SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Eriksson Jonatan)
 

Sökning: WFRF:(Eriksson Jonatan) > (2015-2019) > Merging clinical ch...

  • Eriksson, JonatanLund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH (författare)

Merging clinical chemistry biomarker data with a COPD database - building a clinical infrastructure for proteomic studies

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2017-04-21
  • Springer Science and Business Media LLC,2017

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:d67f4cb9-b260-4e1f-9aa8-ccf2cdfe6770
  • https://lup.lub.lu.se/record/d67f4cb9-b260-4e1f-9aa8-ccf2cdfe6770URI
  • https://doi.org/10.1186/s12953-017-0116-2DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Background: Data from biological samples and medical evaluations plays an essential part in clinical decision making. This data is equally important in clinical studies and it is critical to have an infrastructure that ensures that its quality is preserved throughout its entire lifetime. We are running a 5-year longitudinal clinical study, KOL-Örestad, with the objective to identify new COPD (Chronic Obstructive Pulmonary Disease) biomarkers in blood. In the study, clinical data and blood samples are collected from both private and public health-care institutions and stored at our research center in databases and biobanks, respectively. The blood is analyzed by Mass Spectrometry and the results from this analysis then linked to the clinical data. Method: We built an infrastructure that allows us to efficiently collect and analyze the data. We chose to use REDCap as the EDC (Electronic Data Capture) tool for the study due to its short setup-time, ease of use, and flexibility. REDCap allows users to easily design data collection modules based on existing templates. In addition, it provides two functions that allow users to import batches of data; through a web API (Application Programming Interface) as well as by uploading CSV-files (Comma Separated Values). Results: We created a software, DART (Data Rapid Translation), that translates our biomarker data into a format that fits REDCap's CSV-templates. In addition, DART is configurable to work with many other data formats as well. We use DART to import our clinical chemistry data to the REDCap database. Conclusion: We have shown that a powerful and internationally adopted EDC tool such as REDCap can be extended so that it can be used efficiently in proteomic studies. In our study, we accomplish this by using DART to translate our clinical chemistry data to a format that fits the templates of REDCap.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Andersson, SimoneEncap Security (författare)
  • Appelqvist, RogerLund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)elma-rai (författare)
  • Wieslander, ElisabetLund University,Lunds universitet,Tumörmikromiljö,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Tumor microenvironment,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)med-etw (författare)
  • Truedsson, MikaelÖrestadskliniken Vårdcentral AB(Swepub:lu)med-met (författare)
  • Bugge, MayÖrestadskliniken Vårdcentral AB (författare)
  • Malm, JohanLund University,Lunds universitet,Klinisk kemi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Chemistry, Malmö,Lund University Research Groups(Swepub:lu)klke-jma (författare)
  • Dahlbäck, MagnusLund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)elma-mdc (författare)
  • Andersson, BoLund University (författare)
  • Fehniger, Thomas E.Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)elma-tfr (författare)
  • Marko-Varga, GyörgyLund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH,Tokyo Medical University(Swepub:lu)akem-gmv (författare)
  • Avdelningen för Biomedicinsk teknikInstitutionen för biomedicinsk teknik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Proteome Science: Springer Science and Business Media LLC15:11477-5956

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy