SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Wernersson A)
 

Sökning: WFRF:(Wernersson A) > iFISH is a publical...

  • Gelali, EKarolinska Institutet (författare)

iFISH is a publically available resource enabling versatile DNA FISH to study genome architecture

  • Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2019-04-09
  • Springer Science and Business Media LLC,2019

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:prod.swepub.kib.ki.se:140684173
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:140684173URI
  • https://doi.org/10.1038/s41467-019-09616-wDOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • DNA fluorescence in situ hybridization (DNA FISH) is a powerful method to study chromosomal organization in single cells. At present, there is a lack of free resources of DNA FISH probes and probe design tools which can be readily applied. Here, we describe iFISH, an open-source repository currently comprising 380 DNA FISH probes targeting multiple loci on the human autosomes and chromosome X, as well as a genome-wide database of optimally designed oligonucleotides and a freely accessible web interface (http://ifish4u.org) that can be used to design DNA FISH probes. We individually validate 153 probes and take advantage of our probe repository to quantify the extent of intermingling between multiple heterologous chromosome pairs, showing a much higher extent of intermingling in human embryonic stem cells compared to fibroblasts. In conclusion, iFISH is a versatile and expandable resource, which can greatly facilitate the use of DNA FISH in research and diagnostics.

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Girelli, GKarolinska Institutet (författare)
  • Matsumoto, M (författare)
  • Wernersson, EKarolinska Institutet (författare)
  • Custodio, J (författare)
  • Mota, AKarolinska Institutet (författare)
  • Schweitzer, MKarolinska Institutet (författare)
  • Ferenc, K (författare)
  • Li, XGKarolinska Institutet (författare)
  • Mirzazadeh, RKarolinska Institutet (författare)
  • Agostini, FKarolinska Institutet (författare)
  • Schell, JP (författare)
  • Lanner, FKarolinska Institutet (författare)
  • Crosetto, NKarolinska Institutet (författare)
  • Bienko, MKarolinska Institutet (författare)
  • Karolinska Institutet (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature communications: Springer Science and Business Media LLC10:1, s. 1636-2041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy