Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:c2a7dbf3-db33-45ce-8378-966eeaeca562" >
Mantle cell lymphom...
-
Halldorsdottir, Anna MargretUppsala universitet,Hematologi och immunologi,Rosenquist Brandell
(författare)
Mantle cell lymphoma displays a homogenous methylation profile: A comparative analysis with chronic lymphocytic leukemia
- Artikel/kapitelEngelska2012
Förlag, utgivningsår, omfång ...
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:c2a7dbf3-db33-45ce-8378-966eeaeca562
-
https://lup.lub.lu.se/record/2587537URI
-
https://doi.org/10.1002/ajh.23115DOI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:124322112URI
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-173631URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Anmärkningar
-
Mantle cell lymphoma (MCL) and chronic lymphocytic leukemia (CLL) are mature CD5(+) B-cell malignancies with different biological/clinical characteristics. We recently reported an association between different prognostic subgroups of CLL (i.e., IGHV mutated and unmutated) and genomic methylation pattern. However, the relationship between DNA methylation and prognostic markers, such as the proliferation gene expression signature, has not been investigated in MCL. We applied high-resolution methylation microarrays (27,578 CpG sites) to assess the global DNA methylation profiles in 20 MCL (10 each with high/low proliferation signature) and 30 CLL (15 poor-prognostic IGHV unmutated subset #1 and 15 good-prognostic IGHV mutated subset #4) samples. Notably, MCL and each CLL subset displayed distinct genomic methylation profiles. After unsupervised hierarchical clustering, 17/20 MCL cases formed a cluster separate from CLL, while CLL subsets #1 and #4 formed subclusters. Surprisingly, few differentially methylated genes (n = 6) were identified between high vs. low proliferation MCL. In contrast, distinct methylation profiles were demonstrated for MCL and CLL. Importantly, certain functional classes of genes were preferentially methylated in either disease. For instance, developmental genes, in particular homeobox transcription factor genes (e.g., HLXB9, HOXA13), were more highly methylated in MCL, whereas apoptosis-related genes were enriched among targets methylated in CLL (e.g., CYFIP2, NR4A1). Results were validated using pyrosequencing, RQ-PCR and reexpression of specific genes. In summary, the methylation profile of MCL was homogeneous and no correlation with the proliferation signature was observed. Compared to CLL, however, marked differences were discovered such as the preferential methylation of homeobox genes in MCL. Am. J. Hematol., 2012. (C) 2012 Wiley Periodicals, Inc.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Kanduri, MeenaUppsala universitet,Hematologi och immunologi,Rosenquist Brandell(Swepub:uu)meenkand
(författare)
-
Marincevic, MillarayUppsala universitet,Hematologi och immunologi,Rosenquist Brandell(Swepub:uu)milma629
(författare)
-
Mansouri, LarryUppsala universitet,Hematologi och immunologi,Rosenquist Brandell(Swepub:uu)maman377
(författare)
-
Isaksson, AndersUppsala universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin(Swepub:uu)andeisak
(författare)
-
Göransson, HannaUppsala universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin(Swepub:uu)hagor102
(författare)
-
Axelsson, TomasUppsala universitet,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)toaxe957
(författare)
-
Agarwal, PrasoonUppsala universitet,Hematologi och immunologi,Jernberg-Wiklund(Swepub:uu)praag698
(författare)
-
Jernberg-Wiklund, HelenaUppsala universitet,Hematologi och immunologi,Jernberg-Wiklund(Swepub:uu)helenajw
(författare)
-
Stamatopoulos, Kostas
(författare)
-
Sander, BirgittaKarolinska Institutet
(författare)
-
Ehrencrona, HansUppsala universitet,Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Medicinsk genetik,Hellström Pigg(Swepub:uu)habos227
(författare)
-
Rosenquist, RichardUppsala universitet,Hematologi och immunologi,Rosenquist Brandell(Swepub:uu)richrose
(författare)
-
Uppsala universitetHematologi och immunologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:American Journal of Hematology: Wiley87:4, s. 361-3670361-86091096-8652
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Halldorsdottir, ...
-
Kanduri, Meena
-
Marincevic, Mill ...
-
Mansouri, Larry
-
Isaksson, Anders
-
Göransson, Hanna
-
visa fler...
-
Axelsson, Tomas
-
Agarwal, Prasoon
-
Jernberg-Wiklund ...
-
Stamatopoulos, K ...
-
Sander, Birgitta
-
Ehrencrona, Hans
-
Rosenquist, Rich ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Hematologi
- Artiklar i publikationen
-
American Journal ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet
-
Karolinska Institutet
-
Uppsala universitet