SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Lennartsson A.)
 

Sökning: WFRF:(Lennartsson A.) > Functional annotati...

  • Ramilowski, JA (författare)

Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping

  • Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2020-07-27
  • Cold Spring Harbor Laboratory,2020

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:prod.swepub.kib.ki.se:144290843
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:144290843URI
  • https://doi.org/10.1101/gr.254219.119DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Long noncoding RNAs (lncRNAs) constitute the majority of transcripts in the mammalian genomes, and yet, their functions remain largely unknown. As part of the FANTOM6 project, we systematically knocked down the expression of 285 lncRNAs in human dermal fibroblasts and quantified cellular growth, morphological changes, and transcriptomic responses using Capped Analysis of Gene Expression (CAGE). Antisense oligonucleotides targeting the same lncRNAs exhibited global concordance, and the molecular phenotype, measured by CAGE, recapitulated the observed cellular phenotypes while providing additional insights on the affected genes and pathways. Here, we disseminate the largest-to-date lncRNA knockdown data set with molecular phenotyping (over 1000 CAGE deep-sequencing libraries) for further exploration and highlight functional roles for ZNF213-AS1 and lnc-KHDC3L-2.

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Yip, CW (författare)
  • Agrawal, S (författare)
  • Chang, JC (författare)
  • Ciani, Y (författare)
  • Kulakovskiy, IV (författare)
  • Mendez, M (författare)
  • Ooi, JL (författare)
  • Ouyang, JF (författare)
  • Parkinson, N (författare)
  • Petri, A (författare)
  • Roos, L (författare)
  • Severin, J (författare)
  • Yasuzawa, K (författare)
  • Abugessaisa, I (författare)
  • Akalin, A (författare)
  • Antonov, IV (författare)
  • Arner, E (författare)
  • Bonetti, A (författare)
  • Bono, H (författare)
  • Borsari, B (författare)
  • Brombacher, F (författare)
  • Cameron, CJF (författare)
  • Cannistraci, CV (författare)
  • Cardenas, R (författare)
  • Cardon, M (författare)
  • Chang, HW (författare)
  • Dostie, J (författare)
  • Ducoli, L (författare)
  • Favorov, A (författare)
  • Fort, A (författare)
  • Garrido, D (författare)
  • Gil, N (författare)
  • Gimenez, J (författare)
  • Guler, R (författare)
  • Handoko, L (författare)
  • Harshbarger, J (författare)
  • Hasegawa, A (författare)
  • Hasegawa, Y (författare)
  • Hashimoto, K (författare)
  • Hayatsu, N (författare)
  • Heutink, P (författare)
  • Hirose, T (författare)
  • Imada, EL (författare)
  • Itoh, M (författare)
  • Kaczkowski, B (författare)
  • Kanhere, A (författare)
  • Kawabata, E (författare)
  • Kawaji, H (författare)
  • Kawashima, T (författare)
  • Kelly, ST (författare)
  • Kojima, M (författare)
  • Kondo, N (författare)
  • Koseki, H (författare)
  • Kouno, T (författare)
  • Kratz, A (författare)
  • Kurowska-Stolarska, M (författare)
  • Kwon, ATJ (författare)
  • Leek, J (författare)
  • Lennartsson, AKarolinska Institutet (författare)
  • Lizio, M (författare)
  • Lopez-Redondo, F (författare)
  • Luginbuhl, J (författare)
  • Maeda, S (författare)
  • Makeev, VJ (författare)
  • Marchionni, L (författare)
  • Medvedeva, YA (författare)
  • Minoda, A (författare)
  • Muller, F (författare)
  • Munoz-Aguirre, M (författare)
  • Murata, M (författare)
  • Nishiyori, H (författare)
  • Nitta, KR (författare)
  • Noguchi, S (författare)
  • Noro, Y (författare)
  • Nurtdinov, R (författare)
  • Okazaki, Y (författare)
  • Orlando, V (författare)
  • Paquette, D (författare)
  • Parr, CJC (författare)
  • Rackham, OJL (författare)
  • Rizzu, P (författare)
  • Martinez, DFS (författare)
  • Sandelin, A (författare)
  • Sanjana, P (författare)
  • Semple, CAM (författare)
  • Shibayama, Y (författare)
  • Sivaraman, DM (författare)
  • Suzuki, T (författare)
  • Szumowski, SC (författare)
  • Tagami, M (författare)
  • Taylor, MS (författare)
  • Terao, C (författare)
  • Thodberg, M (författare)
  • Thongjuea, S (författare)
  • Tripathi, V (författare)
  • Ulitsky, I (författare)
  • Verardo, R (författare)
  • Vorontsov, IE (författare)
  • Yamamoto, C (författare)
  • Young, RS (författare)
  • Baillie, JK (författare)
  • Forrest, ARR (författare)
  • Guigo, R (författare)
  • Hoffman, MM (författare)
  • Hon, CC (författare)
  • Kasukawa, T (författare)
  • Kauppinen, S (författare)
  • Kere, JKarolinska Institutet (författare)
  • Lenhard, B (författare)
  • Schneider, C (författare)
  • Suzuki, H (författare)
  • Yagi, K (författare)
  • de Hoon, MJL (författare)
  • Shin, JW (författare)
  • Carninci, P (författare)
  • Karolinska Institutet (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Genome research: Cold Spring Harbor Laboratory30:7, s. 1060-10721549-54691088-9051

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy