id:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:137049724"
Sökning: id:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:137049724" > Systems pathology b...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
- Blom, S (författare)
Systems pathology by multiplexed immunohistochemistry and whole-slide digital image analysis
- Artikel/kapitelEngelska2017
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- 2017-11-14
- Springer Science and Business Media LLC,2017
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:prod.swepub.kib.ki.se:137049724
- http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:137049724URI
- https://doi.org/10.1038/s41598-017-15798-4DOI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- The paradigm of molecular histopathology is shifting from a single-marker immunohistochemistry towards multiplexed detection of markers to better understand the complex pathological processes. However, there are no systems allowing multiplexed IHC (mIHC) with high-resolution whole-slide tissue imaging and analysis, yet providing feasible throughput for routine use. We present an mIHC platform combining fluorescent and chromogenic staining with automated whole-slide imaging and integrated whole-slide image analysis, enabling simultaneous detection of six protein markers and nuclei, and automatic quantification and classification of hundreds of thousands of cells in situ in formalin-fixed paraffin-embedded tissues. In the first proof-of-concept, we detected immune cells at cell-level resolution (n = 128,894 cells) in human prostate cancer, and analysed T cell subpopulations in different tumour compartments (epithelium vs. stroma). In the second proof-of-concept, we demonstrated an automatic classification of epithelial cell populations (n = 83,558) and glands (benign vs. cancer) in prostate cancer with simultaneous analysis of androgen receptor (AR) and alpha-methylacyl-CoA (AMACR) expression at cell-level resolution. We conclude that the open-source combination of 8-plex mIHC detection, whole-slide image acquisition and analysis provides a robust tool allowing quantitative, spatially resolved whole-slide tissue cytometry directly in formalin-fixed human tumour tissues for improved characterization of histology and the tumour microenvironment.
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Paavolainen, L (författare)
- Bychkov, D (författare)
- Turkki, R (författare)
- Maki-Teeri, P (författare)
- Hemmes, A (författare)
- Valimaki, K (författare)
- Lundin, JKarolinska Institutet (författare)
- Kallioniemi, OKarolinska Institutet (författare)
- Pellinen, T (författare)
- Karolinska Institutet (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:Scientific reports: Springer Science and Business Media LLC7:1, s. 15580-2045-2322
Internetlänk
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Blom, S
- Paavolainen, L
- Bychkov, D
- Turkki, R
- Maki-Teeri, P
- Hemmes, A
- visa fler...
- Valimaki, K
- Lundin, J
- Kallioniemi, O
- Pellinen, T
- visa färre...
- Artiklar i publikationen
- Scientific repor ...
- Av lärosätet
- Karolinska Institutet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
