Distinct global binding patterns of the Wilms' tumor gene 1 (WT1) -KTS and +KTS isoforms in leukemic cells

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Nilsson Linnea) > Distinct global bin...

Distinct global binding patterns of the Wilms' tumor gene 1 (WT1) -KTS and +KTS isoforms in leukemic cells

Ullmark, Tove (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Undersökning av molekylära sjukdomsmekanismer vid blodcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Transcriptional mechanisms for the Wilms’ tumor gene 1 (WT1) oncoprotein,Lund University Research Groups

Järvstråt, Linnea (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine

Sanden, Carl (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine

visa fler...

Montano, Giorgia (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Undersökning av molekylära sjukdomsmekanismer vid blodcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Transcriptional mechanisms for the Wilms’ tumor gene 1 (WT1) oncoprotein,Lund University Research Groups

Jernmark-Nilsson, Helena (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Undersökning av molekylära sjukdomsmekanismer vid blodcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Transcriptional mechanisms for the Wilms’ tumor gene 1 (WT1) oncoprotein,Lund University Research Groups

Lilljebjörn, Henrik (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine

Lennartsson, Andreas (författare): Karolinska Institutet,Karolinska Institute

Fioretos, Thoas (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine

Drott, Kristina (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Lymfom - Klinisk forskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lymphoma - Clinical Research,Lund University Research Groups

Vidovic, Karina (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine

Nilsson, Björn (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine

Gullberg, Urban (författare): Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Undersökning av molekylära sjukdomsmekanismer vid blodcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Transcriptional mechanisms for the Wilms’ tumor gene 1 (WT1) oncoprotein,Lund University Research Groups

visa färre...

(creator_code:org_t)

2016-09-09
2017
Engelska.
Ingår i: Haematologica. - : Ferrata Storti Foundation (Haematologica). - 1592-8721 .- 0390-6078. ; 102:2, s. 336-345

Relaterad länk:: http://dx.doi.org/10... (free); visa fler...; https://doi.org/10.3...; https://lup.lub.lu.s...; https://doi.org/10.3...; http://kipublication...; visa färre...

Tidskriftsartikel (refereegranskat)

Abstract Ämnesord

Stäng

The zinc finger transcription factor Wilms' tumor gene 1 (WT1) acts as an oncogene in acute myeloid leukemia. A naturally occurring alternative splice event between zinc fingers three and four, removing or retaining three amino acids (+/-KTS), is believed to change the DNA binding affinity of WT1, although there are conflicting data regarding the binding affinity and motifs of the different isoforms. Increased expression of WT1 -KTS at the expense of WT1 +KTS isoform associates with poor prognosis in acute myeloid leukemia. We determined the genome-wide binding pattern of WT1 -KTS and WT1 +KTS in leukemic K562 cells by chromatin immunoprecipitation and deep sequencing (ChIP-seq). Motif discovery revealed distinct binding motifs for the isoforms, some of which have been previously reported as WT1 binding sites. We discovered that the WT1 -KTS isoform predominantly binds close to transcription start sites and to enhancers, in a similar fashion to other transcription factors, whereas WT1 +KTS binding is rather enriched within gene bodies. We observed a significant overlap between WT1 -KTS and WT1 +KTS target genes, despite the binding sites being distinct. Motif discovery revealed distinct binding motifs for the isoforms, some of which have been previously reported as WT1 binding sites. Additional analyses showed that both WT1 -KTS and WT1 +KTS target genes are more likely to be transcribed than non-targets, and are involved in cell proliferation, cell death, and development. Our study provides evidence that WT1 -KTS and WT1 +KTS share target genes yet still bind distinct locations, indicating isoform-specific regulation in transcription of genes related to cell proliferation and differentiation, consistent with involvement of WT1 in acute myeloid leukemia.

Hitta via bibliotek

Haematologica (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Ullmark, Tove; Järvstråt, Linne ...; Sanden, Carl; Montano, Giorgia; Jernmark-Nilsson ...; Lilljebjörn, Hen ...; visa fler...; Lennartsson, And ...; Fioretos, Thoas; Drott, Kristina; Vidovic, Karina; Nilsson, Björn; Gullberg, Urban; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Hematologi

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Cell och molekyl ...

Artiklar i publikationen: Haematologica

Av lärosätet: Lunds universitet; Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se

Distinct global binding patterns of the Wilms' tumor gene 1 (WT1) -KTS and +KTS isoforms in leukemic cells

Ämnesord

Publikations- och innehållstyp

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Sök utanför SwePub