L773:2409 9279
Sökning: L773:2409 9279 > OCTAVVS : A graphic...
OCTAVVS : A graphical toolbox for high-throughput preprocessing and analysis of vibrational spectroscopy imaging data
-
- Troein, Carl (författare)
- Lund University,Lunds universitet,MEMEG,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Har omorganiserats,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Har omorganiserats,Beräkningsvetenskap för hälsa och miljö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Department of Biology,Faculty of Science,Computational Biology and Biological Physics - Has been reorganised,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Has been reorganised,Computational Science for Health and Environment,Lund University Research Groups
-
- Siregar, Syahril (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Har omorganiserats,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Har omorganiserats,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics - Has been reorganised,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Has been reorganised,Faculty of Science
-
- Op De Beeck, Michiel (författare)
- Lund University,Lunds universitet,MEMEG,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,BECC: Biodiversity and Ecosystem services in a Changing Climate,Centrum för miljö- och klimatvetenskap (CEC),Molekylär ekologi och evolution,Forskargrupper vid Lunds universitet,Department of Biology,Faculty of Science,Centre for Environmental and Climate Science (CEC),Molecular Ecology and Evolution Lab,Lund University Research Groups
- visa fler...
- visa färre...
- (creator_code:org_t)
- 2020-05-01
- 2020
- Engelska 15 s.
- Ingår i: Methods and Protocols. - : MDPI AG. - 2409-9279. ; 3:2, s. 1-15
- Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Modern vibrational spectroscopy techniques enable the rapid collection of thousands of spectra in a single hyperspectral image, allowing researchers to study spatially heterogeneous samples at micrometer resolution. A number of algorithms have been developed to correct for effects such as atmospheric absorption, light scattering by cellular structures and varying baseline levels. After preprocessing, spectra are commonly decomposed and clustered to reveal informative patterns and subtle spectral changes. Several of these steps are slow, labor-intensive and require programming skills to make use of published algorithms and code. We here present a free and platform-independent graphical toolbox that allows rapid preprocessing of large sets of spectroscopic images, including atmospheric correction and a new algorithm for resonant Mie scattering with improved speed. The software also includes modules for decomposition into constituent spectra using the popular Multivariate Curve Resolution–Alternating Least Squares (MCR-ALS) algorithm, augmented by region-of-interest selection, as well as clustering and cluster annotation.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Fysik -- Annan fysik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Physical Sciences -- Other Physics Topics (hsv//eng)
Nyckelord
- Atmospheric correction
- Hyperspectral
- Infrared spectroscopy
- MCR-ALS
- Mie scattering correction
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Troein, Carl
- Siregar, Syahril
- Op De Beeck, Mic ...
- Peterson, Carste ...
- Tunlid, Anders
- Persson, Per
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Fysik
- och Annan fysik
- Artiklar i publikationen
- Methods and Prot ...
- Av lärosätet
- Lunds universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
