SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Huhn M.)
 

Sökning: WFRF:(Huhn M.) > Coding variants in ...

  • Huhn, StefanieGerman Cancer Research Centre,University Hospital Heidelberg (författare)

Coding variants in NOD-like receptors : An association study on risk and survival of colorectal cancer

  • Artikel/kapitelEngelska2018

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2018-06-21
  • Public Library of Science (PLoS),2018

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:c3f151a7-24e8-43eb-b18b-f9f7813a1b3c
  • https://lup.lub.lu.se/record/c3f151a7-24e8-43eb-b18b-f9f7813a1b3cURI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pone.0199350DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Nod-like receptors (NLRs) are important innate pattern recognition receptors and regulators of inflammation or play a role during development. We systematically analysed 41 non-synonymous single nucleotide polymorphisms (SNPs) in 21 NLR genes in a Czech discovery cohort of sporadic colorectal cancer (CRC) (1237 cases, 787 controls) for their association with CRC risk and survival. Five SNPs were found to be associated with CRC risk and eight with survival at 5% significance level. In a replication analysis using data of two large genome-wide association studies (GWASs) from Germany (DACHS: 1798 cases and 1810 controls) and Scotland (2210 cases and 9350 controls) the associations found in the Czech discovery set were not confirmed. However, expression analysis in human gut-related tissues and immune cells revealed that the NLRs associated with CRC risk or survival in the discovery set were expressed in primary human colon or rectum cells, CRC tissue and/or cell lines, providing preliminary evidence for a potential involvement of NLRs in general in CRC development and/or progression. Most interesting was the finding that the enigmatic development-related NLRP5 (also known as MATER) was not expressed in normal colon tissue but in colon cancer tissue and cell lines. Future studies may show whether regulatory variants instead of coding variants might affect the expression of NLRs and contribute to CRC risk and survival.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • da Silva Filho, Miguel I.German Cancer Research Centre(Swepub:lu)med-md_ (författare)
  • Sanmuganantham, TharmilaUniversity of Tübingen (författare)
  • Pichulik, TicaUniversity of Tübingen (författare)
  • Catalano, CalogerinaGerman Cancer Research Centre (författare)
  • Pardini, BarbaraInstitute of Experimental Medicine, Czech Academy of Science,Italian Institute for Genomic Medicine (IIGM) (författare)
  • Naccarati, AlessioItalian Institute for Genomic Medicine (IIGM),Institute of Experimental Medicine, Czech Academy of Science (författare)
  • Polakova-Vymetálkova, VeronikaInstitute of Experimental Medicine, Czech Academy of Science,Charles University in Prague (författare)
  • Jiraskova, KaterinaInstitute of Experimental Medicine, Czech Academy of Science,Charles University in Prague (författare)
  • Vodickova, LudmilaCharles University in Prague,Institute of Experimental Medicine, Czech Academy of Science (författare)
  • Vodicka, PavelInstitute of Experimental Medicine, Czech Academy of Science,Charles University in Prague (författare)
  • Löffler, Markus W.University Hospital of Tubingen,University of Tübingen (författare)
  • Courth, LiobaUniversity Hospital of Tubingen (författare)
  • Wehkamp, JanUniversity Hospital of Tubingen (författare)
  • Din, Farhat V.N.University of Edinburgh (författare)
  • Timofeeva, MariaUniversity of Edinburgh (författare)
  • Farrington, Susan M.University of Edinburgh (författare)
  • Jansen, LinaGerman Cancer Research Centre (författare)
  • Hemminki, KariLund University,Lunds universitet,Allmänmedicin och klinisk epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Family Medicine and Clinical Epidemiology,Lund University Research Groups,Center for Primary Health Care Research,German Cancer Research Centre(Swepub:lu)med-khk (författare)
  • Chang-Claude, JennyGerman Cancer Research Centre (författare)
  • Brenner, HermannGerman Cancer Research Centre (författare)
  • Hoffmeister, MichaelGerman Cancer Research Centre (författare)
  • Dunlop, Malcolm G.University of Edinburgh (författare)
  • Weber, Alexander N.R.University of Tübingen (författare)
  • Försti, AstaLund University,Lunds universitet,Allmänmedicin och klinisk epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Family Medicine and Clinical Epidemiology,Lund University Research Groups,German Cancer Research Centre,Center for Primary Health Care Research(Swepub:lu)med-asf (författare)
  • German Cancer Research CentreUniversity Hospital Heidelberg (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLoS ONE: Public Library of Science (PLoS)13:61932-6203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • PLoS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy