WFRF:(Alvarez Contino JE)
Sökning: WFRF:(Alvarez Contino JE) > (2020) > Pan-cancer analysis...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
- Rodriguez-Martin, BUniversity of Santiago de Compostela (författare)
Pan-cancer analysis of whole genomes identifies driver rearrangements promoted by LINE-1 retrotransposition
- Artikel/kapitelEngelska2020
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- 2020-02-05
- Springer Science and Business Media LLC,2020
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:prod.swepub.kib.ki.se:142904545
- http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:142904545URI
- https://doi.org/10.1038/s41588-019-0562-0DOI
- https://lup.lub.lu.se/record/2d5c311f-b39f-44a5-82d2-efba3c9160b6URI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- About half of all cancers have somatic integrations of retrotransposons. Here, to characterize their role in oncogenesis, we analyzed the patterns and mechanisms of somatic retrotransposition in 2,954 cancer genomes from 38 histological cancer subtypes within the framework of the Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) project. We identified 19,166 somatically acquired retrotransposition events, which affected 35% of samples and spanned a range of event types. Long interspersed nuclear element (LINE-1; L1 hereafter) insertions emerged as the first most frequent type of somatic structural variation in esophageal adenocarcinoma, and the second most frequent in head-and-neck and colorectal cancers. Aberrant L1 integrations can delete megabase-scale regions of a chromosome, which sometimes leads to the removal of tumor-suppressor genes, and can induce complex translocations and large-scale duplications. Somatic retrotranspositions can also initiate breakage–fusion–bridge cycles, leading to high-level amplification of oncogenes. These observations illuminate a relevant role of 22 L1 retrotransposition in remodeling the cancer genome, with potential implications for the development of human tumors.
Ämnesord och genrebeteckningar
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Medicinsk genetik hsv//swe
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Medical Genetics hsv//eng
- Carcinogenesis/genetics
- Gene Rearrangement/genetics
- Genome, Human/genetics
- Humans
- Long Interspersed Nucleotide Elements/genetics
- Neoplasms/genetics
- Retroelements/genetics
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Alvarez, EGUniversity of Santiago de Compostela (författare)
- Baez-Ortega, AUniversity of Cambridge (författare)
- Zamora, JUniversity of Santiago de Compostela (författare)
- Supek, FInstitute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona) (författare)
- Demeulemeester, JFrancis Crick Institute (författare)
- Santamarina, MUniversity of Santiago de Compostela (författare)
- Ju, YSKorea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST) (författare)
- Temes, JUniversity of Santiago de Compostela (författare)
- Garcia-Souto, DUniversity of Santiago de Compostela (författare)
- Detering, HUniversity of Vigo (författare)
- Li, YLWellcome Trust Sanger Institute (författare)
- Rodriguez-Castro, JUniversity of Santiago de Compostela (författare)
- Dueso-Barroso, AUniversity of Vic (författare)
- Bruzos, ALUniversity of Santiago de Compostela (författare)
- Dentro, SCFrancis Crick Institute (författare)
- Blanco, MGUniversity of Santiago de Compostela,Yale University (författare)
- Contino, GUniversity of Cambridge (författare)
- Ardeljan, DJohns Hopkins University (författare)
- Tojo, MUniversity of Vigo (författare)
- Roberts, NDWellcome Trust Sanger Institute (författare)
- Zumalave, SUniversity of Santiago de Compostela (författare)
- Edwards, PAWUniversity of Cambridge (författare)
- Weischenfeldt, JEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
- Puiggros, MCentro Nacional de Supercomputación (författare)
- Chong, ZCUniversity of Texas (författare)
- Chen, KUniversity of Texas MD Anderson Cancer Center (författare)
- Lee, EAHarvard Medical School (författare)
- Wala, JABroad Institute (författare)
- Raine, KWellcome Trust Sanger Institute (författare)
- Butler, AWellcome Trust Sanger Institute (författare)
- Waszak, SMEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
- Navarro, FCPYale University (författare)
- Schumacher, SEBroad Institute (författare)
- Monlong, JMcGill University,University of Santiago de Compostela (författare)
- Maura, FWellcome Trust Sanger Institute (författare)
- Bolli, NUniversity of Milan (författare)
- Bourque, GMcGill University (författare)
- Gerstein, M (författare)
- Park, PJHarvard Medical School (författare)
- Wedge, DCWellcome Trust Sanger Institute (författare)
- Beroukhim, RBroad Institute (författare)
- Torrents, DCatalan Institution for Research and Advanced Studies (författare)
- Korbel, JOEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg (författare)
- Martincorena, IWellcome Trust Sanger Institute (författare)
- Fitzgerald, RCUniversity of Cambridge (författare)
- Van Loo, PFrancis Crick Institute (författare)
- Kazazian, HHJohns Hopkins University (författare)
- Burns, KHJohns Hopkins University (författare)
- Campbell, PJWellcome Trust Sanger Institute (författare)
- Tubio, JMC (författare)
- Akdemir, KC (författare)
- Boutros, PC (författare)
- Bowtell, DDL (författare)
- Brors, B (författare)
- Chan, K (författare)
- Cortes-Ciriano, I (författare)
- Dunford, AJ (författare)
- Edwards, PA (författare)
- Estivill, X (författare)
- Etemadmoghadam, D (författare)
- Feuerbach, L (författare)
- Fink, JL (författare)
- Frenkel-Morgenstern, M (författare)
- Garsed, DW (författare)
- Gordenin, DA (författare)
- Haan, D (författare)
- Haber, JE (författare)
- Hess, JM (författare)
- Hutter, B (författare)
- Imielinski, M (författare)
- Jones, DTW (författare)
- Kazanov, MD (författare)
- Klimczak, LJ (författare)
- Koh, Y (författare)
- Kumar, K (författare)
- Lee, JJK (författare)
- Lynch, AG (författare)
- Macintyre, G (författare)
- Markowetz, F (författare)
- Martinez-Fundichely, A (författare)
- Meyerson, M (författare)
- Miyano, S (författare)
- Nakagawa, H (författare)
- Ossowski, S (författare)
- Pearson, JV (författare)
- Rippe, K (författare)
- Roberts, SA (författare)
- Scully, R (författare)
- Shackleton, M (författare)
- Sidiropoulos, N (författare)
- Sieverling, L (författare)
- Stewart, C (författare)
- Villasante, I (författare)
- Waddell, N (författare)
- Yang, LX (författare)
- Yao, XT (författare)
- Yoon, SS (författare)
- Zhang, CZ (författare)
- Borg, ÅkeLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Familjär bröstcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Familial Breast Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments(Swepub:lu)onk-abo (creator_code:cre_t)
- Ringnér, MarkusLund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science(Swepub:lu)thep-mri (creator_code:cre_t)
- Staaf, JohanLund University,Lunds universitet,Avdelningen för translationell cancerforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Division of Translational Cancer Research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund(Swepub:lu)onk-jst (creator_code:cre_t)
- University of Santiago de CompostelaUniversity of Cambridge (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:Nature genetics: Springer Science and Business Media LLC52:3, s. 306-+1546-17181061-4036
Internetlänk
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Rodriguez-Martin ...
- Alvarez, EG
- Baez-Ortega, A
- Zamora, J
- Supek, F
- Demeulemeester, ...
- visa fler...
- Santamarina, M
- Ju, YS
- Temes, J
- Garcia-Souto, D
- Detering, H
- Li, YL
- Rodriguez-Castro ...
- Dueso-Barroso, A
- Bruzos, AL
- Dentro, SC
- Blanco, MG
- Contino, G
- Ardeljan, D
- Tojo, M
- Roberts, ND
- Zumalave, S
- Edwards, PAW
- Weischenfeldt, J
- Puiggros, M
- Chong, ZC
- Chen, K
- Lee, EA
- Wala, JA
- Raine, K
- Butler, A
- Waszak, SM
- Navarro, FCP
- Schumacher, SE
- Monlong, J
- Maura, F
- Bolli, N
- Bourque, G
- Gerstein, M
- Park, PJ
- Wedge, DC
- Beroukhim, R
- Torrents, D
- Korbel, JO
- Martincorena, I
- Fitzgerald, RC
- Van Loo, P
- Kazazian, HH
- Burns, KH
- Campbell, PJ
- Tubio, JMC
- Akdemir, KC
- Boutros, PC
- Bowtell, DDL
- Brors, B
- Chan, K
- Cortes-Ciriano, ...
- Dunford, AJ
- Edwards, PA
- Estivill, X
- Etemadmoghadam, ...
- Feuerbach, L
- Fink, JL
- Frenkel-Morgenst ...
- Garsed, DW
- Gordenin, DA
- Haan, D
- Haber, JE
- Hess, JM
- Hutter, B
- Imielinski, M
- Jones, DTW
- Kazanov, MD
- Klimczak, LJ
- Koh, Y
- Kumar, K
- Lee, JJK
- Lynch, AG
- Macintyre, G
- Markowetz, F
- Martinez-Fundich ...
- Meyerson, M
- Miyano, S
- Nakagawa, H
- Ossowski, S
- Pearson, JV
- Rippe, K
- Roberts, SA
- Scully, R
- Shackleton, M
- Sidiropoulos, N
- Sieverling, L
- Stewart, C
- Villasante, I
- Waddell, N
- Yang, LX
- Yao, XT
- Yoon, SS
- Zhang, CZ
- Borg, Åke
- Ringnér, Markus
- Staaf, Johan
- visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Medicinska och f ...
- och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
- Nature genetics
- Av lärosätet
- Karolinska Institutet
- Lunds universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
