Fine-mapping of prostate cancer susceptibility loci in a large meta-analysis identifies candidate causal variants

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: WFRF:(Tammela TLJ) > Cybulski C > Fine-mapping of pro...

Dadaev, T (författare)

Fine-mapping of prostate cancer susceptibility loci in a large meta-analysis identifies candidate causal variants

Artikel/kapitelEngelska2018

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2018-06-11
Springer Science and Business Media LLC,2018

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:prod.swepub.kib.ki.se:138464868
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:138464868URI
https://doi.org/10.1038/s41467-018-04109-8DOI
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-368171URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Prostate cancer is a polygenic disease with a large heritable component. A number of common, low-penetrance prostate cancer risk loci have been identified through GWAS. Here we apply the Bayesian multivariate variable selection algorithm JAM to fine-map 84 prostate cancer susceptibility loci, using summary data from a large European ancestry meta-analysis. We observe evidence for multiple independent signals at 12 regions and 99 risk signals overall. Only 15 original GWAS tag SNPs remain among the catalogue of candidate variants identified; the remainder are replaced by more likely candidates. Biological annotation of our credible set of variants indicates significant enrichment within promoter and enhancer elements, and transcription factor-binding sites, including AR, ERG and FOXA1. In 40 regions at least one variant is colocalised with an eQTL in prostate cancer tissue. The refined set of candidate variants substantially increase the proportion of familial relative risk explained by these known susceptibility regions, which highlights the importance of fine-mapping studies and has implications for clinical risk profiling.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Saunders, EJ (författare)
Newcombe, PJ (författare)
Anokian, E (författare)
Leongamornlert, DA (författare)
Brook, MN (författare)
Cieza-Borrella, C (författare)
Mijuskovic, M (författare)
Wakerell, S (författare)
Al Olama, AA (författare)
Schumacher, FR (författare)
Berndt, SI (författare)
Benlloch, S (författare)
Ahmed, M (författare)
Goh, C (författare)
Sheng, X (författare)
Zhang, Z (författare)
Muir, K (författare)
Govindasami, K (författare)
Lophatananon, A (författare)
Stevens, VL (författare)
Gapstur, SM (författare)
Carter, BD (författare)
Tangen, CM (författare)
Goodman, P (författare)
Thompson, IM (författare)
Batra, J (författare)
Chambers, S (författare)
Moya, L (författare)
Clements, J (författare)
Horvath, L (författare)
Tilley, W (författare)
Risbridger, G (författare)
Gronberg, HKarolinska Institutet (författare)
Aly, MKarolinska Institutet (författare)
Nordstrom, TKarolinska Institutet (författare)
Pharoah, P (författare)
Pashayan, N (författare)
Schleutker, J (författare)
Tammela, TLJ (författare)
Sipeky, C (författare)
Auvinen, A (författare)
Albanes, D (författare)
Weinstein, S (författare)
Wolk, AlicjaUppsala universitet,Karolinska Institutet,Ortopedi(Swepub:uu)alwol516 (författare)
Hakansson, NKarolinska Institutet (författare)
West, C (författare)
Dunning, AM (författare)
Burnet, N (författare)
Mucci, L (författare)
Giovannucci, E (författare)
Andriole, G (författare)
Cussenot, O (författare)
Cancel-Tassin, G (författare)
Koutros, S (författare)
Freeman, LEB (författare)
Sorensen, KD (författare)
Orntoft, TF (författare)
Borre, M (författare)
Maehle, L (författare)
Grindedal, EM (författare)
Neal, DE (författare)
Donovan, JL (författare)
Hamdy, FC (författare)
Martin, RM (författare)
Travis, RC (författare)
Key, TJ (författare)
Hamilton, RJ (författare)
Fleshner, NE (författare)
Finelli, A (författare)
Ingles, SA (författare)
Stern, MC (författare)
Rosenstein, B (författare)
Kerns, S (författare)
Ostrer, H (författare)
Lu, YJ (författare)
Zhang, HW (författare)
Feng, N (författare)
Mao, X (författare)
Guo, X (författare)
Wang, GM (författare)
Sun, Z (författare)
Giles, GG (författare)
Southey, MC (författare)
MacInnis, RJ (författare)
FitzGerald, LM (författare)
Kibel, AS (författare)
Drake, BF (författare)
Vega, A (författare)
Gomez-Caamano, A (författare)
Fachal, L (författare)
Szulkin, RKarolinska Institutet (författare)
Eklund, MKarolinska Institutet (författare)
Kogevinas, M (författare)
Llorca, J (författare)
Castano-Vinyals, G (författare)
Penney, KL (författare)
Stampfer, M (författare)
Park, JY (författare)
Sellers, TA (författare)
Lin, HY (författare)
Stanford, JL (författare)
Cybulski, C (författare)
Wokolorczyk, D (författare)
Lubinski, J (författare)
Ostrander, EA (författare)
Geybels, MS (författare)
Nordestgaard, BG (författare)
Nielsen, SF (författare)
Weisher, M (författare)
