The dynamics of genomic-length DNA molecules in 100-nm channels

Tegenfeldt, JonasLund University,Lunds universitet,Fasta tillståndets fysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Solid State Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH (författare)

We show that genomic-length DNA molecules imaged in nano-channels have an extension along the channel that scales linearly with the contour length of the polymer, in agreement with the scaling arguments developed by de Gennes for self-avoiding confined polymers. This fundamental relationship allows us to measure directly the contour length of single DNA molecules confined in the channels, and the statistical analysis of the dynamics of the polymer in the nanochannel allows us to compute the SD of the mean of the extension. This statistical analysis allows us to measure the extension of A DNA multimers with a 130-nm SD in 1 min.

Prinz, ChristelleLund University,Lunds universitet,Fasta tillståndets fysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Solid State Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)ftf-cpr (författare)
Cao, H (författare)
Chou, S (författare)
Reisner, WW (författare)
Riehn, R (författare)
Wang, YM (författare)
Cox, EC (författare)
Sturm, JC (författare)
Silberzan, P (författare)
Austin, RH (författare)
Fasta tillståndets fysikFysiska institutionen (creator_code:org_t)

Ingår i:Proceedings of the National Academy of Sciences: Proceedings of the National Academy of Sciences101:30, s. 10979-109831091-64900027-8424

Av författaren/redakt...: Tegenfeldt, Jona ...; Prinz, Christell ...; Cao, H; Chou, S; Reisner, WW; Riehn, R; visa fler...; Wang, YM; Cox, EC; Sturm, JC; Silberzan, P; Austin, RH; visa färre...

Om ämnet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.