421946-6234

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy