Epigenome-wide meta-analysis of blood DNA methylation in newborns and children identifies numerous loci related to gestational age

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: WFRF:(Söderhäll Cilla) > Nystad Wenche > Epigenome-wide meta...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Merid, Simon KebedeKarolinska Institutet (författare)

Epigenome-wide meta-analysis of blood DNA methylation in newborns and children identifies numerous loci related to gestational age

Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2020-03-02
Stockholm :Karolinska Institutet, Dept of Clinical Science and Education, Södersjukhuset,2020
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:openarchive.ki.se:10616/47545
ISSN:1756-994X
10616/47545hdl
http://hdl.handle.net/10616/47545URI
https://doi.org/10.1186/s13073-020-0716-9DOI
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:143157867URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Background: Preterm birth and shorter duration of pregnancy are associated with increased morbidity in neonatal and later life. As the epigenome is known to have an important role during fetal development, we investigated associations between gestational age and blood DNA methylation in children. Methods: We performed meta-analysis of Illumina's HumanMethylation450-array associations between gestational age and cord blood DNA methylation in 3648 newborns from 17 cohorts without common pregnancy complications, induced delivery or caesarean section. We also explored associations of gestational age with DNA methylation measured at 4-18 years in additional pediatric cohorts. Follow-up analyses of DNA methylation and gene expression correlations were performed in cord blood. DNA methylation profiles were also explored in tissues relevant for gestational age health effects: fetal brain and lung. Results: We identified 8899 CpGs in cord blood that were associated with gestational age (range 27-42 weeks), at Bonferroni significance, P < 1.06 × 10- 7, of which 3343 were novel. These were annotated to 4966 genes. After restricting findings to at least three significant adjacent CpGs, we identified 1276 CpGs annotated to 325 genes. Results were generally consistent when analyses were restricted to term births. Cord blood findings tended not to persist into childhood and adolescence. Pathway analyses identified enrichment for biological processes critical to embryonic development. Follow-up of identified genes showed correlations between gestational age and DNA methylation levels in fetal brain and lung tissue, as well as correlation with expression levels. Conclusions: We identified numerous CpGs differentially methylated in relation to gestational age at birth that appear to reflect fetal developmental processes across tissues. These findings may contribute to understanding mechanisms linking gestational age to health effects.

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Novoloaca, Alexei (författare)
Sharp, Gemma C (författare)
Küpers, Leanne K (författare)
Kho, Alvin T (författare)
Roy, Ritu (författare)
Gao, Lu (författare)
Annesi-Maesano, Isabella (författare)
Jain, Pooja (författare)
Plusquin, Michelle (författare)
Kogevinas, Manolis (författare)
Allard, Catherine (författare)
Vehmeijer, Florianne O (författare)
Kazmi, Nabila (författare)
Salas, Lucas A (författare)
Rezwan, Faisal I (författare)
Zhang, Hongmei (författare)
Sebert, Sylvain (författare)
Czamara, Darina (författare)
Rifas-Shiman, Sheryl L (författare)
Melton, Phillip EKarolinska Institutet (författare)
Lawlor, Debbie A (författare)
Pershagen, GöranKarolinska Institutet (författare)
Breton, Carrie V (författare)
Huen, Karen (författare)
Baiz, Nour (författare)
Gagliardi, Luigi (författare)
Nawrot, Tim S (författare)
Corpeleijn, Eva (författare)
Perron, PatriceKarolinska Institutet (författare)
Duijts, Liesbeth (författare)
Nohr, Ellen Aagaard (författare)
Bustamante, Mariona (författare)
Ewart, Susan L (författare)
Karmaus, Wilfried (författare)
Zhao, Shanshan (författare)
Page, Christian M (författare)
Herceg, Zdenko (författare)
Jarvelin, Marjo-Riitta (författare)
Lahti, Jari (författare)
Baccarelli, Andrea A (författare)
Anderson, Denise (författare)
Kachroo, Priyadarshini (författare)
Relton, Caroline L (författare)
Bergström, AnnaKarolinska Institutet (författare)
Eskenazi, Brenda (författare)
Soomro, Munawar Hussain (författare)
Vineis, Paolo (författare)
Snieder, Harold (författare)
Bouchard, Luigi (författare)
Jaddoe, Vincent W (författare)
Sørensen, Thorkild I A (författare)
Vrijheid, Martine (författare)
Arshad, S Hasan (författare)
Holloway, John W (författare)
Håberg, Siri E (författare)
Magnus, Per (författare)
Dwyer, Terence (författare)
Binder, Elisabeth B (författare)
DeMeo, Dawn L (författare)
Vonk, Judith M (författare)
Newnham, John (författare)
Tantisira, Kelan G (författare)
Kull, IngerKarolinska Institutet (författare)
Wiemels, Joseph L (författare)
Heude, Barbara (författare)
Sunyer, Jordi (författare)
Nystad, Wenche (författare)
Munthe-Kaas, Monica C (författare)
Räikkönen, Katri (författare)
Oken, Emily (författare)
Huang, Rae-Chi (författare)
Weiss, Scott T (författare)
Antó, Josep Maria (författare)
Bousquet, Jean (författare)
Kumar, Ashish (författare)
Söderhäll, CillaKarolinska Institutet (författare)
Almqvist, CatarinaKarolinska Institutet (författare)
Cardenas, Andres (författare)
Gruzieva, OlenaKarolinska Institutet (författare)
Xu, Cheng-Jian (författare)
Reese, Sarah E (författare)
Kere, JuhaKarolinska Institutet (författare)
Brodin, Petter (författare)
Solomon, Olivia (författare)
Wielscher, Matthias (författare)
Holland, Nina (författare)
Ghantous, Akram (författare)
Hivert, Marie-France (författare)
Felix, Janine F (författare)
Koppelman, Gerard H (författare)
London, Stephanie J (författare)
Melén, Erik (författare)
Karolinska Institutet
Karolinska Institutet
Karolinska Institutet (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Genome MedicineStockholm : Karolinska Institutet, Dept of Clinical Science and Education, Södersjukhuset1756-994X

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Genome Medicine (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Merid, Simon Keb ...; Novoloaca, Alexe ...; Sharp, Gemma C; Küpers, Leanne K; Kho, Alvin T; Roy, Ritu; visa fler...; Gao, Lu; Annesi-Maesano, ...; Jain, Pooja; Plusquin, Michel ...; Kogevinas, Manol ...; Allard, Catherin ...; Vehmeijer, Flori ...; Kazmi, Nabila; Salas, Lucas A; Rezwan, Faisal I; Zhang, Hongmei; Sebert, Sylvain; Czamara, Darina; Rifas-Shiman, Sh ...; Melton, Phillip ...; Lawlor, Debbie A; Pershagen, Göran; Breton, Carrie V; Huen, Karen; Baiz, Nour; Gagliardi, Luigi; Nawrot, Tim S; Corpeleijn, Eva; Perron, Patrice; Duijts, Liesbeth; Nohr, Ellen Aaga ...; Bustamante, Mari ...; Ewart, Susan L; Karmaus, Wilfrie ...; Zhao, Shanshan; Page, Christian ...; Herceg, Zdenko; Jarvelin, Marjo- ...; Lahti, Jari; Baccarelli, Andr ...; Anderson, Denise; Kachroo, Priyada ...; Relton, Caroline ...; Bergström, Anna; Eskenazi, Brenda; Soomro, Munawar ...; Vineis, Paolo; Snieder, Harold; Bouchard, Luigi; Jaddoe, Vincent ...; Sørensen, Thorki ...; Vrijheid, Martin ...; Arshad, S Hasan; Holloway, John W; Håberg, Siri E; Magnus, Per; Dwyer, Terence; Binder, Elisabet ...; DeMeo, Dawn L; Vonk, Judith M; Newnham, John; Tantisira, Kelan ...; Kull, Inger; Wiemels, Joseph ...; Heude, Barbara; Sunyer, Jordi; Nystad, Wenche; Munthe-Kaas, Mon ...; Räikkönen, Katri; Oken, Emily; Huang, Rae-Chi; Weiss, Scott T; Antó, Josep Mari ...; Bousquet, Jean; Kumar, Ashish; Söderhäll, Cilla; Almqvist, Catari ...; Cardenas, Andres; Gruzieva, Olena; Xu, Cheng-Jian; Reese, Sarah E; Kere, Juha; Brodin, Petter; Solomon, Olivia; Wielscher, Matth ...; Holland, Nina; Ghantous, Akram; Hivert, Marie-Fr ...; Felix, Janine F; Koppelman, Gerar ...; London, Stephani ...; Melén, Erik; visa färre...

Artiklar i publikationen: Genome Medicine

Av lärosätet: Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se