Bisbjerg, R (författare)
Roder, MA (författare)
Iversen, P (författare)
Brenner, H (författare)
Cuk, K (författare)
Holleczek, B (författare)
Maier, C (författare)
Luedeke, M (författare)
Schnoeller, T (författare)
Kim, J (författare)
Logothetis, CJ (författare)
John, EM (författare)
Teixeira, MR (författare)
Paulo, P (författare)
Cardoso, M (författare)
Neuhausen, SL (författare)
Steele, L (författare)
Ding, YC (författare)
De Ruyck, K (författare)
De Meerleer, G (författare)
Ost, P (författare)
Razack, A (författare)
Lim, J (författare)
Teo, SH (författare)
Lin, DW (författare)
Newcomb, LF (författare)
Lessel, D (författare)
Gamulin, M (författare)
Kulis, T (författare)
Kaneva, R (författare)
Usmani, N (författare)
Slavov, C (författare)
Mitev, V (författare)
Parliament, M (författare)
Singhal, S (författare)
Claessens, F (författare)
Joniau, S (författare)
Van den Broeck, T (författare)
Larkin, S (författare)
Townsend, PA (författare)
Aukim-Hastie, C (författare)
Gago-Dominguez, M (författare)
Castelao, JE (författare)
Martinez, ME (författare)
Roobol, MJ (författare)
Jenster, G (författare)
van Schaik, RHN (författare)
Menegaux, F (författare)
Truong, T (författare)
Koudou, YA (författare)
Xu, JF (författare)
Khaw, KT (författare)
Cannon-Albright, L (författare)
Pandha, H (författare)
Michael, A (författare)
Kierzek, A (författare)
Thibodeau, SN (författare)
McDonnell, SK (författare)
Schaid, DJ (författare)
Lindstrom, S (författare)
Turman, C (författare)
Ma, J (författare)
Hunter, DJ (författare)
Riboli, E (författare)
Siddiq, A (författare)
Canzian, F (författare)
Kolonel, LN (författare)
Le Marchand, L (författare)
Hoover, RN (författare)
Machiela, MJ (författare)
Kraft, P (författare)
Freedman, M (författare)
Wiklund, FKarolinska Institutet (författare)
Chanock, S (författare)
Henderson, BE (författare)
Easton, DF (författare)
Haiman, CA (författare)
Eeles, RA (författare)
Conti, DV (författare)
Kote-Jarai, Z (författare)
Karolinska InstitutetOrtopedi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature communications: Springer Science and Business Media LLC9:1, s. 2256-2041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature communications (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Dadaev, T; Saunders, EJ; Newcombe, PJ; Anokian, E; Leongamornlert, ...; Brook, MN; visa fler...; Cieza-Borrella, ...; Mijuskovic, M; Wakerell, S; Al Olama, AA; Schumacher, FR; Berndt, SI; Benlloch, S; Ahmed, M; Goh, C; Sheng, X; Zhang, Z; Muir, K; Govindasami, K; Lophatananon, A; Stevens, VL; Gapstur, SM; Carter, BD; Tangen, CM; Goodman, P; Thompson, IM; Batra, J; Chambers, S; Moya, L; Clements, J; Horvath, L; Tilley, W; Risbridger, G; Gronberg, H; Aly, M; Nordstrom, T; Pharoah, P; Pashayan, N; Schleutker, J; Tammela, TLJ; Sipeky, C; Auvinen, A; Albanes, D; Weinstein, S; Wolk, Alicja; Hakansson, N; West, C; Dunning, AM; Burnet, N; Mucci, L; Giovannucci, E; Andriole, G; Cussenot, O; Cancel-Tassin, G; Koutros, S; Freeman, LEB; Sorensen, KD; Orntoft, TF; Borre, M; Maehle, L; Grindedal, EM; Neal, DE; Donovan, JL; Hamdy, FC; Martin, RM; Travis, RC; Key, TJ; Hamilton, RJ; Fleshner, NE; Finelli, A; Ingles, SA; Stern, MC; Rosenstein, B; Kerns, S; Ostrer, H; Lu, YJ; Zhang, HW; Feng, N; Mao, X; Guo, X; Wang, GM; Sun, Z; Giles, GG; Southey, MC; MacInnis, RJ; FitzGerald, LM; Kibel, AS; Drake, BF; Vega, A; Gomez-Caamano, A; Fachal, L; Szulkin, R; Eklund, M; Kogevinas, M; Llorca, J; Castano-Vinyals, ...; Penney, KL; Stampfer, M; Park, JY; Sellers, TA; Lin, HY; Stanford, JL; Cybulski, C; Wokolorczyk, D; Lubinski, J; Ostrander, EA; Geybels, MS; Nordestgaard, BG; Nielsen, SF; Weisher, M; Bisbjerg, R; Roder, MA; Iversen, P; Brenner, H; Cuk, K; Holleczek, B; Maier, C; Luedeke, M; Schnoeller, T; Kim, J; Logothetis, CJ; John, EM; Teixeira, MR; Paulo, P; Cardoso, M; Neuhausen, SL; Steele, L; Ding, YC; De Ruyck, K; De Meerleer, G; Ost, P; Razack, A; Lim, J; Teo, SH; Lin, DW; Newcomb, LF; Lessel, D; Gamulin, M; Kulis, T; Kaneva, R; Usmani, N; Slavov, C; Mitev, V; Parliament, M; Singhal, S; Claessens, F; Joniau, S; Van den Broeck, ...; Larkin, S; Townsend, PA; Aukim-Hastie, C; Gago-Dominguez, ...; Castelao, JE; Martinez, ME; Roobol, MJ; Jenster, G; van Schaik, RHN; Menegaux, F; Truong, T; Koudou, YA; Xu, JF; Khaw, KT; Cannon-Albright, ...; Pandha, H; Michael, A; Kierzek, A; Thibodeau, SN; McDonnell, SK; Schaid, DJ; Lindstrom, S; Turman, C; Ma, J; Hunter, DJ; Riboli, E; Siddiq, A; Canzian, F; Kolonel, LN; Le Marchand, L; Hoover, RN; Machiela, MJ; Kraft, P; Freedman, M; Wiklund, F; Chanock, S; Henderson, BE; Easton, DF; Haiman, CA; Eeles, RA; Conti, DV; Kote-Jarai, Z; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Urologi och njur ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

Artiklar i publikationen: Nature communica ...

Av lärosätet: Karolinska Institutet; Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se